RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
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HOXD8-202ENST00000429017 V9GY48 417 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HOXD8-202ENST00000429017 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXD8-202ENST00000429017 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXD8-202ENST00000429017 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
HOXD8-202ENST00000429017 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
HOXD8-202ENST00000429017 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
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