RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308153.8

H2AFV-202, Transcript of H2A histone family member V, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene H2AFV, Length 752 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFV-202ENST00000308153 A0A1W2PP64 1363 aa40.75■■■■■ 4.11
H2AFV-202ENST00000308153 PDE3BQ13370 1112 aa40.75■■■■■ 4.11
H2AFV-202ENST00000308153 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP40.75■■■■■ 4.11
H2AFV-202ENST00000308153 WDR17Q8IZU2 1322 aa40.74■■■■■ 4.11
H2AFV-202ENST00000308153 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
H2AFV-202ENST00000308153 NME9Q86XW9 330 aa40.74■■■■■ 4.11
H2AFV-202ENST00000308153 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
H2AFV-202ENST00000308153 RGPD5Q99666 1765 aa40.72■■■■■ 4.11
H2AFV-202ENST00000308153 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa40.72■■■■■ 4.11
H2AFV-202ENST00000308153 TRIM37O94972 964 aa40.71■■■■■ 4.11
H2AFV-202ENST00000308153 TERF2IPQ9NYB0 399 aa40.71■■■■■ 4.11
H2AFV-202ENST00000308153 ABCC6O95255 1503 aa40.7■■■■■ 4.11
H2AFV-202ENST00000308153 NINLQ9Y2I6 1382 aa40.67■■■■■ 4.1
H2AFV-202ENST00000308153 LRRC37A3O60309 1634 aa40.67■■■■■ 4.1
H2AFV-202ENST00000308153 USP47Q96K76 1375 aa40.66■■■■■ 4.1
H2AFV-202ENST00000308153 WNK3Q9BYP7 1800 aa40.65■■■■■ 4.1
H2AFV-202ENST00000308153 SLC24A1O60721 1099 aa40.65■■■■■ 4.1
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H2AFV-202ENST00000308153 OVOS2Q6IE36 1432 aa40.62■■■■■ 4.09
H2AFV-202ENST00000308153 PEAK1Q9H792 1746 aa40.61■■■■■ 4.09
H2AFV-202ENST00000308153 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP40.6■■■■■ 4.09
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H2AFV-202ENST00000308153 CARD10Q9BWT7 1032 aa40.6■■■■■ 4.09
H2AFV-202ENST00000308153 CLSPNQ9HAW4 1339 aa40.6■■■■■ 4.09
H2AFV-202ENST00000308153 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa40.58■■■■■ 4.09
H2AFV-202ENST00000308153 LTN1O94822 1766 aa40.57■■■■■ 4.09
H2AFV-202ENST00000308153 APBA3O96018 575 aa40.57■■■■■ 4.09
H2AFV-202ENST00000308153 DDB1Q16531 1140 aa40.57■■■■■ 4.09
H2AFV-202ENST00000308153 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa40.57■■■■■ 4.09
H2AFV-202ENST00000308153 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa40.57■■■■■ 4.08
H2AFV-202ENST00000308153 PCGF6Q9BYE7 350 aa40.56■■■■■ 4.08
H2AFV-202ENST00000308153 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
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H2AFV-202ENST00000308153 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP40.53■■■■■ 4.08
H2AFV-202ENST00000308153 TMF1P82094 1093 aa40.53■■■■■ 4.08
H2AFV-202ENST00000308153 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa40.52■■■■■ 4.08
H2AFV-202ENST00000308153 ERBB3P21860 1342 aa40.52■■■■■ 4.08
H2AFV-202ENST00000308153 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
H2AFV-202ENST00000308153 CCDC7Q96M83 1385 aa40.51■■■■■ 4.08
H2AFV-202ENST00000308153 RREB1Q92766 1687 aa40.49■■■■■ 4.07
H2AFV-202ENST00000308153 SBF2Q86WG5 1849 aa40.46■■■■■ 4.07
H2AFV-202ENST00000308153 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP40.46■■■■■ 4.07
H2AFV-202ENST00000308153 LRP5O75197 1615 aa40.44■■■■■ 4.06
H2AFV-202ENST00000308153 BCL9O00512 1426 aa40.43■■■■■ 4.06
H2AFV-202ENST00000308153 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP40.43■■■■■ 4.06
H2AFV-202ENST00000308153 NUP188Q5SRE5 1749 aa40.42■■■■■ 4.06
H2AFV-202ENST00000308153 ANKRD24Q8TF21 1146 aa40.41■■■■■ 4.06
H2AFV-202ENST00000308153 COG3Q96JB2 828 aa40.41■■■■■ 4.06
H2AFV-202ENST00000308153 NLRP2Q9NX02 1062 aa40.4■■■■■ 4.06
H2AFV-202ENST00000308153 TNS2Q63HR2 1409 aa40.4■■■■■ 4.06
H2AFV-202ENST00000308153 IP6K1Q92551 441 aa40.38■■■■■ 4.05
H2AFV-202ENST00000308153 EXOC5O00471 708 aa40.37■■■■■ 4.05
H2AFV-202ENST00000308153 PTF1AQ7RTS3 328 aa40.37■■■■■ 4.05
H2AFV-202ENST00000308153 CDCA8Q53HL2 280 aa40.36■■■■■ 4.05
H2AFV-202ENST00000308153 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
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H2AFV-202ENST00000308153 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa40.34■■■■■ 4.05
H2AFV-202ENST00000308153 MAP3K19Q56UN5 1328 aa40.34■■■■■ 4.05
H2AFV-202ENST00000308153 FBLN1P23142 703 aa40.33■■■■■ 4.05
H2AFV-202ENST00000308153 MYOM1P52179 1685 aa40.32■■■■■ 4.05
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H2AFV-202ENST00000308153 PLSCR1O15162 318 aa40.3■■■■■ 4.04
H2AFV-202ENST00000308153 IL2RBP14784 551 aa40.3■■■■■ 4.04
H2AFV-202ENST00000308153 HOXC9P31274 260 aa40.28■■■■■ 4.04
H2AFV-202ENST00000308153 GGNBP2Q9H3C7 697 aa40.28■■■■■ 4.04
H2AFV-202ENST00000308153 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
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H2AFV-202ENST00000308153 KIF20BQ96Q89 1820 aa40.22■■■■■ 4.03
H2AFV-202ENST00000308153 AMPHP49418 695 aa40.22■■■■■ 4.03
H2AFV-202ENST00000308153 NBPF14Q5TI25 921 aa40.22■■■■■ 4.03
H2AFV-202ENST00000308153 CARD14Q9BXL6 1004 aa40.22■■■■■ 4.03
H2AFV-202ENST00000308153 RTL1A6NKG5 1358 aa40.22■■■■■ 4.03
H2AFV-202ENST00000308153 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
H2AFV-202ENST00000308153 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP40.2■■■■■ 4.03
H2AFV-202ENST00000308153 NHSQ6T4R5 1651 aa40.18■■■■■ 4.02
H2AFV-202ENST00000308153 PROM2Q8N271 834 aa40.18■■■■■ 4.02
H2AFV-202ENST00000308153 KCNQ2O43526 872 aa40.17■■■■■ 4.02
H2AFV-202ENST00000308153 NSD3Q9BZ95 1437 aa40.16■■■■■ 4.02
H2AFV-202ENST00000308153 RGPD2P0DJD1 1756 aa40.15■■■■■ 4.02
H2AFV-202ENST00000308153 ACSBG1Q96GR2 724 aa40.12■■■■■ 4.01
H2AFV-202ENST00000308153 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
H2AFV-202ENST00000308153 TXNRD1Q16881 649 aa40.07■■■■■ 4.01
H2AFV-202ENST00000308153 MEGF6O75095 1541 aa40.06■■■■■ 4
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H2AFV-202ENST00000308153 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP40.05■■■■■ 4
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H2AFV-202ENST00000308153 NBPF4Q96M43 638 aa40.05■■■■■ 4
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H2AFV-202ENST00000308153 KIF24Q5T7B8 1368 aa40.04■■■■■ 4
H2AFV-202ENST00000308153 FLT4P35916 1363 aa40.03■■■■■ 4
H2AFV-202ENST00000308153 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa40.03■■■■■ 4
H2AFV-202ENST00000308153 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP40.03■■■■■ 4
H2AFV-202ENST00000308153 SHANK3Q9BYB0 1731 aa40.02■■■■■ 4
H2AFV-202ENST00000308153 BTAF1O14981 1849 aa40.02■■■■■ 4
H2AFV-202ENST00000308153 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP40.01■■■■■ 4
H2AFV-202ENST00000308153 CASZ1Q86V15 1759 aa39.98■■■■□ 3.99
H2AFV-202ENST00000308153 USHBP1Q8N6Y0 703 aa39.98■■■■□ 3.99
H2AFV-202ENST00000308153 POLR3GLQ9BT43 218 aa39.98■■■■□ 3.99
H2AFV-202ENST00000308153 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa39.98■■■■□ 3.99
H2AFV-202ENST00000308153 CGNL1Q0VF96 1302 aa39.97■■■■□ 3.99
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