RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000142312.2

Hoxd11-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd11, Length 1,111 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Zeb2Q9R0G7 1215 aa29.16■■■□□ 2.26
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa29.14■■■□□ 2.25
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Fmnl2A2APV2 1086 aa29.13■■■□□ 2.25
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Card10P58660 1021 aa29.13■■■□□ 2.25
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ano8Q6PB70 1060 aa29.12■■■□□ 2.25
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Map2P20357 1828 aa29.12■■■□□ 2.25
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa29.12■■■□□ 2.25
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 TatQ8QZR1 454 aa29.11■■■□□ 2.25
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 GalcP54818 684 aa29.1■■■□□ 2.25
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Dcaf11Q91VU6 549 aa29.1■■■□□ 2.25
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Dnajc10Q9DC23 793 aa29.1■■■□□ 2.25
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 TnrQ8BYI9 1358 aa29.1■■■□□ 2.25
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Slx1bQ8BX32 270 aa29.09■■■□□ 2.25
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Zscan10Q3URR7 782 aa29.08■■■□□ 2.25
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ccdc85cE9Q6B2 420 aa29.07■■■□□ 2.24
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Amotl2Q8K371 772 aa29.07■■■□□ 2.24
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 GakQ99KY4 1305 aa29.07■■■□□ 2.24
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 FancaQ9JL70 1439 aa29.05■■■□□ 2.24
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa29.05■■■□□ 2.24
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Akap11E9Q777 1895 aa29.05■■■□□ 2.24
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Hoxb7P09024 217 aa29.04■■■□□ 2.24
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Vars2Q3U2A8 1060 aa29.04■■■□□ 2.24
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Birc3O08863 600 aa29.03■■■□□ 2.24
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Zcrb1Q9CZ96 217 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ubxn2bQ0KL01 331 aa29.02■■■□□ 2.24
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Lrit1Q8K099 624 aa29.02■■■□□ 2.24
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ppef1O35655 650 aa29■■■□□ 2.23
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Yy1Q00899 414 aa29■■■□□ 2.23
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Nwd2Q6P5U7 1742 aa29■■■□□ 2.23
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Snapc4Q8BP86 1333 aa28.99■■■□□ 2.23
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Zcwpw1Q6IR42 630 aa28.97■■■□□ 2.23
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Erbb3Q61526 1339 aa28.94■■■□□ 2.22
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ppfibp2O35711 882 aa28.94■■■□□ 2.22
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Kcnq2Q9Z351 759 aa28.94■■■□□ 2.22
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Rad17Q6NXW6 688 aa28.93■■■□□ 2.22
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Tmem132eQ6IEE6 982 aa28.92■■■□□ 2.22
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ankrd23Q812A3 306 aa28.92■■■□□ 2.22
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 RgmbQ7TQ33 436 aa28.9■■■□□ 2.22
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Hoxc9P09633 260 aa28.89■■■□□ 2.22
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Vps33bP59016 617 aa28.89■■■□□ 2.22
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Wdr66E9Q743 1299 aa28.88■■■□□ 2.21
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 FocadA2AKG8 1798 aa28.86■■■□□ 2.21
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 CrklP47941 303 aa28.86■■■□□ 2.21
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Pim2Q62070 370 aa28.86■■■□□ 2.21
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 OptnQ8K3K8 584 aa28.85■■■□□ 2.21
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Plekhd1B2RPU2 505 aa28.84■■■□□ 2.21
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Slit1Q80TR4 1531 aa28.83■■■□□ 2.21
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ptpn23Q6PB44 1692 aa28.83■■■□□ 2.21
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa28.81■■■□□ 2.2
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Pak3Q61036 559 aa28.81■■■□□ 2.2
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Igf2rQ07113 2483 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Lrp5Q91VN0 1614 aa28.8■■■□□ 2.2
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 TkfcQ8VC30 578 aa28.8■■■□□ 2.2
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Zpr1Q62384 459 aa28.78■■■□□ 2.2
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ccne1Q61457 408 aa28.77■■■□□ 2.2
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Bsdc1Q80Y55 427 aa28.77■■■□□ 2.2
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa28.77■■■□□ 2.2
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Arhgap33Q80YF9 1305 aa28.74■■■□□ 2.19
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Trim28Q62318 834 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Parp14Q2EMV9 1817 aa28.73■■■□□ 2.19
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Kif23E9Q5G3 953 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Zranb3Q6NZP1 1069 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ginm1Q91WR6 327 aa28.71■■■□□ 2.19
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Trpc5Q9QX29 975 aa28.71■■■□□ 2.19
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Col15a1O35206 1367 aa28.71■■■□□ 2.19
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ppp1r15aP17564 657 aa28.7■■■□□ 2.18
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Q8BT18 775 aa28.7■■■□□ 2.18
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Exoc5Q3TPX4 708 aa28.69■■■□□ 2.18
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Rnf180Q3U827 592 aa28.68■■■□□ 2.18
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Sik1Q60670 779 aa28.68■■■□□ 2.18
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ciz1Q8VEH2 845 aa28.68■■■□□ 2.18
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Zdbf2Q5SS00 2493 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Nsd3Q6P2L6 1439 aa28.68■■■□□ 2.18
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 AtrnQ9WU60 1428 aa28.68■■■□□ 2.18
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Mst1rQ62190 1378 aa28.66■■■□□ 2.18
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Kdm6aO70546 1401 aa28.66■■■□□ 2.18
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Gm10471E9Q1C7 252 aa28.65■■■□□ 2.18
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Eif4a2P10630 407 aa28.65■■■□□ 2.18
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa28.65■■■□□ 2.18
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa28.64■■■□□ 2.18
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Egfem1Q8C088 590 aa28.64■■■□□ 2.18
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Pnpla7A2AJ88 1352 aa28.63■■■□□ 2.17
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Hirip3Q8BLH7 601 aa28.63■■■□□ 2.17
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Zfp777B9EKF4 885 aa28.62■■■□□ 2.17
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Rad23bP54728 416 aa28.61■■■□□ 2.17
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Rsph6aQ8CDR2 708 aa28.61■■■□□ 2.17
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Eya1P97767 591 aa28.6■■■□□ 2.17
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Akt1s1Q9D1F4 257 aa28.6■■■□□ 2.17
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Simc1E9Q6E9 1354 aa28.6■■■□□ 2.17
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Fchsd2Q3USJ8 740 aa28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.8 ms