RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CHTF18-202ENST00000317063 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CHTF18-202ENST00000317063 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CHTF18-202ENST00000317063 PRKAR2BP31323 418 aa21.4■■□□□ 1.02
CHTF18-202ENST00000317063 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
CHTF18-202ENST00000317063 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.39■■□□□ 1.02
CHTF18-202ENST00000317063 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.39■■□□□ 1.01
CHTF18-202ENST00000317063 KIF1AQ12756 1690 aa21.38■■□□□ 1.01
CHTF18-202ENST00000317063 GCP02774 474 aa21.38■■□□□ 1.01
CHTF18-202ENST00000317063 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.38■■□□□ 1.01
CHTF18-202ENST00000317063 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CHTF18-202ENST00000317063 NPHP3Q7Z494 1330 aa21.37■■□□□ 1.01
CHTF18-202ENST00000317063 HOXC9P31274 260 aa21.36■■□□□ 1.01
CHTF18-202ENST00000317063 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.36■■□□□ 1.01
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF521Q96K83 1311 aa21.36■■□□□ 1.01
CHTF18-202ENST00000317063 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CHTF18-202ENST00000317063 WWC1Q8IX03 1113 aa21.36■■□□□ 1.01
CHTF18-202ENST00000317063 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.35■■□□□ 1.01
CHTF18-202ENST00000317063 FCHSD2O94868 740 aa21.35■■□□□ 1.01
CHTF18-202ENST00000317063 SBNO1A3KN83 1393 aa21.34■■□□□ 1.01
CHTF18-202ENST00000317063 GOLGA2Q08379 1002 aa21.34■■□□□ 1.01
CHTF18-202ENST00000317063 FLT4P35916 1363 aa21.34■■□□□ 1.01
CHTF18-202ENST00000317063 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
CHTF18-202ENST00000317063 FKBP8Q14318 412 aa21.33■■□□□ 1.01
CHTF18-202ENST00000317063 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
CHTF18-202ENST00000317063 LTN1O94822 1766 aa21.33■■□□□ 1.01
CHTF18-202ENST00000317063 PDE3BQ13370 1112 aa21.33■■□□□ 1
CHTF18-202ENST00000317063 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.33■■□□□ 1
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CHTF18-202ENST00000317063 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.31■■□□□ 1
CHTF18-202ENST00000317063 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.31■■□□□ 1
CHTF18-202ENST00000317063 EYA1Q99502 592 aa21.31■■□□□ 1
CHTF18-202ENST00000317063 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.3■■□□□ 1
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CHTF18-202ENST00000317063 NFAT5O94916 1531 aa21.3■■□□□ 1
CHTF18-202ENST00000317063 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.3■■□□□ 1
CHTF18-202ENST00000317063 AXIN2Q9Y2T1 843 aa21.29■■□□□ 1
CHTF18-202ENST00000317063 USP54Q70EL1 1684 aa21.29■■□□□ 1
CHTF18-202ENST00000317063 ALS2Q96Q42 1657 aa21.29■■□□□ 1
CHTF18-202ENST00000317063 SLFN5Q08AF3 891 aa21.29■■□□□ 1
CHTF18-202ENST00000317063 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.29■■□□□ 1
CHTF18-202ENST00000317063 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.29■■□□□ 1
CHTF18-202ENST00000317063 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.29■■□□□ 1
CHTF18-202ENST00000317063 ARHGEF25Q86VW2 580 aa21.28■■□□□ 1
CHTF18-202ENST00000317063 IP6K1Q92551 441 aa21.28■■□□□ 1
CHTF18-202ENST00000317063 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
CHTF18-202ENST00000317063 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
CHTF18-202ENST00000317063 USP19O94966 1318 aa21.27■■□□□ 1
CHTF18-202ENST00000317063 NEFMP07197 916 aa21.27■□□□□ 0.99
CHTF18-202ENST00000317063 CHRNA2Q15822 529 aa21.27■□□□□ 0.99
CHTF18-202ENST00000317063 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP21.27■□□□□ 0.99
CHTF18-202ENST00000317063 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.27■□□□□ 0.99
CHTF18-202ENST00000317063 TNS3Q68CZ2 1445 aa21.26■□□□□ 0.99
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CHTF18-202ENST00000317063 PIP4K2BP78356 416 aa21.24■□□□□ 0.99
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CHTF18-202ENST00000317063 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.24■□□□□ 0.99
CHTF18-202ENST00000317063 NEFLP07196 543 aa21.23■□□□□ 0.99
CHTF18-202ENST00000317063 DCTN1Q14203 1278 aa21.23■□□□□ 0.99
CHTF18-202ENST00000317063 RGPD5Q99666 1765 aa21.23■□□□□ 0.99
CHTF18-202ENST00000317063 SLIT3O75094 1523 aa21.23■□□□□ 0.99
CHTF18-202ENST00000317063 NFE2L2Q16236 605 aa21.22■□□□□ 0.99
CHTF18-202ENST00000317063 RGPD2P0DJD1 1756 aa21.22■□□□□ 0.99
CHTF18-202ENST00000317063 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
CHTF18-202ENST00000317063 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
CHTF18-202ENST00000317063 RGPD1P0DJD0 1748 aa21.21■□□□□ 0.99
CHTF18-202ENST00000317063 NBR1Q14596 966 aa21.21■□□□□ 0.99
CHTF18-202ENST00000317063 E9PSI1 815 aa21.21■□□□□ 0.99
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC27Q2M243 656 aa21.21■□□□□ 0.99
CHTF18-202ENST00000317063 NGEFQ8N5V2 710 aa21.21■□□□□ 0.99
CHTF18-202ENST00000317063 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.21■□□□□ 0.99
CHTF18-202ENST00000317063 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
CHTF18-202ENST00000317063 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.2■□□□□ 0.98
CHTF18-202ENST00000317063 ANKRD24Q8TF21 1146 aa21.19■□□□□ 0.98
CHTF18-202ENST00000317063 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CHTF18-202ENST00000317063 WDR63Q8IWG1 891 aa21.19■□□□□ 0.98
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CHTF18-202ENST00000317063 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa21.18■□□□□ 0.98
CHTF18-202ENST00000317063 ARHGEF10O15013 1369 aa21.17■□□□□ 0.98
CHTF18-202ENST00000317063 KIAA0232Q92628 1395 aa21.17■□□□□ 0.98
CHTF18-202ENST00000317063 RTL1A6NKG5 1358 aa21.17■□□□□ 0.98
CHTF18-202ENST00000317063 MCM10Q7L590 875 aa21.16■□□□□ 0.98
CHTF18-202ENST00000317063 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
CHTF18-202ENST00000317063 KDRP35968 1356 aa21.13■□□□□ 0.97
CHTF18-202ENST00000317063 NHSL1Q5SYE7 1610 aa21.13■□□□□ 0.97
CHTF18-202ENST00000317063 PRDM11Q9NQV5 511 aa21.12■□□□□ 0.97
CHTF18-202ENST00000317063 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.12■□□□□ 0.97
CHTF18-202ENST00000317063 UBAP1LF5GYI3 381 aa21.11■□□□□ 0.97
CHTF18-202ENST00000317063 BCAR3O75815 825 aa21.11■□□□□ 0.97
CHTF18-202ENST00000317063 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.11■□□□□ 0.97
CHTF18-202ENST00000317063 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.11■□□□□ 0.97
CHTF18-202ENST00000317063 ERBB3P21860 1342 aa21.1■□□□□ 0.97
CHTF18-202ENST00000317063 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CHTF18-202ENST00000317063 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CHTF18-202ENST00000317063 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.09■□□□□ 0.97
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