Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Bhlhe22Q8C6A8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Bhlhe22Q8C6A8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Bhlhe22Q8C6A8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Bhlhe22Q8C6A8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Bhlhe22Q8C6A8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Bhlhe22Q8C6A8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Bhlhe22Q8C6A8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Bhlhe22Q8C6A8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Bhlhe22Q8C6A8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Bhlhe22Q8C6A8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Bhlhe22Q8C6A8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Bhlhe22Q8C6A8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Bhlhe22Q8C6A8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Bhlhe22Q8C6A8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Bhlhe22Q8C6A8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Bhlhe22Q8C6A8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Bhlhe22Q8C6A8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Bhlhe22Q8C6A8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Bhlhe22Q8C6A8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Bhlhe22Q8C6A8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Bhlhe22Q8C6A8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Bhlhe22Q8C6A8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Bhlhe22Q8C6A8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Bhlhe22Q8C6A8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Bhlhe22Q8C6A8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Bhlhe22Q8C6A8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Bhlhe22Q8C6A8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Bhlhe22Q8C6A8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Bhlhe22Q8C6A8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Bhlhe22Q8C6A8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Bhlhe22Q8C6A8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Bhlhe22Q8C6A8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Bhlhe22Q8C6A8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Bhlhe22Q8C6A8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Bhlhe22Q8C6A8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Bhlhe22Q8C6A8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Bhlhe22Q8C6A8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Bhlhe22Q8C6A8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Bhlhe22Q8C6A8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Bhlhe22Q8C6A8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Bhlhe22Q8C6A8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Bhlhe22Q8C6A8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bhlhe22Q8C6A8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bhlhe22Q8C6A8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Bhlhe22Q8C6A8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Bhlhe22Q8C6A8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Bhlhe22Q8C6A8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Bhlhe22Q8C6A8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Bhlhe22Q8C6A8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bhlhe22Q8C6A8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Bhlhe22Q8C6A8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Bhlhe22Q8C6A8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Bhlhe22Q8C6A8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Bhlhe22Q8C6A8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Bhlhe22Q8C6A8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Bhlhe22Q8C6A8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Bhlhe22Q8C6A8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Bhlhe22Q8C6A8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Bhlhe22Q8C6A8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Bhlhe22Q8C6A8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Bhlhe22Q8C6A8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Bhlhe22Q8C6A8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Bhlhe22Q8C6A8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Bhlhe22Q8C6A8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Bhlhe22Q8C6A8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Bhlhe22Q8C6A8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Bhlhe22Q8C6A8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Bhlhe22Q8C6A8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Bhlhe22Q8C6A8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Bhlhe22Q8C6A8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Bhlhe22Q8C6A8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Bhlhe22Q8C6A8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Bhlhe22Q8C6A8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Bhlhe22Q8C6A8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Bhlhe22Q8C6A8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Bhlhe22Q8C6A8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Bhlhe22Q8C6A8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Bhlhe22Q8C6A8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Bhlhe22Q8C6A8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms