Protein–RNA interactions for Protein: O09174

Amacr, Alpha-methylacyl-CoA racemase, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmacrO09174 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
AmacrO09174 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
AmacrO09174 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
AmacrO09174 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
AmacrO09174 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
AmacrO09174 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
AmacrO09174 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
AmacrO09174 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
AmacrO09174 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
AmacrO09174 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
AmacrO09174 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
AmacrO09174 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
AmacrO09174 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
AmacrO09174 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
AmacrO09174 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
AmacrO09174 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
AmacrO09174 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
AmacrO09174 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
AmacrO09174 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
AmacrO09174 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
AmacrO09174 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
AmacrO09174 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
AmacrO09174 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
AmacrO09174 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
AmacrO09174 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
AmacrO09174 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
AmacrO09174 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
AmacrO09174 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
AmacrO09174 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AmacrO09174 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
AmacrO09174 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
AmacrO09174 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AmacrO09174 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AmacrO09174 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
AmacrO09174 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AmacrO09174 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AmacrO09174 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AmacrO09174 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AmacrO09174 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
AmacrO09174 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AmacrO09174 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AmacrO09174 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AmacrO09174 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AmacrO09174 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AmacrO09174 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AmacrO09174 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AmacrO09174 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
AmacrO09174 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
AmacrO09174 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AmacrO09174 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AmacrO09174 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AmacrO09174 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
AmacrO09174 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AmacrO09174 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AmacrO09174 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AmacrO09174 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
AmacrO09174 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
AmacrO09174 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AmacrO09174 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AmacrO09174 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AmacrO09174 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AmacrO09174 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AmacrO09174 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
AmacrO09174 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AmacrO09174 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AmacrO09174 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AmacrO09174 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AmacrO09174 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
AmacrO09174 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.53■■■□□ 2
AmacrO09174 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AmacrO09174 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AmacrO09174 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AmacrO09174 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AmacrO09174 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AmacrO09174 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AmacrO09174 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AmacrO09174 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
AmacrO09174 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AmacrO09174 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AmacrO09174 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AmacrO09174 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
AmacrO09174 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
AmacrO09174 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AmacrO09174 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AmacrO09174 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AmacrO09174 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AmacrO09174 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AmacrO09174 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AmacrO09174 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AmacrO09174 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AmacrO09174 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AmacrO09174 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
AmacrO09174 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
AmacrO09174 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AmacrO09174 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AmacrO09174 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
AmacrO09174 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AmacrO09174 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AmacrO09174 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
AmacrO09174 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms