RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 AMPHP49418 695 aa25.04■■□□□ 1.6
UPP1-201ENST00000331803 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.04■■□□□ 1.6
UPP1-201ENST00000331803 MST1RQ04912 1400 aa25.01■■□□□ 1.59
UPP1-201ENST00000331803 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.01■■□□□ 1.59
UPP1-201ENST00000331803 KIF1AQ12756 1690 aa25.01■■□□□ 1.59
UPP1-201ENST00000331803 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
UPP1-201ENST00000331803 KIF24Q5T7B8 1368 aa25■■□□□ 1.59
UPP1-201ENST00000331803 NFE2L2Q16236 605 aa25■■□□□ 1.59
UPP1-201ENST00000331803 MYH16Q9H6N6 1097 aa25■■□□□ 1.59
UPP1-201ENST00000331803 MSH6P52701 1360 aa24.99■■□□□ 1.59
UPP1-201ENST00000331803 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.99■■□□□ 1.59
UPP1-201ENST00000331803 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.99■■□□□ 1.59
UPP1-201ENST00000331803 PLIN1O60240 522 aa24.98■■□□□ 1.59
UPP1-201ENST00000331803 IL16Q14005 1332 aa24.96■■□□□ 1.59
UPP1-201ENST00000331803 HOXC9P31274 260 aa24.96■■□□□ 1.59
UPP1-201ENST00000331803 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.96■■□□□ 1.59
UPP1-201ENST00000331803 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
UPP1-201ENST00000331803 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.96■■□□□ 1.59
UPP1-201ENST00000331803 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.95■■□□□ 1.59
UPP1-201ENST00000331803 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
UPP1-201ENST00000331803 ARHGEF10O15013 1369 aa24.94■■□□□ 1.58
UPP1-201ENST00000331803 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
UPP1-201ENST00000331803 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
UPP1-201ENST00000331803 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.92■■□□□ 1.58
UPP1-201ENST00000331803 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
UPP1-201ENST00000331803 NFAT5O94916 1531 aa24.92■■□□□ 1.58
UPP1-201ENST00000331803 RTL1A6NKG5 1358 aa24.91■■□□□ 1.58
UPP1-201ENST00000331803 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.91■■□□□ 1.58
UPP1-201ENST00000331803 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.91■■□□□ 1.58
UPP1-201ENST00000331803 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.9■■□□□ 1.58
UPP1-201ENST00000331803 EYA1Q99502 592 aa24.9■■□□□ 1.58
UPP1-201ENST00000331803 BCAR3O75815 825 aa24.9■■□□□ 1.58
UPP1-201ENST00000331803 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
UPP1-201ENST00000331803 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.89■■□□□ 1.58
UPP1-201ENST00000331803 GCP02774 474 aa24.89■■□□□ 1.58
UPP1-201ENST00000331803 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.88■■□□□ 1.57
UPP1-201ENST00000331803 IP6K1Q92551 441 aa24.88■■□□□ 1.57
UPP1-201ENST00000331803 LTN1O94822 1766 aa24.88■■□□□ 1.57
UPP1-201ENST00000331803 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
UPP1-201ENST00000331803 KDRP35968 1356 aa24.87■■□□□ 1.57
UPP1-201ENST00000331803 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
UPP1-201ENST00000331803 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.87■■□□□ 1.57
UPP1-201ENST00000331803 SLIT3O75094 1523 aa24.86■■□□□ 1.57
UPP1-201ENST00000331803 USP19O94966 1318 aa24.86■■□□□ 1.57
UPP1-201ENST00000331803 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.86■■□□□ 1.57
UPP1-201ENST00000331803 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
UPP1-201ENST00000331803 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
UPP1-201ENST00000331803 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
UPP1-201ENST00000331803 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
UPP1-201ENST00000331803 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.84■■□□□ 1.57
UPP1-201ENST00000331803 PLEKHG5O94827 1062 aa24.84■■□□□ 1.57
UPP1-201ENST00000331803 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
UPP1-201ENST00000331803 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.84■■□□□ 1.57
UPP1-201ENST00000331803 CRBNQ96SW2 442 aa24.83■■□□□ 1.57
UPP1-201ENST00000331803 ALS2Q96Q42 1657 aa24.83■■□□□ 1.57
UPP1-201ENST00000331803 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.82■■□□□ 1.56
UPP1-201ENST00000331803 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.82■■□□□ 1.56
UPP1-201ENST00000331803 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
UPP1-201ENST00000331803 FAM83GA6ND36 823 aa24.81■■□□□ 1.56
UPP1-201ENST00000331803 BRINP3Q76B58 766 aa24.81■■□□□ 1.56
UPP1-201ENST00000331803 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
UPP1-201ENST00000331803 IFT57Q9NWB7 429 aa24.8■■□□□ 1.56
UPP1-201ENST00000331803 SLAIN2Q9P270 581 aa24.8■■□□□ 1.56
UPP1-201ENST00000331803 GNAI1P63096 354 aa24.8■■□□□ 1.56
UPP1-201ENST00000331803 ZNF853P0CG23 659 aa24.78■■□□□ 1.56
UPP1-201ENST00000331803 PXDNQ92626 1479 aa24.78■■□□□ 1.56
UPP1-201ENST00000331803 DCTN1Q14203 1278 aa24.78■■□□□ 1.56
UPP1-201ENST00000331803 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
UPP1-201ENST00000331803 CFAP44Q96MT7 982 aa24.76■■□□□ 1.55
UPP1-201ENST00000331803 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.76■■□□□ 1.55
UPP1-201ENST00000331803 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
UPP1-201ENST00000331803 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
UPP1-201ENST00000331803 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.75■■□□□ 1.55
UPP1-201ENST00000331803 BCL2L13Q9BXK5 485 aa24.75■■□□□ 1.55
UPP1-201ENST00000331803 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.75■■□□□ 1.55
UPP1-201ENST00000331803 PDE3AQ14432 1141 aa24.74■■□□□ 1.55
UPP1-201ENST00000331803 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
UPP1-201ENST00000331803 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.74■■□□□ 1.55
UPP1-201ENST00000331803 NBPF4Q96M43 638 aa24.74■■□□□ 1.55
UPP1-201ENST00000331803 MBIPQ9NS73 344 aa24.74■■□□□ 1.55
UPP1-201ENST00000331803 MCM10Q7L590 875 aa24.73■■□□□ 1.55
UPP1-201ENST00000331803 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.73■■□□□ 1.55
UPP1-201ENST00000331803 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
UPP1-201ENST00000331803 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24.71■■□□□ 1.55
UPP1-201ENST00000331803 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
UPP1-201ENST00000331803 SSH1Q8WYL5 1049 aa24.7■■□□□ 1.54
UPP1-201ENST00000331803 SMC4Q9NTJ3 1288 aa24.7■■□□□ 1.54
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.69■■□□□ 1.54
UPP1-201ENST00000331803 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
UPP1-201ENST00000331803 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.69■■□□□ 1.54
UPP1-201ENST00000331803 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
UPP1-201ENST00000331803 ZNF428Q96B54 188 aa24.68■■□□□ 1.54
UPP1-201ENST00000331803 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
UPP1-201ENST00000331803 CHL1O00533 1208 aa24.67■■□□□ 1.54
UPP1-201ENST00000331803 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.67■■□□□ 1.54
UPP1-201ENST00000331803 VAMP4O75379 141 aa24.66■■□□□ 1.54
UPP1-201ENST00000331803 CRB1P82279 1406 aa24.66■■□□□ 1.54
UPP1-201ENST00000331803 PANK1Q8TE04 598 aa24.66■■□□□ 1.54
UPP1-201ENST00000331803 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.65■■□□□ 1.54
UPP1-201ENST00000331803 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms