RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000176304.7

Syne4-208, Transcript of Nesprin-4, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Syne4, Length 1,006 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4-208ENSMUST00000176304 OptnQ8K3K8 584 aa22.2■■□□□ 1.14
Syne4-208ENSMUST00000176304 Slc4a1apE9PX68 744 aa22.19■■□□□ 1.14
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
Syne4-208ENSMUST00000176304 Slit1Q80TR4 1531 aa22.18■■□□□ 1.14
Syne4-208ENSMUST00000176304 Vps33bP59016 617 aa22.18■■□□□ 1.14
Syne4-208ENSMUST00000176304 Lrit1Q8K099 624 aa22.17■■□□□ 1.14
Syne4-208ENSMUST00000176304 GalcP54818 684 aa22.16■■□□□ 1.14
Syne4-208ENSMUST00000176304 Zcrb1Q9CZ96 217 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
Syne4-208ENSMUST00000176304 Zpr1Q62384 459 aa22.15■■□□□ 1.14
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ppfibp2O35711 882 aa22.14■■□□□ 1.13
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ezh2Q61188 746 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
Syne4-208ENSMUST00000176304 Plekhd1B2RPU2 505 aa22.12■■□□□ 1.13
Syne4-208ENSMUST00000176304 Birc3O08863 600 aa22.12■■□□□ 1.13
Syne4-208ENSMUST00000176304 Sik1Q60670 779 aa22.12■■□□□ 1.13
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ginm1Q91WR6 327 aa22.12■■□□□ 1.13
Syne4-208ENSMUST00000176304 Mst1rQ62190 1378 aa22.12■■□□□ 1.13
Syne4-208ENSMUST00000176304 Vars2Q3U2A8 1060 aa22.1■■□□□ 1.13
Syne4-208ENSMUST00000176304 Zranb3Q6NZP1 1069 aa22.1■■□□□ 1.13
Syne4-208ENSMUST00000176304 Hoxc9P09633 260 aa22.09■■□□□ 1.13
Syne4-208ENSMUST00000176304 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa22.09■■□□□ 1.13
Syne4-208ENSMUST00000176304 Erbb3Q61526 1339 aa22.08■■□□□ 1.13
Syne4-208ENSMUST00000176304 Snapc4Q8BP86 1333 aa22.08■■□□□ 1.13
Syne4-208ENSMUST00000176304 Exoc5Q3TPX4 708 aa22.08■■□□□ 1.13
Syne4-208ENSMUST00000176304 Bsdc1Q80Y55 427 aa22.08■■□□□ 1.13
Syne4-208ENSMUST00000176304 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
Syne4-208ENSMUST00000176304 Col15a1O35206 1367 aa22.05■■□□□ 1.12
Syne4-208ENSMUST00000176304 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
Syne4-208ENSMUST00000176304 Pnpla7A2AJ88 1352 aa22.04■■□□□ 1.12
Syne4-208ENSMUST00000176304 Fam184bQ0KK56 942 aa22.04■■□□□ 1.12
Syne4-208ENSMUST00000176304 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
Syne4-208ENSMUST00000176304 TkfcQ8VC30 578 aa22.03■■□□□ 1.12
Syne4-208ENSMUST00000176304 Kcnh4A2A5F7 1018 aa22.02■■□□□ 1.12
Syne4-208ENSMUST00000176304 Gm10471E9Q1C7 252 aa22.02■■□□□ 1.12
Syne4-208ENSMUST00000176304 PsdQ5DTT2 1024 aa22.02■■□□□ 1.12
Syne4-208ENSMUST00000176304 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa22.02■■□□□ 1.12
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
Syne4-208ENSMUST00000176304 Arhgap33Q80YF9 1305 aa22.02■■□□□ 1.12
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ptpn23Q6PB44 1692 aa22.01■■□□□ 1.11
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ccne1Q61457 408 aa22.01■■□□□ 1.11
Syne4-208ENSMUST00000176304 Arfgef2A2A5R2 1792 aa22.01■■□□□ 1.11
Syne4-208ENSMUST00000176304 Nsd3Q6P2L6 1439 aa21.99■■□□□ 1.11
Syne4-208ENSMUST00000176304 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
Syne4-208ENSMUST00000176304 Pim2Q62070 370 aa21.98■■□□□ 1.11
Syne4-208ENSMUST00000176304 Parp14Q2EMV9 1817 aa21.98■■□□□ 1.11
Syne4-208ENSMUST00000176304 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa21.98■■□□□ 1.11
Syne4-208ENSMUST00000176304 PrxO55103 1391 aa21.98■■□□□ 1.11
Syne4-208ENSMUST00000176304 Pank3Q8R2W9 370 aa21.97■■□□□ 1.11
Syne4-208ENSMUST00000176304 Fam50bQ9WTJ8 334 aa21.97■■□□□ 1.11
Syne4-208ENSMUST00000176304 Q8BT18 775 aa21.96■■□□□ 1.11
Syne4-208ENSMUST00000176304 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
Syne4-208ENSMUST00000176304 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ccdc85cE9Q6B2 420 aa21.95■■□□□ 1.1
Syne4-208ENSMUST00000176304 Hoxb7P09024 217 aa21.95■■□□□ 1.1
Syne4-208ENSMUST00000176304 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
Syne4-208ENSMUST00000176304 Dcaf11Q91VU6 549 aa21.94■■□□□ 1.1
Syne4-208ENSMUST00000176304 Tmf1B9EKI3 1091 aa21.93■■□□□ 1.1
Syne4-208ENSMUST00000176304 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa21.92■■□□□ 1.1
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ciz1Q8VEH2 845 aa21.92■■□□□ 1.1
Syne4-208ENSMUST00000176304 Inpp5dQ9ES52 1191 aa21.92■■□□□ 1.1
Syne4-208ENSMUST00000176304 En2P09066 324 aa21.9■■□□□ 1.1
Syne4-208ENSMUST00000176304 Aplp2Q06335 707 aa21.9■■□□□ 1.1
Syne4-208ENSMUST00000176304 Abca3Q8R420 1704 aa21.89■■□□□ 1.1
Syne4-208ENSMUST00000176304 Speer4bQ9D9F7 267 aa21.88■■□□□ 1.09
Syne4-208ENSMUST00000176304 Magea1O89006 320 aa21.87■■□□□ 1.09
Syne4-208ENSMUST00000176304 Magea5O89009 320 aa21.87■■□□□ 1.09
Syne4-208ENSMUST00000176304 Rad17Q6NXW6 688 aa21.87■■□□□ 1.09
Syne4-208ENSMUST00000176304 Magea2Q9R2A2 320 aa21.87■■□□□ 1.09
Syne4-208ENSMUST00000176304 Kdm6aO70546 1401 aa21.87■■□□□ 1.09
Syne4-208ENSMUST00000176304 Simc1E9Q6E9 1354 aa21.87■■□□□ 1.09
Syne4-208ENSMUST00000176304 Gpr150Q8BL07 427 aa21.86■■□□□ 1.09
Syne4-208ENSMUST00000176304 NefmP08553 848 aa21.85■■□□□ 1.09
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ankrd13dQ6PD24 605 aa21.85■■□□□ 1.09
Syne4-208ENSMUST00000176304 Sos2Q02384 1333 aa21.84■■□□□ 1.09
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa21.84■■□□□ 1.09
Syne4-208ENSMUST00000176304 Shank3Q4ACU6 1730 aa21.83■■□□□ 1.09
Syne4-208ENSMUST00000176304 Kif23E9Q5G3 953 aa21.82■■□□□ 1.08
Syne4-208ENSMUST00000176304 Larp1Q6ZQ58 1072 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
Syne4-208ENSMUST00000176304 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa21.81■■□□□ 1.08
Syne4-208ENSMUST00000176304 Eya1P97767 591 aa21.8■■□□□ 1.08
Syne4-208ENSMUST00000176304 ThemisQ8BGW0 636 aa21.8■■□□□ 1.08
Syne4-208ENSMUST00000176304 Eif4a2P10630 407 aa21.79■■□□□ 1.08
Syne4-208ENSMUST00000176304 Zscan10Q3URR7 782 aa21.79■■□□□ 1.08
Syne4-208ENSMUST00000176304 Rps6ka4Q9Z2B9 773 aa21.78■■□□□ 1.08
Syne4-208ENSMUST00000176304 Fam198bQ3UPI1 517 aa21.77■■□□□ 1.08
Syne4-208ENSMUST00000176304 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa21.77■■□□□ 1.08
Syne4-208ENSMUST00000176304 ApobrQ8VBT6 942 aa21.76■■□□□ 1.07
Syne4-208ENSMUST00000176304 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa21.76■■□□□ 1.07
Syne4-208ENSMUST00000176304 AtrnQ9WU60 1428 aa21.75■■□□□ 1.07
Syne4-208ENSMUST00000176304 Klc3Q91W40 508 aa21.75■■□□□ 1.07
Syne4-208ENSMUST00000176304 PappaQ8R4K8 1624 aa21.75■■□□□ 1.07
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ubxn2bQ0KL01 331 aa21.74■■□□□ 1.07
Syne4-208ENSMUST00000176304 Akt1s1Q9D1F4 257 aa21.74■■□□□ 1.07
Syne4-208ENSMUST00000176304 Kcna3P16390 528 aa21.73■■□□□ 1.07
Syne4-208ENSMUST00000176304 Kcnq2Q9Z351 759 aa21.73■■□□□ 1.07
Syne4-208ENSMUST00000176304 MpripP97434 1024 aa21.72■■□□□ 1.07
Syne4-208ENSMUST00000176304 ClspnQ80YR7 1315 aa21.72■■□□□ 1.07
Syne4-208ENSMUST00000176304 Trpc5Q9QX29 975 aa21.71■■□□□ 1.07
Syne4-208ENSMUST00000176304 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
Syne4-208ENSMUST00000176304 Trim28Q62318 834 aa21.7■■□□□ 1.06
Syne4-208ENSMUST00000176304 Rsph6aQ8CDR2 708 aa21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.9 ms