RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 NBPF8Q3BBV2 869 aa5.41□□□□□ -1.54
ANKRD28-202ENST00000412318 CLUAP1Q96AJ1 413 aa5.41□□□□□ -1.54
ANKRD28-202ENST00000412318 RCAN3Q9UKA8 241 aa5.41□□□□□ -1.54
ANKRD28-202ENST00000412318 MED14O60244 1454 aa5.41□□□□□ -1.54
ANKRD28-202ENST00000412318 E9PSI1 815 aa5.41□□□□□ -1.54
ANKRD28-202ENST00000412318 RDXP35241 583 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
ANKRD28-202ENST00000412318 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
ANKRD28-202ENST00000412318 KIF6Q6ZMV9 814 aa5.41□□□□□ -1.54
ANKRD28-202ENST00000412318 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa5.41□□□□□ -1.54
ANKRD28-202ENST00000412318 VPS37DQ86XT2 251 aa5.41□□□□□ -1.54
ANKRD28-202ENST00000412318 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
ANKRD28-202ENST00000412318 PRKAR2BP31323 418 aa5.4□□□□□ -1.54
ANKRD28-202ENST00000412318 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
ANKRD28-202ENST00000412318 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
ANKRD28-202ENST00000412318 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
ANKRD28-202ENST00000412318 TAOK2Q9UL54 1235 aa5.4□□□□□ -1.54
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC7Q96M83 1385 aa5.4□□□□□ -1.54
ANKRD28-202ENST00000412318 ITSN2Q9NZM3 1697 aa5.4□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 NEURL4Q96JN8 1562 aa5.4□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 TPM4P67936 248 aa5.4□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 IL27Q8NEV9 243 aa5.4□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 MCCP23508 829 aa5.39□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 FBXW7Q969H0 707 aa5.39□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 A2ML1A8K2U0 1454 aa5.39□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM177BA6PVY3 158 aa5.39□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 USP8P40818 1118 aa5.39□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 TMOD3Q9NYL9 352 aa5.39□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa5.39□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC34Q96HJ3 373 aa5.39□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 ACEP12821 1306 aa5.38□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 KDM5DQ9BY66 1539 aa5.38□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 CHRNA2Q15822 529 aa5.38□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 TRIM34Q9BYJ4 488 aa5.38□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 STARD3NLO95772 234 aa5.38□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 CDR1P51861 262 aa5.38□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 AMOTQ4VCS5 1084 aa5.38□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 TPM3P06753 285 aa5.38□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC30Q5VVM6 783 aa5.38□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa5.38□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 NME9Q86XW9 330 aa5.38□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 ACBD3Q9H3P7 528 aa5.38□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 PCDH10Q9P2E7 1040 aa5.38□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 PHF14O94880 888 aa5.37□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC70Q6NSX1 233 aa5.37□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 BCL2L13Q9BXK5 485 aa5.37□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 TSPYL1Q9H0U9 437 aa5.37□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 AMOTL1Q8IY63 956 aa5.37□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM13BQ9NYF5 915 aa5.37□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 SLAIN2Q9P270 581 aa5.37□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 ATP7AQ04656 1500 aa5.37□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 PPP2R1AP30153 589 aa5.37□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 PSMD1Q99460 953 aa5.37□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 ZRANB1Q9UGI0 708 aa5.37□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa5.37□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 TPM2P07951 284 aa5.37□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 GSE1Q14687 1217 aa5.37□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 NBPF14Q5TI25 921 aa5.37□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa5.37□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa5.37□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 TCP11L2Q8N4U5 519 aa5.37□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 TOMM22Q9NS69 142 aa5.37□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 MLH3Q9UHC1 1453 aa5.36□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 TTC21AQ8NDW8 1320 aa5.36□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 ZPR1O75312 459 aa5.36□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP5.36□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa5.36□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 DEF6Q9H4E7 631 aa5.36□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 NSD3Q9BZ95 1437 aa5.36□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 DCTN1Q14203 1278 aa5.36□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 DDB1Q16531 1140 aa5.36□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF652Q9Y2D9 606 aa5.36□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 SHPRHQ149N8 1683 aa5.35□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 BTBD11A6QL63 1104 aa5.35□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 H0YHG0 523 aa5.35□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 RRP9O43818 475 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM43AQ8N2R8 423 aa5.35□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 ANKRD24Q8TF21 1146 aa5.35□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 NWD1Q149M9 1564 aa5.35□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 FCHSD2O94868 740 aa5.35□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM2Q9UHN6 1383 aa5.35□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 NINLQ9Y2I6 1382 aa5.35□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 KIF16BQ96L93 1317 aa5.35□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 GNAT3A8MTJ3 354 aa5.35□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC125Q86Z20 511 aa5.35□□□□□ -1.55
ANKRD28-202ENST00000412318 IFNL2Q8IZJ0 200 aa5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms