Protein–RNA interactions for Protein: P70347

Tank, TRAF family member-associated NF-kappa-B activator, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TankP70347 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
TankP70347 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TankP70347 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TankP70347 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TankP70347 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
TankP70347 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TankP70347 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TankP70347 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
TankP70347 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.82■■■■□ 3
TankP70347 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TankP70347 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TankP70347 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TankP70347 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
TankP70347 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TankP70347 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
TankP70347 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
TankP70347 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TankP70347 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TankP70347 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TankP70347 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TankP70347 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TankP70347 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TankP70347 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TankP70347 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TankP70347 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TankP70347 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TankP70347 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
TankP70347 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.69
TankP70347 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
TankP70347 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TankP70347 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TankP70347 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TankP70347 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TankP70347 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TankP70347 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TankP70347 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TankP70347 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TankP70347 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TankP70347 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TankP70347 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TankP70347 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TankP70347 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TankP70347 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
TankP70347 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TankP70347 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TankP70347 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TankP70347 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TankP70347 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TankP70347 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TankP70347 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TankP70347 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TankP70347 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TankP70347 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TankP70347 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
TankP70347 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TankP70347 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
TankP70347 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TankP70347 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TankP70347 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TankP70347 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TankP70347 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TankP70347 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TankP70347 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TankP70347 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TankP70347 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TankP70347 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TankP70347 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TankP70347 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TankP70347 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TankP70347 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TankP70347 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TankP70347 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TankP70347 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TankP70347 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TankP70347 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TankP70347 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
TankP70347 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TankP70347 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TankP70347 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TankP70347 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TankP70347 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TankP70347 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TankP70347 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TankP70347 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TankP70347 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TankP70347 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TankP70347 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TankP70347 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TankP70347 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TankP70347 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TankP70347 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TankP70347 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TankP70347 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TankP70347 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TankP70347 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TankP70347 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TankP70347 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TankP70347 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TankP70347 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TankP70347 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152 ms