RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362804.1

RNU6-862P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 862, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-862P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-862P-201ENST00000362804 CARD14Q9BXL6 1004 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 USP17L5A8MUK1 530 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 ATP1A2P50993 1020 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 SH3BP2P78314 561 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 TRIM32Q13049 653 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 EML3Q32P44 896 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 LINC01559Q495D7 138 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 ERFEQ4G0M1 354 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 IFFO2Q5TF58 517 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 PHTF2Q8N3S3 785 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 PLPP7Q8NBV4 271 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 RETREG2Q8NC44 543 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 FOXJ1Q92949 421 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 CHIC2Q9UKJ5 165 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 NOD1Q9Y239 953 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 USP17L3A6NCW0 530 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 USP17L4A6NCW7 530 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 USP4Q13107 963 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 PPP1R18Q6NYC8 613 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 USP17L2Q6R6M4 530 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 USP17L1Q7RTZ2 530 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 OCSTAMPQ9BR26 566 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 DOLKQ9UPQ8 538 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-862P-201ENST00000362804 FAM196BA6NMK8 535 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 ESPNB1AK53 854 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 PIK3CDO00329 1044 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 BRD1O95696 1058 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 MYCP01106 439 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 RASA1P20936 1047 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 CDCA8Q53HL2 280 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 MPNDQ8N594 471 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 EHBP1Q8NDI1 1231 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 KCNA1Q09470 495 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 NCOA4Q13772 614 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 C4orf48Q5BLP8 95 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 TRAF7Q6Q0C0 670 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 LARGE2Q8N3Y3 721 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 FAM200AQ8TCP9 573 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 USP17L15C9J2P7 530 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 USP17L10C9JJH3 530 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 USP17L13C9JLJ4 530 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 USP17L12C9JPN9 530 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 USP17L11C9JVI0 530 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 USP17L21D6R901 530 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 USP17L18D6R9N7 530 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 USP17L22D6RA61 530 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 USP17L17D6RBQ6 530 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 USP17L19D6RCP7 530 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 USP17L20D6RJB6 530 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 WNT7AO00755 349 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 SLC19A1P41440 591 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 USP17L24Q0WX57 530 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 ARID5BQ14865 1188 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 OXLD1Q5BKU9 147 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 AEBP1Q8IUX7 1158 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 ANKMY2Q8IV38 441 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 DEPDC4Q8N2C3 294 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 OGFOD1Q8N543 542 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 CDK15Q96Q40 435 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 SEC13P55735 322 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 GTF2IP78347 998 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 SKOR1P84550 965 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 NR5A1Q13285 461 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 PTK7Q13308 1070 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 SWI5Q1ZZU3 235 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 PLA2G2CQ5R387 149 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 LIAT1Q6ZQX7 453 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 PODXL2Q9NZ53 605 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 ADH1CP00326 375 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 MYT1Q01538 1121 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 PSME1Q06323 249 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 DPYDQ12882 1025 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 TSGA10IPQ3SY00 556 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 CCDC102BQ68D86 513 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-862P-201ENST00000362804 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 134.8 ms