RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421462.5

PKP4-204, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 3,099 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-204ENST00000421462 ST18O60284 1047 aa20.41■□□□□ 0.86
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PKP4-204ENST00000421462 USP26Q9BXU7 913 aa20.41■□□□□ 0.86
PKP4-204ENST00000421462 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.4■□□□□ 0.86
PKP4-204ENST00000421462 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
PKP4-204ENST00000421462 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.4■□□□□ 0.86
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PKP4-204ENST00000421462 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
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PKP4-204ENST00000421462 A0A1W2PP64 1363 aa20.37■□□□□ 0.85
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PKP4-204ENST00000421462 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.35■□□□□ 0.85
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PKP4-204ENST00000421462 DYNC1I1O14576 645 aa20.34■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 TERF1P54274 439 aa20.34■□□□□ 0.85
PKP4-204ENST00000421462 MBIPQ9NS73 344 aa20.34■□□□□ 0.85
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PKP4-204ENST00000421462 KRT24Q2M2I5 525 aa20.32■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 QRICH2Q9H0J4 1663 aa20.32■□□□□ 0.84
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PKP4-204ENST00000421462 ADGRL1O94910 1474 aa20.27■□□□□ 0.84
PKP4-204ENST00000421462 REC8O95072 547 aa20.27■□□□□ 0.84
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PKP4-204ENST00000421462 NSD2O96028 1365 aa20.27■□□□□ 0.83
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PKP4-204ENST00000421462 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.26■□□□□ 0.83
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PKP4-204ENST00000421462 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
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PKP4-204ENST00000421462 MEIS3Q99687 375 aa20.24■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.24■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.23■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 PALD1Q9ULE6 856 aa20.23■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 MED14O60244 1454 aa20.22■□□□□ 0.83
PKP4-204ENST00000421462 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
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