RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428445.1

VARS-216, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 5

Gene VARS, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-216ENST00000428445 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
VARS-216ENST00000428445 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
VARS-216ENST00000428445 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.69■■□□□ 1.38
VARS-216ENST00000428445 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.68■■□□□ 1.38
VARS-216ENST00000428445 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.68■■□□□ 1.38
VARS-216ENST00000428445 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
VARS-216ENST00000428445 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.68■■□□□ 1.38
VARS-216ENST00000428445 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.68■■□□□ 1.38
VARS-216ENST00000428445 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.67■■□□□ 1.38
VARS-216ENST00000428445 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.66■■□□□ 1.38
VARS-216ENST00000428445 WNK3Q9BYP7 1800 aa23.66■■□□□ 1.38
VARS-216ENST00000428445 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
VARS-216ENST00000428445 PROM2Q8N271 834 aa23.64■■□□□ 1.37
VARS-216ENST00000428445 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
VARS-216ENST00000428445 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
VARS-216ENST00000428445 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.63■■□□□ 1.37
VARS-216ENST00000428445 PLSCR1O15162 318 aa23.63■■□□□ 1.37
VARS-216ENST00000428445 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.63■■□□□ 1.37
VARS-216ENST00000428445 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
VARS-216ENST00000428445 NFAT5O94916 1531 aa23.61■■□□□ 1.37
VARS-216ENST00000428445 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
VARS-216ENST00000428445 KCNQ2O43526 872 aa23.61■■□□□ 1.37
VARS-216ENST00000428445 NME9Q86XW9 330 aa23.61■■□□□ 1.37
VARS-216ENST00000428445 TMC1Q8TDI8 760 aa23.6■■□□□ 1.37
VARS-216ENST00000428445 SPON1Q9HCB6 807 aa23.6■■□□□ 1.37
VARS-216ENST00000428445 EXOC5O00471 708 aa23.59■■□□□ 1.37
VARS-216ENST00000428445 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.59■■□□□ 1.37
VARS-216ENST00000428445 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.59■■□□□ 1.37
VARS-216ENST00000428445 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
VARS-216ENST00000428445 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
VARS-216ENST00000428445 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.58■■□□□ 1.37
VARS-216ENST00000428445 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.57■■□□□ 1.36
VARS-216ENST00000428445 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.55■■□□□ 1.36
VARS-216ENST00000428445 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
VARS-216ENST00000428445 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.55■■□□□ 1.36
VARS-216ENST00000428445 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.54■■□□□ 1.36
VARS-216ENST00000428445 TXNRD1Q16881 649 aa23.54■■□□□ 1.36
VARS-216ENST00000428445 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.54■■□□□ 1.36
VARS-216ENST00000428445 ZBTB7AO95365 584 aa23.53■■□□□ 1.36
VARS-216ENST00000428445 USP31Q70CQ4 1352 aa23.52■■□□□ 1.36
VARS-216ENST00000428445 LTN1O94822 1766 aa23.52■■□□□ 1.36
VARS-216ENST00000428445 CCDC7Q96M83 1385 aa23.52■■□□□ 1.36
VARS-216ENST00000428445 BCL9O00512 1426 aa23.51■■□□□ 1.35
VARS-216ENST00000428445 CASZ1Q86V15 1759 aa23.51■■□□□ 1.35
VARS-216ENST00000428445 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
VARS-216ENST00000428445 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.5■■□□□ 1.35
VARS-216ENST00000428445 ERBB3P21860 1342 aa23.5■■□□□ 1.35
VARS-216ENST00000428445 YY1P25490 414 aa23.49■■□□□ 1.35
VARS-216ENST00000428445 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
VARS-216ENST00000428445 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.49■■□□□ 1.35
VARS-216ENST00000428445 TNS2Q63HR2 1409 aa23.48■■□□□ 1.35
VARS-216ENST00000428445 FBLN1P23142 703 aa23.47■■□□□ 1.35
VARS-216ENST00000428445 STK32BQ9NY57 414 aa23.47■■□□□ 1.35
VARS-216ENST00000428445 A0A1W2PP64 1363 aa23.46■■□□□ 1.35
VARS-216ENST00000428445 IL2RBP14784 551 aa23.46■■□□□ 1.35
VARS-216ENST00000428445 SLC15A2Q16348 729 aa23.46■■□□□ 1.35
VARS-216ENST00000428445 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
VARS-216ENST00000428445 USP54Q70EL1 1684 aa23.45■■□□□ 1.34
VARS-216ENST00000428445 PTGER2P43116 358 aa23.45■■□□□ 1.34
VARS-216ENST00000428445 TONSLQ96HA7 1378 aa23.44■■□□□ 1.34
VARS-216ENST00000428445 ABCC6O95255 1503 aa23.43■■□□□ 1.34
VARS-216ENST00000428445 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
VARS-216ENST00000428445 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.42■■□□□ 1.34
VARS-216ENST00000428445 MYOM1P52179 1685 aa23.42■■□□□ 1.34
VARS-216ENST00000428445 NHSQ6T4R5 1651 aa23.42■■□□□ 1.34
VARS-216ENST00000428445 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.42■■□□□ 1.34
VARS-216ENST00000428445 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.41■■□□□ 1.34
VARS-216ENST00000428445 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
VARS-216ENST00000428445 TESK2Q96S53 571 aa23.4■■□□□ 1.34
VARS-216ENST00000428445 BTAF1O14981 1849 aa23.39■■□□□ 1.33
VARS-216ENST00000428445 IP6K1Q92551 441 aa23.39■■□□□ 1.33
VARS-216ENST00000428445 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.38■■□□□ 1.33
VARS-216ENST00000428445 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.38■■□□□ 1.33
VARS-216ENST00000428445 ZNF827Q17R98 1081 aa23.36■■□□□ 1.33
VARS-216ENST00000428445 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
VARS-216ENST00000428445 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.35■■□□□ 1.33
VARS-216ENST00000428445 KCNQ4P56696 695 aa23.35■■□□□ 1.33
VARS-216ENST00000428445 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
VARS-216ENST00000428445 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.34■■□□□ 1.33
VARS-216ENST00000428445 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.34■■□□□ 1.33
VARS-216ENST00000428445 MTFR1LQ9H019 292 aa23.34■■□□□ 1.33
VARS-216ENST00000428445 HOXC9P31274 260 aa23.33■■□□□ 1.33
VARS-216ENST00000428445 COG3Q96JB2 828 aa23.33■■□□□ 1.33
VARS-216ENST00000428445 SYT17Q9BSW7 474 aa23.33■■□□□ 1.33
VARS-216ENST00000428445 UTRNP46939 3433 aa23.33■■□□□ 1.32
VARS-216ENST00000428445 PAPPAQ13219 1627 aa23.32■■□□□ 1.32
VARS-216ENST00000428445 AMPHP49418 695 aa23.31■■□□□ 1.32
VARS-216ENST00000428445 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
VARS-216ENST00000428445 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
VARS-216ENST00000428445 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
VARS-216ENST00000428445 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.28■■□□□ 1.32
VARS-216ENST00000428445 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.28■■□□□ 1.32
VARS-216ENST00000428445 AKT1S1Q96B36 256 aa23.27■■□□□ 1.32
VARS-216ENST00000428445 ARXQ96QS3 562 aa23.27■■□□□ 1.32
VARS-216ENST00000428445 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
VARS-216ENST00000428445 FYB1O15117 783 aa23.25■■□□□ 1.31
VARS-216ENST00000428445 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.25■■□□□ 1.31
VARS-216ENST00000428445 NBPF4Q96M43 638 aa23.25■■□□□ 1.31
VARS-216ENST00000428445 MEGF6O75095 1541 aa23.24■■□□□ 1.31
VARS-216ENST00000428445 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
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