RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 MARK3P27448 753 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 OXTRP30559 389 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 NR1H2P55055 460 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 SPCS3P61009 180 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 DSC1Q08554 894 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM132BQ14DG7 1078 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 TAF5Q15542 800 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 KRTCAP3Q53RY4 240 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 UBE2UQ5VVX9 321 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 RNF43Q68DV7 783 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 RETSATQ6NUM9 610 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 C5orf46Q6UWT4 87 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 NLRC3Q7RTR2 1065 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 GPC2Q8N158 579 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 CLIP4Q8N3C7 705 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 ARL14Q8N4G2 192 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 TCP10LQ8TDR4 215 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 HEXDCQ8WVB3 486 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 CLEC4DQ8WXI8 215 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 KCTD13Q8WZ19 329 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 PDXPQ96GD0 296 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 WNK4Q96J92 1243 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 RASSF1Q9NS23 344 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 COL20A1Q9P218 1284 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 CDH7Q9ULB5 785 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 C2orf74A8MZ97 194 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 DNTTP04053 509 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 HRGP04196 525 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 QDPRP09417 244 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 CCND2P30279 289 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 NR4A2P43354 598 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 P2RY4P51582 365 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 SP4Q02446 784 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 CREB5Q02930 508 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 CHAF1BQ13112 559 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 CALCOCO2Q13137 446 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 CLN3Q13286 438 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 PMS2P3Q13401 168 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 KRT81Q14533 505 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 CDK10Q15131 360 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 TKFCQ3LXA3 575 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 FIGNQ5HY92 759 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 GARNL3Q5VVW2 1013 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 RAB12Q6IQ22 244 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 OGFOD3Q6PK18 319 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 UGT2A3Q6UWM9 527 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 PRR23BQ6ZRT6 265 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 RNF180Q86T96 592 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 KRT73Q86Y46 540 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 MICU2Q8IYU8 434 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 CNTD1Q8N815 330 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 LEMD2Q8NC56 503 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 GSTCDQ8NEC7 633 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 OR4D10Q8NGI6 311 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 PIK3R3Q92569 461 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 FBXW5Q969U6 566 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 TAAR1Q96RJ0 339 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 PRDM9Q9NQV7 894 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 A0A1W2PQJ5 194 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 C12orf71A8MTZ7 269 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 FAM25AB3EWG3 89 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 FAM25CB3EWG5 89 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 FAM25GB3EWG6 89 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 CLIC2O15247 247 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 GMDSO60547 372 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 CBR3O75828 277 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 GOSR1O95249 250 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 CRTAMO95727 393 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 NR3C1P04150 777 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 UQCRBP14927 111 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 FECHP22830 423 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-201ENST00000325897 NAMPTP43490 491 aa4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms