RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028972.8

Pdrg1-201, Transcript of p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdrg1, Length 1,273 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Zpr1Q62384 459 aa22.7■■□□□ 1.22
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Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Ccne1Q61457 408 aa22.68■■□□□ 1.22
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Kat6bQ8BRB7 1872 aa22.68■■□□□ 1.22
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Pdrg1-201ENSMUST00000028972 FocadA2AKG8 1798 aa22.66■■□□□ 1.22
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Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Col22a1E9Q7P1 1613 aa22.65■■□□□ 1.22
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Taok3Q8BYC6 898 aa22.65■■□□□ 1.22
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Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Trim28Q62318 834 aa22.63■■□□□ 1.21
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Col15a1O35206 1367 aa22.63■■□□□ 1.21
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Tnks1bp1P58871 1720 aa22.62■■□□□ 1.21
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Akap11E9Q777 1895 aa22.62■■□□□ 1.21
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Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa22.57■■□□□ 1.2
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Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Simc1E9Q6E9 1354 aa22.55■■□□□ 1.2
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Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Rsph6aQ8CDR2 708 aa22.55■■□□□ 1.2
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Zfp777B9EKF4 885 aa22.54■■□□□ 1.2
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Eya1P97767 591 aa22.54■■□□□ 1.2
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Exoc5Q3TPX4 708 aa22.54■■□□□ 1.2
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Nlrp6Q91WS2 869 aa22.54■■□□□ 1.2
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Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Ppfibp2O35711 882 aa22.41■■□□□ 1.18
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Tsen2Q6P7W5 460 aa22.41■■□□□ 1.18
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Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Nsd3Q6P2L6 1439 aa22.39■■□□□ 1.17
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Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
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Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Stk31Q99MW1 1018 aa22.32■■□□□ 1.16
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Amotl1Q9D4H4 968 aa22.32■■□□□ 1.16
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Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Pnpla7A2AJ88 1352 aa22.31■■□□□ 1.16
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