RNA–Protein interactions for RNA: YKL069W

YKL069W, Transcript of Methionine-R-sulfoxide reductase, yeast

Gene YKL069W, Length 543 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL069W	YKL069W	CEM1	P39525	442 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	LYS5	P50113	272 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	PPT1	P53043	513 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	MCM2	P29469	868 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	MET10	P39692	1035 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	CAF120	P53836	1060 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	SYT1	Q06836	1226 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	FUS1	P11710	512 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	PRK1	P40494	810 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	SAP155	P43612	1002 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	NUT1	P53114	1132 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	DAL4	Q04895	635 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	SPR28	Q04921	423 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	TOS4	Q06266	489 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	CYC8	P14922	966 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	DUR3	P33413	735 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	RIM11	P38615	370 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	FAA3	P39002	694 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	ALD3	P54114	506 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	PMT7	Q06644	662 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	RAD2	P07276	1031 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	YDL176W	Q12027	708 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	MON1	P53129	644 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	YPL109C	Q02981	657 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	SOG2	Q08817	791 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	MCD1	Q12158	566 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	GLO4	Q12320	285 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YKL069W	YKL069W	MRP10	O75012	95 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	HVG1	P0CE11	249 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	MRPS18	P42847	217 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	YJL181W	P46987	611 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	YAF9	P53930	226 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	ULP1	Q02724	621 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	NPR1	P22211	790 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	PEP7	P32609	515 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	UGA4	P32837	571 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	TFA2	P36145	328 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	JJJ3	P47138	172 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	ADI1	Q03677	179 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	CLN2	P20438	545 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	MNR2	P35724	969 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	GUP1	P53154	560 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	DPH6	Q12429	685 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.68	□□□□□ -1.66	not detected
YKL069W	YKL069W	PET112	P33893	541 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	FET4	P40988	552 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	LEM3	P42838	414 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	YJR124C	P47159	448 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	SQT1	P35184	431 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	SHU2	P38957	223 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	PIC2	P40035	300 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	YNR065C	P53751	1116 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	VPS16	Q03308	798 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	GIS4	Q04233	774 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	PIN2	Q12057	282 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	MAD1	P40957	749 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	LSB6	P42951	607 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	RSM26	P47141	266 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	HPF1	Q05164	967 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	SLP1	Q12232	587 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YKL069W	YKL069W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	TAF13	P11747	167 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	PEX28	P38848	579 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	YGR035C	P53222	116 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	NEO1	P40527	1151 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	YIG1	Q08956	461 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	CDC34	P14682	295 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	MSH3	P25336	1018 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	YKL077W	P36081	392 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	ALG14	P38242	237 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKL069W	YKL069W	EXO5	P38289	585 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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