RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 CCT7Q99832 543 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 RMND5AQ9H871 391 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 VTI1BQ9UEU0 232 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 ACTL7BQ9Y614 415 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 F8W810 466 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 M0R2N6 131 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 PIGNO95427 931 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 KRT6AP02538 564 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 KRT6BP04259 564 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP6V1B1P15313 513 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 KRT6CP48668 564 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 DSG1Q02413 1049 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 CYP51A1Q16850 503 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 MAF1Q9H063 256 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 ACSS3Q9H6R3 686 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 MGAT4DA6NG13 374 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 RAD51BO15315 384 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF23P17027 643 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 PARVBQ9HBI1 364 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 APPL1Q9UKG1 709 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 KCPQ6ZWJ8 1503 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 PCDH8O95206 1070 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 MSH3P20585 1137 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 PAX3P23760 479 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 HPCAP84074 193 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC25A52Q3SY17 297 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 METTL6Q8TCB7 284 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM159Q96B96 161 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 DYRK1BQ9Y463 629 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 TSPAN1O60635 241 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 ARIH2O95376 493 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC2A4P14672 509 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 CDC16Q13042 620 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 ITGA7Q13683 1181 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 P3H2Q8IVL5 708 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 JADE3Q92613 823 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 MAML3Q96JK9 1138 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 POLG2Q9UHN1 485 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 SNX3O60493 162 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 AVILO75366 819 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 LRCH4O75427 683 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 OOSP2Q86WS3 158 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 SEMA3CQ99985 751 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 MYLK2Q9H1R3 596 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 XYLBO75191 536 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 MON1BQ7L1V2 547 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 EXOC3L1Q86VI1 746 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 XYLT1Q86Y38 959 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 CENPTQ96BT3 561 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 ALOX15BO15296 676 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 PGS1Q32NB8 556 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 ERAP2Q6P179 960 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 PHACTR4Q8IZ21 702 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 GPR152Q8TDT2 470 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 CSH1P0DML2 217 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 CSH2P0DML3 217 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 STRADAQ7RTN6 431 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 DAW1Q8N136 415 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 BTBD10Q9BSF8 475 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 POMKQ9H5K3 350 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 ADSSP30520 456 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 SPRYD7Q5W111 196 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 DLK2Q6UY11 383 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 DENND1CQ8IV53 801 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 IQCKQ8N0W5 287 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 MIER2Q8N344 545 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 P2RY11Q96G91 374 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 CNBD2Q96M20 576 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 TSPAN18Q96SJ8 248 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRJ-208ENST00000615445 TLR5O60602 858 aa21.02■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 GPC1P35052 558 aa21.02■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 MAXP61244 160 aa21.02■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 RNF148Q8N7C7 305 aa21.02■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 TM6SF2Q9BZW4 377 aa21.02■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 PIF1Q9H611 641 aa21.02■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 CATSPERZQ9NTU4 200 aa21.02■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms