Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Syce1lQ5D525 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Syce1lQ5D525 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Syce1lQ5D525 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Syce1lQ5D525 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Syce1lQ5D525 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Syce1lQ5D525 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Syce1lQ5D525 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Syce1lQ5D525 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Syce1lQ5D525 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Syce1lQ5D525 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Syce1lQ5D525 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Syce1lQ5D525 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Syce1lQ5D525 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Syce1lQ5D525 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Syce1lQ5D525 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Syce1lQ5D525 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Syce1lQ5D525 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Syce1lQ5D525 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Syce1lQ5D525 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Syce1lQ5D525 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Syce1lQ5D525 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Syce1lQ5D525 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Syce1lQ5D525 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Syce1lQ5D525 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Syce1lQ5D525 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Syce1lQ5D525 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Syce1lQ5D525 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Syce1lQ5D525 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Syce1lQ5D525 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Syce1lQ5D525 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Syce1lQ5D525 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Syce1lQ5D525 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Syce1lQ5D525 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Syce1lQ5D525 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Syce1lQ5D525 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Syce1lQ5D525 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Syce1lQ5D525 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Syce1lQ5D525 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Syce1lQ5D525 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Syce1lQ5D525 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Syce1lQ5D525 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Syce1lQ5D525 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Syce1lQ5D525 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Syce1lQ5D525 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Syce1lQ5D525 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Syce1lQ5D525 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syce1lQ5D525 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Syce1lQ5D525 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Syce1lQ5D525 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Syce1lQ5D525 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Syce1lQ5D525 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Syce1lQ5D525 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Syce1lQ5D525 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Syce1lQ5D525 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Syce1lQ5D525 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Syce1lQ5D525 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Syce1lQ5D525 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Syce1lQ5D525 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Syce1lQ5D525 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Syce1lQ5D525 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Syce1lQ5D525 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Syce1lQ5D525 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Syce1lQ5D525 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Syce1lQ5D525 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Syce1lQ5D525 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Syce1lQ5D525 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Syce1lQ5D525 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Syce1lQ5D525 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Syce1lQ5D525 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Syce1lQ5D525 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Syce1lQ5D525 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Syce1lQ5D525 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Syce1lQ5D525 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Syce1lQ5D525 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Syce1lQ5D525 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Syce1lQ5D525 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Syce1lQ5D525 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syce1lQ5D525 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Syce1lQ5D525 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Syce1lQ5D525 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Syce1lQ5D525 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Syce1lQ5D525 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Syce1lQ5D525 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Syce1lQ5D525 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Syce1lQ5D525 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Syce1lQ5D525 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Syce1lQ5D525 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Syce1lQ5D525 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Syce1lQ5D525 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Syce1lQ5D525 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Syce1lQ5D525 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Syce1lQ5D525 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Syce1lQ5D525 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syce1lQ5D525 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syce1lQ5D525 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syce1lQ5D525 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syce1lQ5D525 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syce1lQ5D525 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syce1lQ5D525 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms