RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285243.6

ANKRD40-201, Transcript of ankyrin repeat domain 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD40, Length 4,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40-201ENST00000285243 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.27■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 H3BQV1 296 aa23.27■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 ANXA1P04083 346 aa23.27■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 IFFO2Q5TF58 517 aa23.27■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 ACEP12821 1306 aa23.27■■□□□ 1.32
ANKRD40-201ENST00000285243 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 NASPP49321 788 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 RUFY2Q8WXA3 655 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 TRIM27P14373 513 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 CREBRFQ8IUR6 639 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 BTBD11A6QL63 1104 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 SRGAP3O43295 1099 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.26■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 PHF14O94880 888 aa23.25■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.25■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.25■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 PIP4K2BP78356 416 aa23.25■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 WASHC4Q2M389 1173 aa23.25■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 CABP4P57796 275 aa23.24■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 FSD1Q9BTV5 496 aa23.24■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 NUP160Q12769 1436 aa23.23■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 GRPEL1Q9HAV7 217 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 CHRNA2Q15822 529 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 ADGRL2O95490 1459 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 A2MP01023 1474 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 VPS37DQ86XT2 251 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 RABEP1Q15276 862 aa23.2■■□□□ 1.31
ANKRD40-201ENST00000285243 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.2■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 ERC2O15083 957 aa23.19■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 RAD21O60216 631 aa23.19■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.19■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.19■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 KRT24Q2M2I5 525 aa23.18■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 RASSF8Q8NHQ8 419 aa23.18■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 FBXW7Q969H0 707 aa23.18■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.17■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 SEC24BO95487 1268 aa23.17■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 CCDC27Q2M243 656 aa23.17■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.16■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa23.16■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.16■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 RLBP1P12271 317 aa23.16■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.16■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.16■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 MTMR7Q9Y216 660 aa23.16■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa23.15■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 SMC3Q9UQE7 1217 aa23.15■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 RNF214Q8ND24 703 aa23.15■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 CPLX1O14810 134 aa23.15■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 TSHZ3Q63HK5 1081 aa23.15■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 MBIPQ9NS73 344 aa23.15■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 NRDCO43847 1150 aa23.14■■□□□ 1.3
ANKRD40-201ENST00000285243 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
ANKRD40-201ENST00000285243 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
ANKRD40-201ENST00000285243 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
ANKRD40-201ENST00000285243 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa23.13■■□□□ 1.29
ANKRD40-201ENST00000285243 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.13■■□□□ 1.29
ANKRD40-201ENST00000285243 PIK3C2GO75747 1445 aa23.13■■□□□ 1.29
ANKRD40-201ENST00000285243 POLKQ9UBT6 870 aa23.13■■□□□ 1.29
ANKRD40-201ENST00000285243 CLSTN1O94985 981 aa23.12■■□□□ 1.29
ANKRD40-201ENST00000285243 ADAMTS2O95450 1211 aa23.12■■□□□ 1.29
ANKRD40-201ENST00000285243 ESPNB1AK53 854 aa23.12■■□□□ 1.29
ANKRD40-201ENST00000285243 CNTROBQ8N137 903 aa23.12■■□□□ 1.29
ANKRD40-201ENST00000285243 RNF20Q5VTR2 975 aa23.11■■□□□ 1.29
ANKRD40-201ENST00000285243 FAM13BQ9NYF5 915 aa23.11■■□□□ 1.29
ANKRD40-201ENST00000285243 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.11■■□□□ 1.29
ANKRD40-201ENST00000285243 ABCC11Q96J66 1382 aa23.11■■□□□ 1.29
ANKRD40-201ENST00000285243 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.11■■□□□ 1.29
ANKRD40-201ENST00000285243 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.1■■□□□ 1.29
ANKRD40-201ENST00000285243 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
ANKRD40-201ENST00000285243 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
ANKRD40-201ENST00000285243 SPG7Q9UQ90 795 aa23.1■■□□□ 1.29
ANKRD40-201ENST00000285243 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.1■■□□□ 1.29
ANKRD40-201ENST00000285243 HSPA2P54652 639 aa23.1■■□□□ 1.29
ANKRD40-201ENST00000285243 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
ANKRD40-201ENST00000285243 IFT57Q9NWB7 429 aa23.09■■□□□ 1.29
ANKRD40-201ENST00000285243 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
ANKRD40-201ENST00000285243 AACSQ86V21 672 aa23.09■■□□□ 1.29
ANKRD40-201ENST00000285243 TRDNQ13061 729 aa23.08■■□□□ 1.29
ANKRD40-201ENST00000285243 TNRQ92752 1358 aa23.08■■□□□ 1.29
ANKRD40-201ENST00000285243 TSPYL6Q8N831 410 aa23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms