Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV53

DENND1C, DENN domain-containing protein 1C, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1CQ8IV53 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
DENND1CQ8IV53 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
DENND1CQ8IV53 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
DENND1CQ8IV53 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
DENND1CQ8IV53 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
DENND1CQ8IV53 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
DENND1CQ8IV53 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
DENND1CQ8IV53 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
DENND1CQ8IV53 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
DENND1CQ8IV53 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
DENND1CQ8IV53 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
DENND1CQ8IV53 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
DENND1CQ8IV53 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
DENND1CQ8IV53 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
DENND1CQ8IV53 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
DENND1CQ8IV53 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
DENND1CQ8IV53 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
DENND1CQ8IV53 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
DENND1CQ8IV53 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
DENND1CQ8IV53 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
DENND1CQ8IV53 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
DENND1CQ8IV53 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DENND1CQ8IV53 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
DENND1CQ8IV53 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
DENND1CQ8IV53 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
DENND1CQ8IV53 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DENND1CQ8IV53 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
DENND1CQ8IV53 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
DENND1CQ8IV53 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
DENND1CQ8IV53 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
DENND1CQ8IV53 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
DENND1CQ8IV53 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
DENND1CQ8IV53 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
DENND1CQ8IV53 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
DENND1CQ8IV53 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
DENND1CQ8IV53 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
DENND1CQ8IV53 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
DENND1CQ8IV53 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
DENND1CQ8IV53 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
DENND1CQ8IV53 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
DENND1CQ8IV53 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
DENND1CQ8IV53 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
DENND1CQ8IV53 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
DENND1CQ8IV53 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
DENND1CQ8IV53 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
DENND1CQ8IV53 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
DENND1CQ8IV53 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
DENND1CQ8IV53 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
DENND1CQ8IV53 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
DENND1CQ8IV53 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
DENND1CQ8IV53 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
DENND1CQ8IV53 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
DENND1CQ8IV53 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
DENND1CQ8IV53 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
DENND1CQ8IV53 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
DENND1CQ8IV53 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
DENND1CQ8IV53 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
DENND1CQ8IV53 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
DENND1CQ8IV53 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
DENND1CQ8IV53 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DENND1CQ8IV53 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
DENND1CQ8IV53 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
DENND1CQ8IV53 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
DENND1CQ8IV53 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
DENND1CQ8IV53 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
DENND1CQ8IV53 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
DENND1CQ8IV53 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
DENND1CQ8IV53 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
DENND1CQ8IV53 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
DENND1CQ8IV53 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DENND1CQ8IV53 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
DENND1CQ8IV53 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DENND1CQ8IV53 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DENND1CQ8IV53 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
DENND1CQ8IV53 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
DENND1CQ8IV53 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
DENND1CQ8IV53 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
DENND1CQ8IV53 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
DENND1CQ8IV53 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
DENND1CQ8IV53 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
DENND1CQ8IV53 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
DENND1CQ8IV53 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
DENND1CQ8IV53 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
DENND1CQ8IV53 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DENND1CQ8IV53 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DENND1CQ8IV53 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
DENND1CQ8IV53 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
DENND1CQ8IV53 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
DENND1CQ8IV53 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DENND1CQ8IV53 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
DENND1CQ8IV53 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
DENND1CQ8IV53 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
DENND1CQ8IV53 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
DENND1CQ8IV53 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
DENND1CQ8IV53 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DENND1CQ8IV53 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DENND1CQ8IV53 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
DENND1CQ8IV53 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
DENND1CQ8IV53 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DENND1CQ8IV53 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms