RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
ACTB-209ENST00000473257 WDR17Q8IZU2 1322 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-209ENST00000473257 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
ACTB-209ENST00000473257 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-209ENST00000473257 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-209ENST00000473257 OVOS2Q6IE36 1432 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTB-209ENST00000473257 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-209ENST00000473257 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
ACTB-209ENST00000473257 SBF2Q86WG5 1849 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-209ENST00000473257 AKAP12Q02952 1782 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-209ENST00000473257 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
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ACTB-209ENST00000473257 NME9Q86XW9 330 aa16.04■□□□□ 0.16
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ACTB-209ENST00000473257 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
ACTB-209ENST00000473257 SPON1Q9HCB6 807 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-209ENST00000473257 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
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ACTB-209ENST00000473257 CD163L1Q9NR16 1453 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-209ENST00000473257 PLSCR1O15162 318 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-209ENST00000473257 ZBTB7AO95365 584 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-209ENST00000473257 ACSBG1Q96GR2 724 aa16■□□□□ 0.15
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ACTB-209ENST00000473257 LTN1O94822 1766 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-209ENST00000473257 A0A1W2PP64 1363 aa15.93■□□□□ 0.14
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ACTB-209ENST00000473257 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
ACTB-209ENST00000473257 USP54Q70EL1 1684 aa15.89■□□□□ 0.13
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ACTB-209ENST00000473257 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-209ENST00000473257 TESK2Q96S53 571 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-209ENST00000473257 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
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ACTB-209ENST00000473257 MAP3K19Q56UN5 1328 aa15.85■□□□□ 0.13
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ACTB-209ENST00000473257 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
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ACTB-209ENST00000473257 ARXQ96QS3 562 aa15.8■□□□□ 0.12
ACTB-209ENST00000473257 GGNBP2Q9H3C7 697 aa15.8■□□□□ 0.12
ACTB-209ENST00000473257 KLHL34Q8N239 644 aa15.79■□□□□ 0.12
ACTB-209ENST00000473257 AKT1S1Q96B36 256 aa15.79■□□□□ 0.12
ACTB-209ENST00000473257 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
ACTB-209ENST00000473257 NBPF6Q5VWK0 638 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-209ENST00000473257 NBPF4Q96M43 638 aa15.78■□□□□ 0.12
ACTB-209ENST00000473257 DOT1LQ8TEK3 1739 aa15.77■□□□□ 0.12
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