RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A GAL2P13181 574 aa1.46□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A PAN5P38787 379 aa1.46□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A ELA1P53861 379 aaPredicted RBP1.46□□□□□ -2.17
YPL060C-AYPL060C-A YCK2P23292 546 aaKnown RBP1.46□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A GIP1P38229 639 aa1.46□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A SSN3P39073 555 aa1.46□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A STU2P46675 888 aa1.46□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A ENA1P13587 1091 aa1.46□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A ENA2Q01896 1091 aa1.46□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A ENA5Q12691 1091 aa1.46□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A REI1P38344 393 aaPredicted RBP1.45□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A HRK1Q08732 759 aaKnown RBP1.45□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A YLR122CQ12312 125 aa1.45□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A SEC23P15303 768 aaKnown RBP1.45□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data1.45□□□□□ -2.18not detected
YPL060C-AYPL060C-A GPT2P36148 743 aa1.45□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A ALG6Q12001 544 aaKnown RBP1.45□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A TUB2P02557 457 aaKnown RBP1.45□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A AI3P03877 415 aa1.45□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A CAD1P24813 409 aaKnown RBP1.45□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A ETP1P38748 585 aaKnown RBP1.45□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A ACS2P52910 683 aaKnown RBP1.45□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A GIS4Q04233 774 aa1.45□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A TRP3P00937 484 aa1.44□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A LEU1P07264 779 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A MCM1P11746 286 aa1.44□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A NAR1P23503 491 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A GRS1P38088 690 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A BSD2P38356 321 aa1.44□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A PEX13P80667 386 aa1.44□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A MON1P53129 644 aa1.43□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A OXR1Q08952 273 aa1.43□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A SLP1Q12232 587 aa1.43□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A RNQ1P25367 405 aa1.43□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A LEM3P42838 414 aa1.43□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A RSM24Q03976 319 aa1.43□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A NGR1P32831 672 aaKnown RBP1.43□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A YKR073CP36153 106 aa1.43□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A RSC30P38781 883 aa1.43□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A VPS30Q02948 557 aa1.43□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP1.43□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP1.43□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data1.42□□□□□ -2.18not detected
YPL060C-AYPL060C-A DFG16Q99234 619 aa1.42□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP1.42□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP1.42□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A KIN2P13186 1147 aaKnown RBP1.42□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A MCM5P29496 775 aaKnown RBP1.42□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A HSP78P33416 811 aa1.42□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A GSF2Q04697 403 aaKnown RBP1.42□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-DR3Q12441 440 aa1.42□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A RAD27P26793 382 aa1.41□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A TGL4P36165 910 aa1.41□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A GIP4P39732 760 aa1.41□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A HXT8P40886 569 aa1.41□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A SPR3P41901 512 aa1.41□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A APL1P27351 700 aa1.41□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A SLA1P32790 1244 aa1.41□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A TOD6P34219 525 aa1.41□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A REC8Q12188 680 aa1.41□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A SLD2P34252 453 aa1.41□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A CCZ1P38273 704 aa1.41□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A YHL012WP38709 493 aa1.41□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A GTF1P53260 183 aaPredicted RBP1.41□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A CRR1Q05790 422 aa1.41□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A VMA3P25515 160 aa1.4□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A SHM1P37292 490 aaPredicted RBP1.4□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A NMD3P38861 518 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A ALD4P46367 519 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A YOR296WQ08748 1289 aa1.4□□□□□ -2.18
YPL060C-AYPL060C-A SPS1P08458 490 aa1.4□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A LEU3P08638 886 aa1.4□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A KAR2P16474 682 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A SEG2P34250 1132 aa1.4□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A AIM3P38266 947 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A NIT1P40447 199 aa1.4□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A CWC24P53769 259 aa1.4□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A PNP1Q05788 311 aa1.4□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A ESC8Q08119 714 aa1.4□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A PNS1Q12412 539 aa1.4□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A MCM7P38132 845 aa1.4□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A CIC1P38779 376 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A GUP1P53154 560 aa1.4□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A DMA2P53924 522 aa1.4□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A SSY1Q03770 852 aa1.4□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A YPR196WQ06595 470 aa1.4□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A SRS2P12954 1174 aa1.39□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A RDS2P19541 446 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A MRPL33P20084 86 aa1.39□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A YNR040WP53736 256 aa1.39□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A SNO2P53823 222 aa1.39□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A TRE1Q08919 783 aa1.39□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A ATG36P46983 293 aa1.39□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A RIM21P48565 533 aa1.39□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A YPR084WQ06821 456 aa1.39□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A AIM39Q08223 395 aa1.39□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A INP52P50942 1183 aa1.38□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A ROT1Q03691 256 aa1.38□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A CMP2P14747 604 aa1.38□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A IDI1P15496 288 aa1.38□□□□□ -2.19
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