RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272542.7

SLC20A1-201, Transcript of solute carrier family 20 member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC20A1, Length 3,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A1-201ENST00000272542 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.18■□□□□ 0.82
SLC20A1-201ENST00000272542 FAM135BQ49AJ0 1406 aa20.18■□□□□ 0.82
SLC20A1-201ENST00000272542 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.18■□□□□ 0.82
SLC20A1-201ENST00000272542 UBR1Q8IWV7 1749 aa20.18■□□□□ 0.82
SLC20A1-201ENST00000272542 FOXO3O43524 673 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC20A1-201ENST00000272542 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SLC20A1-201ENST00000272542 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC20A1-201ENST00000272542 KIF20BQ96Q89 1820 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC20A1-201ENST00000272542 MYT1Q01538 1121 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC20A1-201ENST00000272542 SIRT1Q96EB6 747 aa20.16■□□□□ 0.82
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SLC20A1-201ENST00000272542 TECPR2O15040 1411 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC20A1-201ENST00000272542 VAMP4O75379 141 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC20A1-201ENST00000272542 PLEKHG3A1L390 1219 aa20.12■□□□□ 0.81
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SLC20A1-201ENST00000272542 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SLC20A1-201ENST00000272542 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa20.12■□□□□ 0.81
SLC20A1-201ENST00000272542 IL16Q14005 1332 aa20.12■□□□□ 0.81
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SLC20A1-201ENST00000272542 TBX22Q9Y458 520 aa20.12■□□□□ 0.81
SLC20A1-201ENST00000272542 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
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SLC20A1-201ENST00000272542 GNAI1P63096 354 aa20.09■□□□□ 0.81
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SLC20A1-201ENST00000272542 CFAP44Q96MT7 982 aa20.07■□□□□ 0.8
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SLC20A1-201ENST00000272542 ABTB2Q8N961 1025 aa20.06■□□□□ 0.8
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SLC20A1-201ENST00000272542 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF853P0CG23 659 aa20.06■□□□□ 0.8
SLC20A1-201ENST00000272542 USHBP1Q8N6Y0 703 aa20.06■□□□□ 0.8
SLC20A1-201ENST00000272542 LNPKQ9C0E8 428 aa20.06■□□□□ 0.8
SLC20A1-201ENST00000272542 C3P01024 1663 aa20.05■□□□□ 0.8
SLC20A1-201ENST00000272542 KIF16BQ96L93 1317 aa20.04■□□□□ 0.8
SLC20A1-201ENST00000272542 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
SLC20A1-201ENST00000272542 USP19O94966 1318 aa20.04■□□□□ 0.8
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SLC20A1-201ENST00000272542 NECTIN2Q92692 538 aa20.03■□□□□ 0.8
SLC20A1-201ENST00000272542 EYA1Q99502 592 aa20.03■□□□□ 0.8
SLC20A1-201ENST00000272542 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.02■□□□□ 0.8
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SLC20A1-201ENST00000272542 OVOS2Q6IE36 1432 aa20.01■□□□□ 0.79
SLC20A1-201ENST00000272542 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.01■□□□□ 0.79
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SLC20A1-201ENST00000272542 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa19.98■□□□□ 0.79
SLC20A1-201ENST00000272542 DDRGK1Q96HY6 314 aa19.98■□□□□ 0.79
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SLC20A1-201ENST00000272542 ANKRD45Q5TZF3 282 aa19.97■□□□□ 0.79
SLC20A1-201ENST00000272542 ITSN1Q15811 1721 aa19.97■□□□□ 0.79
SLC20A1-201ENST00000272542 KNDC1Q76NI1 1749 aa19.97■□□□□ 0.79
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SLC20A1-201ENST00000272542 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa19.96■□□□□ 0.79
SLC20A1-201ENST00000272542 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
SLC20A1-201ENST00000272542 SSH2Q76I76 1423 aa19.95■□□□□ 0.78
SLC20A1-201ENST00000272542 AKAP12Q02952 1782 aa19.95■□□□□ 0.78
SLC20A1-201ENST00000272542 ORAI2Q96SN7 254 aa19.95■□□□□ 0.78
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SLC20A1-201ENST00000272542 PEAK1Q9H792 1746 aa19.94■□□□□ 0.78
SLC20A1-201ENST00000272542 DLG5Q8TDM6 1919 aa19.94■□□□□ 0.78
SLC20A1-201ENST00000272542 SLC4A2P04920 1241 aa19.94■□□□□ 0.78
SLC20A1-201ENST00000272542 G2E3Q7L622 706 aa19.94■□□□□ 0.78
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SLC20A1-201ENST00000272542 SLIT1O75093 1534 aa19.94■□□□□ 0.78
SLC20A1-201ENST00000272542 SLC4A10Q6U841 1118 aa19.94■□□□□ 0.78
SLC20A1-201ENST00000272542 SMC5Q8IY18 1101 aa19.94■□□□□ 0.78
SLC20A1-201ENST00000272542 PHF8Q9UPP1 1060 aa19.94■□□□□ 0.78
SLC20A1-201ENST00000272542 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
SLC20A1-201ENST00000272542 HOXC9P31274 260 aa19.93■□□□□ 0.78
SLC20A1-201ENST00000272542 USP31Q70CQ4 1352 aa19.93■□□□□ 0.78
SLC20A1-201ENST00000272542 DIP2AQ14689 1571 aa19.92■□□□□ 0.78
SLC20A1-201ENST00000272542 PSME1Q06323 249 aa19.92■□□□□ 0.78
SLC20A1-201ENST00000272542 TTC21AQ8NDW8 1320 aa19.92■□□□□ 0.78
SLC20A1-201ENST00000272542 FLT4P35916 1363 aa19.91■□□□□ 0.78
SLC20A1-201ENST00000272542 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
SLC20A1-201ENST00000272542 CHD1LQ86WJ1 897 aa19.9■□□□□ 0.78
SLC20A1-201ENST00000272542 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.78
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