RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354241.5

TRIM4-202, Transcript of tripartite motif containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM4, Length 1,942 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4-202ENST00000354241 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.99■■□□□ 1.91
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TRIM4-202ENST00000354241 NEFMP07197 916 aa26.98■■□□□ 1.91
TRIM4-202ENST00000354241 PXDNQ92626 1479 aa26.98■■□□□ 1.91
TRIM4-202ENST00000354241 HOXC9P31274 260 aa26.98■■□□□ 1.91
TRIM4-202ENST00000354241 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.97■■□□□ 1.91
TRIM4-202ENST00000354241 USP19O94966 1318 aa26.97■■□□□ 1.91
TRIM4-202ENST00000354241 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
TRIM4-202ENST00000354241 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.96■■□□□ 1.91
TRIM4-202ENST00000354241 RTL1A6NKG5 1358 aa26.96■■□□□ 1.91
TRIM4-202ENST00000354241 GCP02774 474 aa26.95■■□□□ 1.9
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TRIM4-202ENST00000354241 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.95■■□□□ 1.9
TRIM4-202ENST00000354241 SLFN5Q08AF3 891 aa26.94■■□□□ 1.9
TRIM4-202ENST00000354241 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
TRIM4-202ENST00000354241 FKBP8Q14318 412 aa26.94■■□□□ 1.9
TRIM4-202ENST00000354241 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
TRIM4-202ENST00000354241 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.94■■□□□ 1.9
TRIM4-202ENST00000354241 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.93■■□□□ 1.9
TRIM4-202ENST00000354241 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
TRIM4-202ENST00000354241 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.92■■□□□ 1.9
TRIM4-202ENST00000354241 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
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TRIM4-202ENST00000354241 ARHGEF10O15013 1369 aa26.91■■□□□ 1.9
TRIM4-202ENST00000354241 E9PSI1 815 aa26.91■■□□□ 1.9
TRIM4-202ENST00000354241 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.91■■□□□ 1.9
TRIM4-202ENST00000354241 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.91■■□□□ 1.9
TRIM4-202ENST00000354241 RIPK4P57078 832 aa26.9■■□□□ 1.9
TRIM4-202ENST00000354241 IP6K1Q92551 441 aa26.9■■□□□ 1.9
TRIM4-202ENST00000354241 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.9■■□□□ 1.9
TRIM4-202ENST00000354241 WDR63Q8IWG1 891 aa26.89■■□□□ 1.9
TRIM4-202ENST00000354241 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
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TRIM4-202ENST00000354241 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.88■■□□□ 1.89
TRIM4-202ENST00000354241 NFE2L2Q16236 605 aa26.87■■□□□ 1.89
TRIM4-202ENST00000354241 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.87■■□□□ 1.89
TRIM4-202ENST00000354241 EYA1Q99502 592 aa26.87■■□□□ 1.89
TRIM4-202ENST00000354241 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.87■■□□□ 1.89
TRIM4-202ENST00000354241 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.86■■□□□ 1.89
TRIM4-202ENST00000354241 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.85■■□□□ 1.89
TRIM4-202ENST00000354241 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
TRIM4-202ENST00000354241 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.85■■□□□ 1.89
TRIM4-202ENST00000354241 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
TRIM4-202ENST00000354241 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.84■■□□□ 1.89
TRIM4-202ENST00000354241 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
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TRIM4-202ENST00000354241 KDRP35968 1356 aa26.81■■□□□ 1.88
TRIM4-202ENST00000354241 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.8■■□□□ 1.88
TRIM4-202ENST00000354241 RGPD5Q99666 1765 aa26.8■■□□□ 1.88
TRIM4-202ENST00000354241 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.8■■□□□ 1.88
TRIM4-202ENST00000354241 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.79■■□□□ 1.88
TRIM4-202ENST00000354241 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.78■■□□□ 1.88
TRIM4-202ENST00000354241 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
TRIM4-202ENST00000354241 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.76■■□□□ 1.87
TRIM4-202ENST00000354241 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.75■■□□□ 1.87
TRIM4-202ENST00000354241 IL16Q14005 1332 aa26.75■■□□□ 1.87
TRIM4-202ENST00000354241 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.75■■□□□ 1.87
TRIM4-202ENST00000354241 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.75■■□□□ 1.87
TRIM4-202ENST00000354241 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
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TRIM4-202ENST00000354241 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
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TRIM4-202ENST00000354241 COL18A1P39060 1754 aa26.72■■□□□ 1.87
TRIM4-202ENST00000354241 ABCA3Q99758 1704 aa26.72■■□□□ 1.87
TRIM4-202ENST00000354241 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
TRIM4-202ENST00000354241 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
TRIM4-202ENST00000354241 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
TRIM4-202ENST00000354241 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
TRIM4-202ENST00000354241 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.7■■□□□ 1.86
TRIM4-202ENST00000354241 KIAA0232Q92628 1395 aa26.7■■□□□ 1.86
TRIM4-202ENST00000354241 FAM83GA6ND36 823 aa26.69■■□□□ 1.86
TRIM4-202ENST00000354241 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
TRIM4-202ENST00000354241 CPDO75976 1380 aa26.69■■□□□ 1.86
TRIM4-202ENST00000354241 CHRNA2Q15822 529 aa26.69■■□□□ 1.86
TRIM4-202ENST00000354241 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
TRIM4-202ENST00000354241 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
TRIM4-202ENST00000354241 ABCC6O95255 1503 aa26.67■■□□□ 1.86
TRIM4-202ENST00000354241 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.67■■□□□ 1.86
TRIM4-202ENST00000354241 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.67■■□□□ 1.86
TRIM4-202ENST00000354241 ERBB3P21860 1342 aa26.67■■□□□ 1.86
TRIM4-202ENST00000354241 DCTN1Q14203 1278 aa26.67■■□□□ 1.86
TRIM4-202ENST00000354241 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.64■■□□□ 1.86
TRIM4-202ENST00000354241 PLIN1O60240 522 aa26.63■■□□□ 1.85
TRIM4-202ENST00000354241 NCAPD2Q15021 1401 aa26.63■■□□□ 1.85
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TRIM4-202ENST00000354241 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.63■■□□□ 1.85
TRIM4-202ENST00000354241 IFT57Q9NWB7 429 aa26.63■■□□□ 1.85
TRIM4-202ENST00000354241 GNAI1P63096 354 aa26.62■■□□□ 1.85
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TRIM4-202ENST00000354241 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
TRIM4-202ENST00000354241 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.61■■□□□ 1.85
TRIM4-202ENST00000354241 PHLPP1O60346 1717 aa26.61■■□□□ 1.85
TRIM4-202ENST00000354241 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.61■■□□□ 1.85
TRIM4-202ENST00000354241 BCAR3O75815 825 aa26.59■■□□□ 1.85
TRIM4-202ENST00000354241 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.59■■□□□ 1.85
TRIM4-202ENST00000354241 PIP4K2BP78356 416 aa26.59■■□□□ 1.85
TRIM4-202ENST00000354241 ZNF853P0CG23 659 aa26.58■■□□□ 1.85
TRIM4-202ENST00000354241 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
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