RNA–Protein interactions for RNA: YER117W

RPL23B, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L23B, yeastyeast

Gene RPL23B, Length 414 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL23BYER117W RVB2Q12464 471 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RPL23BYER117W SUP35P05453 685 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W DAL5P15365 543 aa3.58□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W MGM1P32266 881 aa3.58□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W RTG2P32608 588 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W AFG2P32794 780 aa3.58□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W ICP55P40051 511 aa3.58□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W FET4P40988 552 aa3.58□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W YPP1P46951 817 aa3.58□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W YJR008WP47085 338 aa3.58□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W CSN12P47130 423 aa3.58□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W ISM1P48526 1002 aa3.58□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W CSI1Q04368 295 aa3.58□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W THI3Q07471 609 aa3.58□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W FIG2P25653 1609 aa3.57□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W KRE2P27809 442 aa3.57□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W SPT16P32558 1035 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W UBP12P39538 1254 aa3.57□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W BOI2P39969 1040 aa3.57□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W STR2P47164 639 aa3.57□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W VPS4P52917 437 aa3.57□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W TIM50Q02776 476 aa3.57□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W SRC1Q03707 834 aa3.57□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W UBX2Q04228 584 aa3.57□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W YLR278CQ05854 1341 aa3.57□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W GAS5Q08193 484 aa3.57□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W MMP1Q12372 583 aa3.57□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W SAC3P46674 1301 aa3.56□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W KEX2P13134 814 aa3.56□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W HPR1P17629 752 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W SLY41P22215 453 aa3.56□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W SLA1P32790 1244 aa3.56□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W STV1P37296 890 aa3.56□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W SPL2P38839 148 aa3.56□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W FUN12P39730 1002 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W HXT10P43581 546 aa3.56□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W CRF1Q04930 467 aa3.56□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W YPR015CQ12531 247 aa3.56□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W RAD2P07276 1031 aa3.55□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W ERG12P07277 443 aa3.55□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W BRL1P38770 471 aa3.55□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W YNG2P38806 282 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W YIL092WP40497 633 aa3.55□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W EMP47P43555 445 aa3.55□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W TBF1Q02457 562 aa3.55□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W IRC4Q03036 179 aa3.55□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W MTC5Q03897 1148 aa3.55□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W TOS4Q06266 489 aa3.55□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W TOM1Q03280 3268 aa3.54□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W CBP1P07252 654 aa3.54□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W RPS19AP07280 144 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W RPS19BP07281 144 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W RPS7AP26786 190 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W RPT3P33298 428 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W PEA2P40091 420 aa3.54□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W JJJ2P46997 583 aa3.54□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W YRB30P53107 440 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W YGR117CP53270 476 aa3.54□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W PUS6P53294 404 aa3.54□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W SPO1P53541 631 aa3.54□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data3.54□□□□□ -1.84not detected
RPL23BYER117W CWC15Q03772 175 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W PRP42Q03776 544 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W RRI2Q12348 645 aa3.54□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W YEL077CQ3E7X8 1277 aa3.54□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W FLO11P08640 1367 aa3.53□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W ARG82P07250 355 aa3.53□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W LCB1P25045 558 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W GUA1P38625 525 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W NUG1P40010 520 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W YIL089WP40500 205 aa3.53□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W KXD1P53158 218 aa3.53□□□□□ -1.84
RPL23BYER117W GSC2P40989 1895 aa3.52□□□□□ -1.85
RPL23BYER117W ADR1P07248 1323 aa3.52□□□□□ -1.85
RPL23BYER117W POM152P39685 1337 aa3.52□□□□□ -1.85
RPL23BYER117W TY1A-DR4O74302 440 aa3.52□□□□□ -1.85
RPL23BYER117W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RPL23BYER117W TY1A-AP0CX57 440 aa3.52□□□□□ -1.85
RPL23BYER117W TY1A-PR1P0CX58 440 aa3.52□□□□□ -1.85
RPL23BYER117W TY1A-ORP0CX59 440 aa3.52□□□□□ -1.85
RPL23BYER117W TY1A-PR2P0CX60 440 aa3.52□□□□□ -1.85
RPL23BYER117W TY1A-DR5P0CX65 440 aa3.52□□□□□ -1.85
RPL23BYER117W TY1A-ER2P0CX66 440 aa3.52□□□□□ -1.85
RPL23BYER117W TY1A-GR3P0CX67 440 aa3.52□□□□□ -1.85
RPL23BYER117W TY1A-LR1P0CX68 440 aa3.52□□□□□ -1.85
RPL23BYER117W TY1A-MR2P0CX69 440 aa3.52□□□□□ -1.85
RPL23BYER117W SEC2P17065 759 aa3.52□□□□□ -1.85
RPL23BYER117W SEC18P18759 758 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RPL23BYER117W PRS1P32895 427 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RPL23BYER117W SSF1P38789 453 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RPL23BYER117W YIR042CP40586 236 aa3.52□□□□□ -1.85
RPL23BYER117W RRN7P40992 514 aa3.52□□□□□ -1.85
RPL23BYER117W YFH7P43591 353 aa3.52□□□□□ -1.85
RPL23BYER117W TY1A-JR2P47099 440 aa3.52□□□□□ -1.85
RPL23BYER117W TUB4P53378 473 aa3.52□□□□□ -1.85
RPL23BYER117W PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.9 ms