RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 SYPP08247 313 aa19.38■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 ZNF75DP51815 510 aa19.38■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa19.38■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 FAM71BQ8TC56 605 aa19.38■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 ARRDC3Q96B67 414 aa19.38■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 HDAC8Q9BY41 377 aa19.38■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa19.38■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 SLC39A8Q9C0K1 460 aa19.38■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 ZWILCHQ9H900 591 aa19.38■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 EBF2Q9HAK2 575 aa19.38■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 FSCN3Q9NQT6 498 aa19.38■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa19.38■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 LCMT1Q9UIC8 334 aa19.38■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 PCDH15Q96QU1 1955 aa19.37■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 A0A1W2PPC4 97 aa19.37■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 FAM47DPA6NHR8 397 aa19.37■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 DAPK3O43293 454 aa19.37■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 LATO43561 262 aa19.37■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 LEFTY1O75610 366 aa19.37■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 PROSCO94903 275 aa19.37■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 TAS2R38P59533 333 aa19.37■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 BNC1Q01954 994 aa19.37■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 CCDC15Q0P6D6 951 aa19.37■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 SMTNL2Q2TAL5 461 aa19.37■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 POM121L1PQ3SYA9 428 aa19.37■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa19.37■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 LEKR1Q6ZMV7 388 aa19.37■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 OR2AP1Q8NGE2 309 aa19.37■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 TSC1Q92574 1164 aa19.37■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 LRIG1Q96JA1 1093 aa19.37■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 PDFQ9HBH1 243 aa19.37■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 TM9SF3Q9HD45 589 aa19.37■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 SPTLC3Q9NUV7 552 aa19.37■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 TBC1D3EA0A087X179 549 aa19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 ARHGAP42A6NI28 874 aa19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 TBC1D3LB9A6J9 549 aa19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 H3BRJ5 948 aa19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 PRAMEF11O60813 436 aa19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 TMCC1O94876 653 aa19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 POP4O95707 220 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 TBC1D3HP0C7X1 549 aa19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 DNA2P51530 1060 aa19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 ARSEP51690 589 aa19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 CYTH1Q15438 398 aa19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 MYLK3Q32MK0 819 aa19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 LZTR1Q8N653 840 aa19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 SLC35G2Q8TBE7 412 aa19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 SNX19Q92543 992 aa19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 HSPH1Q92598 858 aa19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 CSPG4P5Q96PW8 444 aa19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 TM6SF2Q9BZW4 377 aa19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 PCDH18Q9HCL0 1135 aa19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 INTUQ9ULD6 942 aa19.36■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 CACNA1EQ15878 2313 aa19.35■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 J3KR12 359 aa19.35■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 GJB3O75712 270 aa19.35■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 MTA2O94776 668 aa19.35■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 IL4RP24394 825 aa19.35■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 ARL4AP40617 200 aa19.35■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 TCEAL1Q15170 157 aa19.35■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 HADHQ16836 314 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 NEK5Q6P3R8 708 aa19.35■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 TRIM69Q86WT6 500 aa19.35■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 ZNF354CQ86Y25 554 aa19.35■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 CPNE8Q86YQ8 564 aa19.35■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 NPWQ8N729 165 aa19.35■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa19.35■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 PPP1R16AQ96I34 528 aa19.35■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 PREBQ9HCU5 417 aa19.35■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP19.35■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa19.35■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 CACNA1AO00555 2505 aa19.35■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 UPK3BL1B0FP48 263 aa19.34■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 UPK3BL2E5RIL1 263 aa19.34■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 LCA5LO95447 670 aa19.34■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 AMPD1P23109 780 aa19.34■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 ITGB7P26010 798 aa19.34■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 MAN1A1P33908 653 aa19.34■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 NUDT1P36639 197 aa19.34■□□□□ 0.69
NISCH-209ENST00000485765 MAPK8P45983 427 aa19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.3 ms