RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PANX1-201ENST00000227638 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PANX1-201ENST00000227638 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PANX1-201ENST00000227638 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PANX1-201ENST00000227638 KIF16BQ96L93 1317 aa22.81■■□□□ 1.24
PANX1-201ENST00000227638 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.81■■□□□ 1.24
PANX1-201ENST00000227638 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PANX1-201ENST00000227638 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PANX1-201ENST00000227638 AGLP35573 1532 aa22.81■■□□□ 1.24
PANX1-201ENST00000227638 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PANX1-201ENST00000227638 AAMPQ13685 434 aa22.8■■□□□ 1.24
PANX1-201ENST00000227638 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PANX1-201ENST00000227638 MCM10Q7L590 875 aa22.79■■□□□ 1.24
PANX1-201ENST00000227638 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.79■■□□□ 1.24
PANX1-201ENST00000227638 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.79■■□□□ 1.24
PANX1-201ENST00000227638 IL16Q14005 1332 aa22.79■■□□□ 1.24
PANX1-201ENST00000227638 PANK2Q9BZ23 570 aa22.78■■□□□ 1.24
PANX1-201ENST00000227638 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PANX1-201ENST00000227638 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.76■■□□□ 1.23
PANX1-201ENST00000227638 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.75■■□□□ 1.23
PANX1-201ENST00000227638 MCM4P33991 863 aa22.75■■□□□ 1.23
PANX1-201ENST00000227638 COG3Q96JB2 828 aa22.75■■□□□ 1.23
PANX1-201ENST00000227638 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PANX1-201ENST00000227638 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.74■■□□□ 1.23
PANX1-201ENST00000227638 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.74■■□□□ 1.23
PANX1-201ENST00000227638 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.74■■□□□ 1.23
PANX1-201ENST00000227638 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.74■■□□□ 1.23
PANX1-201ENST00000227638 REREQ9P2R6 1566 aa22.74■■□□□ 1.23
PANX1-201ENST00000227638 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.73■■□□□ 1.23
PANX1-201ENST00000227638 FOXO3O43524 673 aa22.73■■□□□ 1.23
PANX1-201ENST00000227638 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.73■■□□□ 1.23
PANX1-201ENST00000227638 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.73■■□□□ 1.23
PANX1-201ENST00000227638 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PANX1-201ENST00000227638 HSCBQ8IWL3 235 aa22.72■■□□□ 1.23
PANX1-201ENST00000227638 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.72■■□□□ 1.23
PANX1-201ENST00000227638 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.72■■□□□ 1.23
PANX1-201ENST00000227638 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PANX1-201ENST00000227638 CPS1P31327 1500 aa22.72■■□□□ 1.23
PANX1-201ENST00000227638 LTKP29376 864 aa22.72■■□□□ 1.23
PANX1-201ENST00000227638 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
PANX1-201ENST00000227638 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PANX1-201ENST00000227638 MED14O60244 1454 aa22.71■■□□□ 1.23
PANX1-201ENST00000227638 TNRQ92752 1358 aa22.71■■□□□ 1.23
PANX1-201ENST00000227638 GNAI1P63096 354 aa22.71■■□□□ 1.23
PANX1-201ENST00000227638 KIF2CQ99661 725 aa22.7■■□□□ 1.22
PANX1-201ENST00000227638 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.7■■□□□ 1.22
PANX1-201ENST00000227638 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PANX1-201ENST00000227638 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.69■■□□□ 1.22
PANX1-201ENST00000227638 ZNF853P0CG23 659 aa22.68■■□□□ 1.22
PANX1-201ENST00000227638 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PANX1-201ENST00000227638 DLC1Q96QB1 1528 aa22.68■■□□□ 1.22
PANX1-201ENST00000227638 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PANX1-201ENST00000227638 IFT57Q9NWB7 429 aa22.68■■□□□ 1.22
PANX1-201ENST00000227638 TRAK2O60296 914 aa22.67■■□□□ 1.22
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PANX1-201ENST00000227638 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.67■■□□□ 1.22
PANX1-201ENST00000227638 ATP7BP35670 1465 aa22.67■■□□□ 1.22
PANX1-201ENST00000227638 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PANX1-201ENST00000227638 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
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PANX1-201ENST00000227638 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PANX1-201ENST00000227638 F6X3S4 739 aa22.65■■□□□ 1.22
PANX1-201ENST00000227638 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.65■■□□□ 1.22
PANX1-201ENST00000227638 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.65■■□□□ 1.22
PANX1-201ENST00000227638 PLEKHG5O94827 1062 aa22.65■■□□□ 1.22
PANX1-201ENST00000227638 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
PANX1-201ENST00000227638 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
PANX1-201ENST00000227638 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.64■■□□□ 1.22
PANX1-201ENST00000227638 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
PANX1-201ENST00000227638 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.63■■□□□ 1.21
PANX1-201ENST00000227638 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.63■■□□□ 1.21
PANX1-201ENST00000227638 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PANX1-201ENST00000227638 ABCC4O15439 1325 aa22.63■■□□□ 1.21
PANX1-201ENST00000227638 MEIS3Q99687 375 aa22.62■■□□□ 1.21
PANX1-201ENST00000227638 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PANX1-201ENST00000227638 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PANX1-201ENST00000227638 G2E3Q7L622 706 aa22.61■■□□□ 1.21
PANX1-201ENST00000227638 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.61■■□□□ 1.21
PANX1-201ENST00000227638 ACEP12821 1306 aa22.61■■□□□ 1.21
PANX1-201ENST00000227638 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.61■■□□□ 1.21
PANX1-201ENST00000227638 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.6■■□□□ 1.21
PANX1-201ENST00000227638 GCC1Q96CN9 775 aa22.59■■□□□ 1.21
PANX1-201ENST00000227638 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.58■■□□□ 1.21
PANX1-201ENST00000227638 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.58■■□□□ 1.21
PANX1-201ENST00000227638 SLC4A2P04920 1241 aa22.57■■□□□ 1.2
PANX1-201ENST00000227638 SSFA2P28290 1259 aa22.57■■□□□ 1.2
PANX1-201ENST00000227638 PTCH1Q13635 1447 aa22.56■■□□□ 1.2
PANX1-201ENST00000227638 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.56■■□□□ 1.2
PANX1-201ENST00000227638 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PANX1-201ENST00000227638 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.55■■□□□ 1.2
PANX1-201ENST00000227638 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PANX1-201ENST00000227638 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.55■■□□□ 1.2
PANX1-201ENST00000227638 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.55■■□□□ 1.2
PANX1-201ENST00000227638 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PANX1-201ENST00000227638 PKP1Q13835 747 aa22.55■■□□□ 1.2
PANX1-201ENST00000227638 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.55■■□□□ 1.2
PANX1-201ENST00000227638 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PANX1-201ENST00000227638 MSH6P52701 1360 aa22.54■■□□□ 1.2
PANX1-201ENST00000227638 DDIT3P35638 169 aa22.54■■□□□ 1.2
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