RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421462.5

PKP4-204, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 3,099 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-204ENST00000421462 ST18O60284 1047 aa20.41■□□□□ 0.86
PKP4-204ENST00000421462 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PKP4-204ENST00000421462 PLCB2Q00722 1185 aa20.41■□□□□ 0.86
PKP4-204ENST00000421462 USP26Q9BXU7 913 aa20.41■□□□□ 0.86
PKP4-204ENST00000421462 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.4■□□□□ 0.86
PKP4-204ENST00000421462 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
PKP4-204ENST00000421462 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.4■□□□□ 0.86
PKP4-204ENST00000421462 ZDHHC9Q9Y397 364 aa20.4■□□□□ 0.86
PKP4-204ENST00000421462 VAMP4O75379 141 aa20.4■□□□□ 0.86
PKP4-204ENST00000421462 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.39■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 PDLIM2Q96JY6 352 aa20.39■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.38■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 FYB1O15117 783 aa20.38■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 MAP7D2Q96T17 732 aa20.38■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.38■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 NEK4P51957 841 aa20.38■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 CLEC17AQ6ZS10 378 aa20.38■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 DCTN1Q14203 1278 aa20.37■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 TTC22Q5TAA0 569 aa20.37■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 SDSP20132 328 aa20.37■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.37■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 A0A1W2PP64 1363 aa20.37■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa20.37■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 TSHZ3Q63HK5 1081 aa20.36■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa20.36■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 HS1BP3Q53T59 392 aa20.36■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.36■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 SASS6Q6UVJ0 657 aa20.35■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 IL16Q14005 1332 aa20.35■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 FAM83GA6ND36 823 aa20.35■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.35■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 CASC1Q6TDU7 716 aa20.35■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 DYNC1I1O14576 645 aa20.34■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 TERF1P54274 439 aa20.34■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 MBIPQ9NS73 344 aa20.34■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.852e-7■□□□□ 8.8
PKP4-204ENST00000421462 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 CBX1P83916 185 aa20.33■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.32■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 KRT24Q2M2I5 525 aa20.32■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 QRICH2Q9H0J4 1663 aa20.32■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 MYOM2P54296 1465 aa20.31■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 ABCC1P33527 1531 aa20.31■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 DTNBO60941 627 aa20.31■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 TSPY26PQ9H489 355 aa20.31■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20.31■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 USP25Q9UHP3 1055 aa20.3■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.3■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 KIF1BO60333 1816 aa20.3■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 PLEKHG5O94827 1062 aa20.3■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 TET3O43151 1660 aa20.29■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 SHROOM2Q13796 1616 aa20.29■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 ADGRB2O60241 1585 aa20.29■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 TMX3Q96JJ7 454 aa20.29■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.29■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 FCHSD2O94868 740 aa20.28■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 DCTPP1Q9H773 170 aa20.28■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 MROH2AA6NES4 1674 aa20.28■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 CABP1Q9NZU7 370 aa20.28■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 ADGRL1O94910 1474 aa20.27■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 REC8O95072 547 aa20.27■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 GNAI1P63096 354 aa20.27■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 NSD2O96028 1365 aa20.27■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.27■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 NFE2L2Q16236 605 aa20.26■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.26■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 IGSF3O75054 1194 aa20.26■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.25■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 PRAM1Q96QH2 718 aa20.25■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.25■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 ERC2O15083 957 aa20.25■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 ABCC4O15439 1325 aa20.25■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 MBD3O95983 291 aa20.25■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 ARHGAP45Q92619 1136 aa20.24■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 RILPL2Q969X0 211 aa20.24■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 MCM5P33992 734 aa20.24■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 MEIS3Q99687 375 aa20.24■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.24■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.23■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 PALD1Q9ULE6 856 aa20.23■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 MED14O60244 1454 aa20.22■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.1 ms