RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.45■■□□□ 1.67
HPS6-201ENST00000299238 FCHSD2O94868 740 aa25.45■■□□□ 1.66
HPS6-201ENST00000299238 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
HPS6-201ENST00000299238 PRDM4Q9UKN5 801 aa25.44■■□□□ 1.66
HPS6-201ENST00000299238 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.44■■□□□ 1.66
HPS6-201ENST00000299238 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.44■■□□□ 1.66
HPS6-201ENST00000299238 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.44■■□□□ 1.66
HPS6-201ENST00000299238 CCDC61Q9Y6R9 512 aa25.44■■□□□ 1.66
HPS6-201ENST00000299238 SSH1Q8WYL5 1049 aa25.43■■□□□ 1.66
HPS6-201ENST00000299238 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
HPS6-201ENST00000299238 PRKAR2BP31323 418 aa25.43■■□□□ 1.66
HPS6-201ENST00000299238 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
HPS6-201ENST00000299238 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.43■■□□□ 1.66
HPS6-201ENST00000299238 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
HPS6-201ENST00000299238 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.42■■□□□ 1.66
HPS6-201ENST00000299238 TRIM27P14373 513 aa25.42■■□□□ 1.66
HPS6-201ENST00000299238 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
HPS6-201ENST00000299238 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa25.41■■□□□ 1.66
HPS6-201ENST00000299238 PRR36Q9H6K5 1346 aa25.41■■□□□ 1.66
HPS6-201ENST00000299238 AATKQ6ZMQ8 1374 aa25.41■■□□□ 1.66
HPS6-201ENST00000299238 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.4■■□□□ 1.66
HPS6-201ENST00000299238 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa25.4■■□□□ 1.66
HPS6-201ENST00000299238 ERBB4Q15303 1308 aa25.4■■□□□ 1.66
HPS6-201ENST00000299238 NRKQ7Z2Y5 1582 aa25.38■■□□□ 1.65
HPS6-201ENST00000299238 COG3Q96JB2 828 aa25.38■■□□□ 1.65
HPS6-201ENST00000299238 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.37■■□□□ 1.65
HPS6-201ENST00000299238 HMOX1P09601 288 aa25.37■■□□□ 1.65
HPS6-201ENST00000299238 LTKP29376 864 aa25.37■■□□□ 1.65
HPS6-201ENST00000299238 FSD2A1L4K1 749 aa25.36■■□□□ 1.65
HPS6-201ENST00000299238 IL13P35225 146 aa25.36■■□□□ 1.65
HPS6-201ENST00000299238 PDCL3Q9H2J4 239 aa25.35■■□□□ 1.65
HPS6-201ENST00000299238 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
HPS6-201ENST00000299238 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.34■■□□□ 1.65
HPS6-201ENST00000299238 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
HPS6-201ENST00000299238 NFE2L2Q16236 605 aa25.34■■□□□ 1.65
HPS6-201ENST00000299238 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.34■■□□□ 1.65
HPS6-201ENST00000299238 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.33■■□□□ 1.65
HPS6-201ENST00000299238 FGD1P98174 961 aa25.33■■□□□ 1.65
HPS6-201ENST00000299238 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
HPS6-201ENST00000299238 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.64
HPS6-201ENST00000299238 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.32■■□□□ 1.64
HPS6-201ENST00000299238 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
HPS6-201ENST00000299238 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
HPS6-201ENST00000299238 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.31■■□□□ 1.64
HPS6-201ENST00000299238 ESPNB1AK53 854 aa25.31■■□□□ 1.64
HPS6-201ENST00000299238 PTPRUQ92729 1446 aa25.31■■□□□ 1.64
HPS6-201ENST00000299238 KIF16BQ96L93 1317 aa25.3■■□□□ 1.64
HPS6-201ENST00000299238 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.3■■□□□ 1.64
HPS6-201ENST00000299238 SLIT1O75093 1534 aa25.29■■□□□ 1.64
HPS6-201ENST00000299238 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.29■■□□□ 1.64
HPS6-201ENST00000299238 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.28■■□□□ 1.64
HPS6-201ENST00000299238 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.28■■□□□ 1.64
HPS6-201ENST00000299238 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.28■■□□□ 1.64
HPS6-201ENST00000299238 TBC1D32Q96NH3 1257 aa25.27■■□□□ 1.64
HPS6-201ENST00000299238 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.27■■□□□ 1.64
HPS6-201ENST00000299238 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
HPS6-201ENST00000299238 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.26■■□□□ 1.63
HPS6-201ENST00000299238 EID1Q9Y6B2 187 aa25.26■■□□□ 1.63
HPS6-201ENST00000299238 ACEP12821 1306 aa25.26■■□□□ 1.63
HPS6-201ENST00000299238 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa25.26■■□□□ 1.63
HPS6-201ENST00000299238 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
HPS6-201ENST00000299238 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa25.25■■□□□ 1.63
HPS6-201ENST00000299238 OVOS2Q6IE36 1432 aa25.25■■□□□ 1.63
HPS6-201ENST00000299238 NUTM2FA1L443 756 aa25.25■■□□□ 1.63
HPS6-201ENST00000299238 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
HPS6-201ENST00000299238 SMC5Q8IY18 1101 aa25.25■■□□□ 1.63
HPS6-201ENST00000299238 USP6P35125 1406 aa25.25■■□□□ 1.63
HPS6-201ENST00000299238 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
HPS6-201ENST00000299238 PLEKHG3A1L390 1219 aa25.23■■□□□ 1.63
HPS6-201ENST00000299238 ZNF428Q96B54 188 aa25.23■■□□□ 1.63
HPS6-201ENST00000299238 TPM2P07951 284 aa25.22■■□□□ 1.63
HPS6-201ENST00000299238 BECN1Q14457 450 aa25.22■■□□□ 1.63
HPS6-201ENST00000299238 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.22■■□□□ 1.63
HPS6-201ENST00000299238 IFT57Q9NWB7 429 aa25.21■■□□□ 1.63
HPS6-201ENST00000299238 PTCH1Q13635 1447 aa25.21■■□□□ 1.63
HPS6-201ENST00000299238 PEAK1Q9H792 1746 aa25.21■■□□□ 1.63
HPS6-201ENST00000299238 GNAI1P63096 354 aa25.2■■□□□ 1.63
HPS6-201ENST00000299238 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.2■■□□□ 1.63
HPS6-201ENST00000299238 DIP2AQ14689 1571 aa25.19■■□□□ 1.62
HPS6-201ENST00000299238 VAMP4O75379 141 aa25.19■■□□□ 1.62
HPS6-201ENST00000299238 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.19■■□□□ 1.62
HPS6-201ENST00000299238 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.19■■□□□ 1.62
HPS6-201ENST00000299238 ZNF853P0CG23 659 aa25.18■■□□□ 1.62
HPS6-201ENST00000299238 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
HPS6-201ENST00000299238 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa25.18■■□□□ 1.62
HPS6-201ENST00000299238 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
HPS6-201ENST00000299238 MBIPQ9NS73 344 aa25.17■■□□□ 1.62
HPS6-201ENST00000299238 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
HPS6-201ENST00000299238 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25.17■■□□□ 1.62
HPS6-201ENST00000299238 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
HPS6-201ENST00000299238 TSPYL6Q8N831 410 aa25.16■■□□□ 1.62
HPS6-201ENST00000299238 TBX22Q9Y458 520 aa25.16■■□□□ 1.62
HPS6-201ENST00000299238 SSH2Q76I76 1423 aa25.16■■□□□ 1.62
HPS6-201ENST00000299238 MRE11P49959 708 aa25.16■■□□□ 1.62
HPS6-201ENST00000299238 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
HPS6-201ENST00000299238 RGPD1P0DJD0 1748 aa25.16■■□□□ 1.62
HPS6-201ENST00000299238 PIK3R4Q99570 1358 aa25.16■■□□□ 1.62
HPS6-201ENST00000299238 MCM4P33991 863 aa25.16■■□□□ 1.62
HPS6-201ENST00000299238 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
HPS6-201ENST00000299238 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.15■■□□□ 1.62
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