RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000172332.3

Ccdc71l-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

APPRIS P1 BASIC

Gene Ccdc71l, Length 4,240 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Lyrm1Q9CQB7 122 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Commd8Q9CZG3 183 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Arhgef10Q8C033 1345 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Ddx60E9PZQ1 1711 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Mtx3D3YTP3 312 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Stra6O70491 670 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 PdgfrbP05622 1098 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 IdsQ08890 552 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 ZbbxQ0P5X5 716 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Slc9b2Q5BKR2 547 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Ctc1Q5SUQ9 1212 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 1700001J03RikQ80ZR8 219 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Fbxo38Q8BMI0 1194 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Bhlhe22Q8C6A8 355 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 OlahQ8R197 265 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Mlc1Q8VHK5 382 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 WwoxQ91WL8 414 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Pip4k2cQ91XU3 421 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Trps1Q925H1 1281 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Tma16Q9CR02 221 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Tbc1d15Q9CXF4 671 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Bscl2Q9Z2E9 383 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Gm6205E9PZS2 359 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Gm10639E9Q6L7 222 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Ttc7bE9Q6P5 843 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Angpt2O35608 496 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Serpina3kP07759 418 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Gsta2P10648 222 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Pld5Q3UNN8 536 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 ADGRF3Q58Y75 991 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Cyb5d1Q5NCY3 228 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Etaa1Q5SVT3 877 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Gm6367Q8C6L9 287 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Q8CC96 669 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Snapc1Q8K0S9 389 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Pramel1Q99MW3 458 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Rex1bdQ9CYZ6 169 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Hspa12bQ9CZJ2 685 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 DcpsQ9DAR7 338 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Pik3cgQ9JHG7 1102 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Prl2a1Q9JHK0 228 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Znf354bQ9QXT9 601 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Zbtb12Q9Z150 459 aa16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 MtrA6H5Y3 1253 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Gm6408J3QNG1 320 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 TankP70347 448 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Cct7P80313 544 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Rxfp1Q6R6I7 758 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Thop1Q8C1A5 687 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Hdhd5Q91WM2 419 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Trim12aQ99PQ1 284 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Gria4Q9Z2W8 902 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Cntnap4Q99P47 1310 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Tmigd3G3X8R9 209 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Nedd8P29595 81 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Proser1Q5PRE5 913 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Trpc1Q61056 793 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Fam167aQ6P1G6 215 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Ssxb3Q6XAS4 170 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Olfr792Q7TRH9 311 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Tbc1d10bQ8BHL3 798 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Ccdc184Q8BMK5 191 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Scara3Q8C850 606 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Vps35Q9EQH3 796 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Aldh1a3Q9JHW9 512 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Mpp6Q9JLB0 553 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Ifi213D3Z5G0 586 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 AmacrO09174 381 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Dpysl4O35098 572 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 RhocQ62159 193 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Olfr297Q7TS07 310 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Ftsj1Q8CBC7 324 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Ctu1Q99J10 420 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Tubgcp4Q9D4F8 667 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 DgkeQ9R1C6 564 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Krt4P07744 525 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 TecP24604 630 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Cdh9P70407 786 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Gxylt1Q3UHH8 404 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Cand2Q6ZQ73 1235 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 NclnQ8VCM8 563 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 NlnQ91YP2 704 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Ssxb1Q9CPU1 170 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 FopnlQ9CZS3 174 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 PalmdQ9JHU2 551 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 PignQ9R1S3 931 aa16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Gm27029A2A4P4 543 aa16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Znf711A2ANX9 761 aa16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Slc10a3P21129 473 aa16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Hoxd10P28359 340 aa16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Syce1lQ5D525 247 aa16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Rftn2Q8CHX7 500 aa16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Lrrc42Q8R2U7 421 aa16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Acsf2Q8VCW8 615 aa16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 PigxQ99LV7 254 aa16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 Rec114Q9CWH4 259 aa16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 RhoaQ9QUI0 193 aa16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 H2afyQ9QZQ8 372 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 93.9 ms