RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 AEBP1Q8IUX7 1158 aa29.53■■■□□ 2.32
VSTM4-201ENST00000298454 SBNO1A3KN83 1393 aa29.52■■■□□ 2.32
VSTM4-201ENST00000298454 SULT6B1Q6IMI4 303 aa29.52■■■□□ 2.32
VSTM4-201ENST00000298454 ORAI2Q96SN7 254 aa29.52■■■□□ 2.32
VSTM4-201ENST00000298454 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
VSTM4-201ENST00000298454 PSME1Q06323 249 aa29.51■■■□□ 2.31
VSTM4-201ENST00000298454 FLT4P35916 1363 aa29.51■■■□□ 2.31
VSTM4-201ENST00000298454 AMPHP49418 695 aa29.5■■■□□ 2.31
VSTM4-201ENST00000298454 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.49■■■□□ 2.31
VSTM4-201ENST00000298454 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
VSTM4-201ENST00000298454 USP54Q70EL1 1684 aa29.47■■■□□ 2.31
VSTM4-201ENST00000298454 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
VSTM4-201ENST00000298454 BCL2L13Q9BXK5 485 aa29.47■■■□□ 2.31
VSTM4-201ENST00000298454 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.46■■■□□ 2.31
VSTM4-201ENST00000298454 RGPD1P0DJD0 1748 aa29.46■■■□□ 2.31
VSTM4-201ENST00000298454 FOXO3O43524 673 aa29.45■■■□□ 2.31
VSTM4-201ENST00000298454 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.3
VSTM4-201ENST00000298454 CANXP27824 592 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
VSTM4-201ENST00000298454 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.42■■■□□ 2.3
VSTM4-201ENST00000298454 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM94Q12767 1356 aa29.42■■■□□ 2.3
VSTM4-201ENST00000298454 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
VSTM4-201ENST00000298454 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
VSTM4-201ENST00000298454 HOXC9P31274 260 aa29.41■■■□□ 2.3
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGEF10O15013 1369 aa29.41■■■□□ 2.3
VSTM4-201ENST00000298454 PDE3AQ14432 1141 aa29.4■■■□□ 2.3
VSTM4-201ENST00000298454 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.4■■■□□ 2.3
VSTM4-201ENST00000298454 FAM83GA6ND36 823 aa29.4■■■□□ 2.3
VSTM4-201ENST00000298454 LMOD3Q0VAK6 560 aa29.39■■■□□ 2.29
VSTM4-201ENST00000298454 EYA1Q99502 592 aa29.39■■■□□ 2.29
VSTM4-201ENST00000298454 KIF24Q5T7B8 1368 aa29.39■■■□□ 2.29
VSTM4-201ENST00000298454 DLG5Q8TDM6 1919 aa29.38■■■□□ 2.29
VSTM4-201ENST00000298454 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
VSTM4-201ENST00000298454 PANK1Q8TE04 598 aa29.38■■■□□ 2.29
VSTM4-201ENST00000298454 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.37■■■□□ 2.29
VSTM4-201ENST00000298454 DCTN1Q14203 1278 aa29.37■■■□□ 2.29
VSTM4-201ENST00000298454 IGSF1Q8N6C5 1336 aa29.36■■■□□ 2.29
VSTM4-201ENST00000298454 IFT57Q9NWB7 429 aa29.35■■■□□ 2.29
VSTM4-201ENST00000298454 TNNQ9UQP3 1299 aa29.35■■■□□ 2.29
VSTM4-201ENST00000298454 ATF3P18847 181 aa29.35■■■□□ 2.29
VSTM4-201ENST00000298454 COG6Q9Y2V7 657 aa29.34■■■□□ 2.29
VSTM4-201ENST00000298454 KDRP35968 1356 aa29.34■■■□□ 2.29
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF853P0CG23 659 aa29.33■■■□□ 2.29
VSTM4-201ENST00000298454 NFAT5O94916 1531 aa29.33■■■□□ 2.29
VSTM4-201ENST00000298454 GNAI1P63096 354 aa29.33■■■□□ 2.29
VSTM4-201ENST00000298454 SSH1Q8WYL5 1049 aa29.33■■■□□ 2.29
VSTM4-201ENST00000298454 SMC4Q9NTJ3 1288 aa29.33■■■□□ 2.29
VSTM4-201ENST00000298454 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.32■■■□□ 2.28
VSTM4-201ENST00000298454 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
VSTM4-201ENST00000298454 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
VSTM4-201ENST00000298454 MST1RQ04912 1400 aa29.31■■■□□ 2.28
VSTM4-201ENST00000298454 MBIPQ9NS73 344 aa29.31■■■□□ 2.28
VSTM4-201ENST00000298454 RLBP1P12271 317 aa29.3■■■□□ 2.28
VSTM4-201ENST00000298454 KCNH5Q8NCM2 988 aa29.3■■■□□ 2.28
VSTM4-201ENST00000298454 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.3■■■□□ 2.28
VSTM4-201ENST00000298454 RTL1A6NKG5 1358 aa29.3■■■□□ 2.28
VSTM4-201ENST00000298454 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.3■■■□□ 2.28
VSTM4-201ENST00000298454 PLEKHG5O94827 1062 aa29.29■■■□□ 2.28
VSTM4-201ENST00000298454 CFAP44Q96MT7 982 aa29.29■■■□□ 2.28
VSTM4-201ENST00000298454 LTN1O94822 1766 aa29.29■■■□□ 2.28
VSTM4-201ENST00000298454 KIF1AQ12756 1690 aa29.29■■■□□ 2.28
VSTM4-201ENST00000298454 DCCP43146 1447 aa29.28■■■□□ 2.28
VSTM4-201ENST00000298454 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
VSTM4-201ENST00000298454 CLUAP1Q96AJ1 413 aa29.28■■■□□ 2.28
VSTM4-201ENST00000298454 IP6K1Q92551 441 aa29.28■■■□□ 2.28
VSTM4-201ENST00000298454 KDM2BQ8NHM5 1336 aa29.27■■■□□ 2.28
VSTM4-201ENST00000298454 MCM10Q7L590 875 aa29.27■■■□□ 2.28
VSTM4-201ENST00000298454 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB7CA1YPR0 619 aa29.26■■■□□ 2.28
VSTM4-201ENST00000298454 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa29.26■■■□□ 2.28
VSTM4-201ENST00000298454 STRCQ7RTU9 1775 aa29.26■■■□□ 2.27
VSTM4-201ENST00000298454 GCP02774 474 aa29.25■■■□□ 2.27
VSTM4-201ENST00000298454 TSPYL6Q8N831 410 aa29.25■■■□□ 2.27
VSTM4-201ENST00000298454 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.23■■■□□ 2.27
VSTM4-201ENST00000298454 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
VSTM4-201ENST00000298454 VAMP4O75379 141 aa29.23■■■□□ 2.27
VSTM4-201ENST00000298454 SLIT3O75094 1523 aa29.23■■■□□ 2.27
VSTM4-201ENST00000298454 ALDH1L2Q3SY69 923 aa29.22■■■□□ 2.27
VSTM4-201ENST00000298454 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
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VSTM4-201ENST00000298454 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
VSTM4-201ENST00000298454 MSH6P52701 1360 aa29.21■■■□□ 2.27
VSTM4-201ENST00000298454 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
VSTM4-201ENST00000298454 USHBP1Q8N6Y0 703 aa29.2■■■□□ 2.27
VSTM4-201ENST00000298454 USP19O94966 1318 aa29.2■■■□□ 2.27
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM27P14373 513 aa29.2■■■□□ 2.26
VSTM4-201ENST00000298454 C8orf58Q8NAV2 365 aa29.19■■■□□ 2.26
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF428Q96B54 188 aa29.19■■■□□ 2.26
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGEF25Q86VW2 580 aa29.19■■■□□ 2.26
VSTM4-201ENST00000298454 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
VSTM4-201ENST00000298454 GAS2L2Q8NHY3 880 aa29.19■■■□□ 2.26
VSTM4-201ENST00000298454 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa29.18■■■□□ 2.26
VSTM4-201ENST00000298454 SKAP1Q86WV1 359 aa29.18■■■□□ 2.26
VSTM4-201ENST00000298454 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
VSTM4-201ENST00000298454 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
VSTM4-201ENST00000298454 NBPF6Q5VWK0 638 aa29.16■■■□□ 2.26
VSTM4-201ENST00000298454 NBPF4Q96M43 638 aa29.16■■■□□ 2.26
VSTM4-201ENST00000298454 KIF16BQ96L93 1317 aa29.16■■■□□ 2.26
VSTM4-201ENST00000298454 CRB1P82279 1406 aa29.16■■■□□ 2.26
VSTM4-201ENST00000298454 CHL1O00533 1208 aa29.16■■■□□ 2.26
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