RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeastyeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRD1YCL057W RPS26AP39938 119 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W RPS26BP39939 119 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W IDI1P15496 288 aa6.63□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W FAA3P39002 694 aa6.63□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W CUZ1P53899 274 aa6.63□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W HEH2Q03281 663 aa6.63□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W ACO2P39533 789 aa6.62□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W DAL4Q04895 635 aa6.62□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W PRP40P33203 583 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W SAP155P43612 1002 aa6.61□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W NUT1P53114 1132 aa6.61□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W YDR461C-AQ2V2P7 80 aa6.61□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W RAD2P07276 1031 aa6.61□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W NAP1P25293 417 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W ESF1Q06344 628 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W PPT1P53043 513 aa6.59□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W KRE33P53914 1056 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W RIM11P38615 370 aa6.59□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W MAG2Q06436 670 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W RSC2Q06488 889 aa6.59□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W SKI3P17883 1432 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PRD1YCL057W FPS1P23900 669 aa6.58□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W RVS167P39743 482 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W YIR007WP40566 764 aa6.58□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W YPL109CQ02981 657 aa6.58□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W FUS1P11710 512 aa6.58□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W PRP5P21372 849 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W UGA4P32837 571 aa6.58□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W ECM2P38241 364 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W LYS5P50113 272 aa6.58□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W ORC1P54784 914 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W SYT1Q06836 1226 aa6.58□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W KAR2P16474 682 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W PRE9P23638 258 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W MCM5P29496 775 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W ALD3P54114 506 aa6.57□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W MCD1Q12158 566 aa6.57□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W CMR1Q12510 522 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W HVG1P0CE11 249 aa6.56□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W PRK1P40494 810 aa6.56□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W MON1P53129 644 aa6.56□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W ADE12P80210 433 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W ULP1Q02724 621 aa6.56□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W INP51P40559 946 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W MRPS18P42847 217 aa6.56□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W BIO5P53744 561 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W ADI1Q03677 179 aa6.56□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W PMT7Q06644 662 aa6.56□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W GLO4Q12320 285 aa6.56□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W PEP7P32609 515 aa6.55□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W AMN1P38285 549 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W VPS16Q03308 798 aa6.55□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W PIN2Q12057 282 aa6.55□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W MRP10O75012 95 aa6.55□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W NPR1P22211 790 aa6.55□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W YAF9P53930 226 aa6.55□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W MNR2P35724 969 aa6.54□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W TFA2P36145 328 aa6.54□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W CEM1P39525 442 aa6.54□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W CAF120P53836 1060 aa6.54□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W PIC2P40035 300 aa6.53□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W TY1B-DR4Q07793 1604 aa6.53□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W SOG2Q08817 791 aa6.53□□□□□ -1.36
PRD1YCL057W YJL181WP46987 611 aa6.52□□□□□ -1.37
PRD1YCL057W YDL176WQ12027 708 aa6.52□□□□□ -1.37
PRD1YCL057W PET112P33893 541 aa6.52□□□□□ -1.37
PRD1YCL057W NOG1Q02892 647 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PRD1YCL057W CLN2P20438 545 aa6.51□□□□□ -1.37
PRD1YCL057W YJR124CP47159 448 aa6.51□□□□□ -1.37
PRD1YCL057W HSL1P34244 1518 aa6.51□□□□□ -1.37
PRD1YCL057W MAD1P40957 749 aa6.5□□□□□ -1.37
PRD1YCL057W YNR065CP53751 1116 aa6.5□□□□□ -1.37
PRD1YCL057W OCA5P38738 679 aa6.5□□□□□ -1.37
PRD1YCL057W ALD6P54115 500 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PRD1YCL057W DUT1P33317 147 aa6.48□□□□□ -1.37
PRD1YCL057W GUP1P53154 560 aa6.48□□□□□ -1.37
PRD1YCL057W PDC5P16467 563 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PRD1YCL057W KNS1P32350 737 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PRD1YCL057W LSB6P42951 607 aa6.47□□□□□ -1.37
PRD1YCL057W GPM1P00950 247 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PRD1YCL057W CDC34P14682 295 aa6.47□□□□□ -1.37
PRD1YCL057W SEC23P15303 768 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PRD1YCL057W SPT6P23615 1451 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PRD1YCL057W GCR1P07261 785 aa6.46□□□□□ -1.37
PRD1YCL057W HTS1P07263 546 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
PRD1YCL057W PEX28P38848 579 aa6.46□□□□□ -1.37
PRD1YCL057W VAC8P39968 578 aa6.46□□□□□ -1.37
PRD1YCL057W JJJ3P47138 172 aa6.46□□□□□ -1.37
PRD1YCL057W RSM26P47141 266 aa6.46□□□□□ -1.37
PRD1YCL057W GNP1P48813 663 aa6.46□□□□□ -1.37
PRD1YCL057W YGL140CP53120 1219 aa6.46□□□□□ -1.37
PRD1YCL057W HEM13P11353 328 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W SQT1P35184 431 aa6.46□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W EXO5P38289 585 aa6.46□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W FET4P40988 552 aa6.46□□□□□ -1.38
PRD1YCL057W LEM3P42838 414 aa6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 68.8 ms