RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336057.9

HDAC5-202, Transcript of histone deacetylase 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDAC5, Length 5,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5-202ENST00000336057 ITGB6P18564 788 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 CD86P42081 329 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 HALP42357 657 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 GBE1Q04446 702 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 C1orf127Q8N9H9 656 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 NETO2Q8NC67 525 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 STAG3L4Q8TBR4 150 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 GLMNQ92990 594 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 C7orf26Q96N11 449 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 XPR1Q9UBH6 696 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 ABCC6O95255 1503 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 C5orf60A6NFR6 353 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 TSPAN3O60637 253 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 FAM50BQ9Y247 325 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 A0A087WXM4 84 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 CABYRO75952 493 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 PDK3Q15120 406 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 TREML2Q5T2D2 321 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 MILR1Q7Z6M3 343 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 STK32CQ86UX6 486 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 LRRC49Q8IUZ0 686 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 EFCAB3Q8N7B9 438 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 TFAP2BQ92481 460 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 GRIP2Q9C0E4 1043 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 CDH19Q9H159 772 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 CNGB3Q9NQW8 809 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 MARCH2Q9P0N8 246 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 MGAT4DA6NG13 374 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 CLDN5O00501 218 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 CD48P09326 243 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 TFEBP19484 476 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 USP4Q13107 963 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 SEPT8Q92599 483 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 AIF1P55008 147 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 CTBP1Q13363 440 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 BFSP2Q13515 415 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 DEPDC1Q5TB30 811 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 ISLR2Q6UXK2 745 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 TTC7BQ86TV6 843 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 TTC30AQ86WT1 665 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 CPNE8Q86YQ8 564 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 CAMK1DQ8IU85 385 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 ATG16L2Q8NAA4 619 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 FBXO5Q9UKT4 447 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 TRIM38O00635 465 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 MGRN1O60291 552 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 ICAM3P32942 547 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 INSCQ1MX18 579 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 C9orf57Q5W0N0 161 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 FAM45BPQ6NSW5 357 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 FBXW8Q8N3Y1 598 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 GSTCDQ8NEC7 633 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 FAM45AQ8TCE6 357 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 RCN3Q96D15 328 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 ADAM2Q99965 735 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 UGT2B28Q9BY64 529 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 EPS8L2Q9H6S3 715 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 ZNF112Q9UJU3 913 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 IL5RAQ01344 420 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 GPSM1Q86YR5 675 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 YAF2Q8IY57 180 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 TOP6BLQ8N6T0 577 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 SPAG4Q9NPE6 437 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 LIMD1Q9UGP4 676 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 ZNF180Q9UJW8 692 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 GSTT1P30711 240 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 IL2P60568 153 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 NDNQ99608 321 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 COPG2Q9UBF2 871 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 SLC25A13Q9UJS0 675 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 ZNF839A8K0R7 811 aa15.92■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 SEC22BO75396 215 aa15.92■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 ARIH2O95376 493 aa15.92■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 FGFR3P22607 806 aa15.92■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 PIK3R1P27986 724 aa15.92■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 ZNF284Q2VY69 593 aa15.92■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa15.92■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 STX19Q8N4C7 294 aa15.92■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa15.92■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 C2orf71A6NGG8 1288 aa15.92■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 POTEHQ6S545 545 aa15.92■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa15.92■□□□□ 0.14
HDAC5-202ENST00000336057 EID3Q8N140 333 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116.8 ms