RNA–Protein interactions for RNA: snR46

snR46, Transcript of H/ACA box small nucleolar RNA (snoRNA), yeast

Gene snR46, Length 197 nt, Biotype snoRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
snR46	snR46	FIR1	P40020	876 aa		3.32	□□□□□ -1.88
snR46	snR46	NIT1	P40447	199 aa		3.32	□□□□□ -1.88
snR46	snR46	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
snR46	snR46	NCE103	P53615	221 aa		3.32	□□□□□ -1.88
snR46	snR46	ECM23	Q02710	187 aa		3.32	□□□□□ -1.88
snR46	snR46	SPO71	Q03868	1245 aa		3.32	□□□□□ -1.88
snR46	snR46	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
snR46	snR46	DFG16	Q99234	619 aa		3.31	□□□□□ -1.88
snR46	snR46	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
snR46	snR46	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
snR46	snR46	YCR015C	P25616	317 aa		3.3	□□□□□ -1.88
snR46	snR46	SEA4	P38164	1038 aa		3.3	□□□□□ -1.88
snR46	snR46	YBR197C	P38306	217 aa		3.3	□□□□□ -1.88
snR46	snR46	NEO1	P40527	1151 aa		3.3	□□□□□ -1.88
snR46	snR46	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
snR46	snR46	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
snR46	snR46	ELG1	Q12050	791 aa		3.3	□□□□□ -1.88
snR46	snR46	MSN1	P22148	382 aa		3.29	□□□□□ -1.88
snR46	snR46	SUV3	P32580	737 aa		3.29	□□□□□ -1.88
snR46	snR46	UBX7	P38349	436 aa		3.29	□□□□□ -1.88
snR46	snR46	AIM46	P38885	310 aa		3.29	□□□□□ -1.88
snR46	snR46	SOG2	Q08817	791 aa		3.29	□□□□□ -1.88
snR46	snR46	ISC10	P32645	267 aa		3.28	□□□□□ -1.88
snR46	snR46	MMM1	P41800	426 aa		3.28	□□□□□ -1.88
snR46	snR46	YMR074C	Q04773	145 aa		3.28	□□□□□ -1.88
snR46	snR46	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
snR46	snR46	ESC8	Q08119	714 aa		3.28	□□□□□ -1.88
snR46	snR46	ERS1	P17261	260 aa		3.27	□□□□□ -1.89
snR46	snR46	TGL4	P36165	910 aa		3.27	□□□□□ -1.89
snR46	snR46	YHL008C	P38750	627 aa		3.27	□□□□□ -1.89
snR46	snR46	FAR11	P53917	953 aa		3.27	□□□□□ -1.89
snR46	snR46	FUS1	P11710	512 aa		3.26	□□□□□ -1.89
snR46	snR46	CIT3	P43635	486 aa		3.26	□□□□□ -1.89
snR46	snR46	RCM1	P53972	490 aa		3.26	□□□□□ -1.89
snR46	snR46	PUN1	Q06991	263 aa		3.26	□□□□□ -1.89
snR46	snR46	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
snR46	snR46	TFA2	P36145	328 aa		3.25	□□□□□ -1.89
snR46	snR46	GIP4	P39732	760 aa		3.25	□□□□□ -1.89
snR46	snR46	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
snR46	snR46	YJR124C	P47159	448 aa		3.25	□□□□□ -1.89
snR46	snR46	ALD3	P54114	506 aa		3.25	□□□□□ -1.89
snR46	snR46	HSP78	P33416	811 aa		3.24	□□□□□ -1.89
snR46	snR46	HXT8	P40886	569 aa		3.24	□□□□□ -1.89
snR46	snR46	YNR065C	P53751	1116 aa		3.24	□□□□□ -1.89
snR46	snR46	MSH6	Q03834	1242 aa		3.24	□□□□□ -1.89
snR46	snR46	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
snR46	snR46	YOR223W	Q12015	292 aa		3.24	□□□□□ -1.89
snR46	snR46	GPT2	P36148	743 aa		3.23	□□□□□ -1.89
snR46	snR46	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
snR46	snR46	TAF1	P46677	1066 aa		3.23	□□□□□ -1.89
snR46	snR46	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
snR46	snR46	YLL054C	Q12244	843 aa		3.22	□□□□□ -1.89
snR46	snR46	ADP1	P25371	1049 aa		3.21	□□□□□ -1.9
snR46	snR46	FET4	P40988	552 aa		3.21	□□□□□ -1.9
snR46	snR46	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
snR46	snR46	TTI1	P36097	1038 aa		3.2	□□□□□ -1.9
snR46	snR46	RGD2	P43556	714 aa		3.2	□□□□□ -1.9
snR46	snR46	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
snR46	snR46	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
snR46	snR46	CDA2	Q06703	312 aa		3.2	□□□□□ -1.9
snR46	snR46	GIS1	Q03833	894 aa		3.19	□□□□□ -1.9
snR46	snR46	GLO4	Q12320	285 aa		3.19	□□□□□ -1.9
snR46	snR46	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
snR46	snR46	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
snR46	snR46	SRS2	P12954	1174 aa		3.18	□□□□□ -1.9
snR46	snR46	RRN6	P32786	894 aa		3.18	□□□□□ -1.9
snR46	snR46	RAD55	P38953	406 aa		3.18	□□□□□ -1.9
snR46	snR46	NTA1	P40354	457 aa		3.18	□□□□□ -1.9
snR46	snR46	SSY1	Q03770	852 aa		3.18	□□□□□ -1.9
snR46	snR46	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
snR46	snR46	TRE1	Q08919	783 aa		3.17	□□□□□ -1.9
snR46	snR46	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
snR46	snR46	THI80	P35202	319 aa		3.16	□□□□□ -1.9
snR46	snR46	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
snR46	snR46	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
snR46	snR46	HVG1	P0CE11	249 aa		3.15	□□□□□ -1.91
snR46	snR46	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
snR46	snR46	CPS1	P27614	576 aa		3.15	□□□□□ -1.91
snR46	snR46	PRO1	P32264	428 aa		3.15	□□□□□ -1.91
snR46	snR46	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
snR46	snR46	SMC1	P32908	1225 aa		3.15	□□□□□ -1.91
snR46	snR46	FLR1	P38124	548 aa		3.15	□□□□□ -1.91
snR46	snR46	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
snR46	snR46	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
snR46	snR46	PSY2	P40164	858 aa		3.15	□□□□□ -1.91
snR46	snR46	HDA2	Q06629	674 aa		3.15	□□□□□ -1.91
snR46	snR46	PUP1	P25043	261 aa		3.13	□□□□□ -1.91
snR46	snR46	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
snR46	snR46	GCV1	P48015	400 aa		3.13	□□□□□ -1.91
snR46	snR46	MRPL22	P53881	309 aa		3.13	□□□□□ -1.91
snR46	snR46	PNP1	Q05788	311 aa		3.13	□□□□□ -1.91
snR46	snR46	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
snR46	snR46	PTC7	P38797	343 aa		3.12	□□□□□ -1.91
snR46	snR46	ORC3	P54790	616 aa		3.12	□□□□□ -1.91
snR46	snR46	YVC1	Q12324	675 aa		3.12	□□□□□ -1.91
snR46	snR46	NFS1	P25374	497 aa		3.11	□□□□□ -1.91
snR46	snR46	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
snR46	snR46	GTS1	P40956	396 aa		3.11	□□□□□ -1.91
snR46	snR46	EAR1	Q03212	550 aa		3.11	□□□□□ -1.91
snR46	snR46	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 74.3 ms