RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM182BQ5T319 152 aa40.28■■■■■ 4.04
CAPNS1-217ENST00000629983 TULP4Q9NRJ4 1543 aa40.27■■■■■ 4.04
CAPNS1-217ENST00000629983 WASLO00401 505 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
CAPNS1-217ENST00000629983 PRDM11Q9NQV5 511 aa40.27■■■■■ 4.04
CAPNS1-217ENST00000629983 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
CAPNS1-217ENST00000629983 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
CAPNS1-217ENST00000629983 LRP5O75197 1615 aa40.26■■■■■ 4.04
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa40.25■■■■■ 4.03
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa40.25■■■■■ 4.03
CAPNS1-217ENST00000629983 HRCP23327 699 aa40.23■■■■■ 4.03
CAPNS1-217ENST00000629983 DCAF11Q8TEB1 546 aa40.23■■■■■ 4.03
CAPNS1-217ENST00000629983 ALS2Q96Q42 1657 aa40.23■■■■■ 4.03
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.22■■■■■ 4.03
CAPNS1-217ENST00000629983 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
CAPNS1-217ENST00000629983 STRN4Q9NRL3 753 aa40.14■■■■■ 4.02
CAPNS1-217ENST00000629983 RGPD1P0DJD0 1748 aa40.13■■■■■ 4.01
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA0232Q92628 1395 aa40.12■■■■■ 4.01
CAPNS1-217ENST00000629983 CHRNA2Q15822 529 aa40.12■■■■■ 4.01
CAPNS1-217ENST00000629983 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
CAPNS1-217ENST00000629983 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa40.08■■■■■ 4.01
CAPNS1-217ENST00000629983 NUTM2GQ5VZR2 741 aa40.08■■■■■ 4.01
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa40.08■■■■■ 4.01
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CAPNS1-217ENST00000629983 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4.01
CAPNS1-217ENST00000629983 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa40.05■■■■■ 4
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM37O94972 964 aa40.05■■■■■ 4
CAPNS1-217ENST00000629983 STAC3Q96MF2 364 aa40.05■■■■■ 4
CAPNS1-217ENST00000629983 DISP2A7MBM2 1401 aa40.05■■■■■ 4
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP7BP35670 1465 aa40.05■■■■■ 4
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CAPNS1-217ENST00000629983 ITSN1Q15811 1721 aa39.98■■■■□ 3.99
CAPNS1-217ENST00000629983 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
CAPNS1-217ENST00000629983 APBA3O96018 575 aa39.97■■■■□ 3.99
CAPNS1-217ENST00000629983 PDE3BQ13370 1112 aa39.95■■■■□ 3.99
CAPNS1-217ENST00000629983 CAMKK2Q96RR4 588 aa39.95■■■■□ 3.99
CAPNS1-217ENST00000629983 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.99
CAPNS1-217ENST00000629983 ACEP12821 1306 aa39.94■■■■□ 3.98
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
CAPNS1-217ENST00000629983 SSH2Q76I76 1423 aa39.91■■■■□ 3.98
CAPNS1-217ENST00000629983 NBPF8Q3BBV2 869 aa39.91■■■■□ 3.98
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC61Q9Y6R9 512 aa39.9■■■■□ 3.98
CAPNS1-217ENST00000629983 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP39.89■■■■□ 3.98
CAPNS1-217ENST00000629983 ABTB2Q8N961 1025 aa39.89■■■■□ 3.98
CAPNS1-217ENST00000629983 PARD3Q8TEW0 1356 aa39.87■■■■□ 3.97
CAPNS1-217ENST00000629983 BARGINQ6ZT62 677 aa39.87■■■■□ 3.97
CAPNS1-217ENST00000629983 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP39.86■■■■□ 3.97
CAPNS1-217ENST00000629983 TCP11L2Q8N4U5 519 aa39.84■■■■□ 3.97
CAPNS1-217ENST00000629983 PLEKHG3A1L390 1219 aa39.82■■■■□ 3.97
CAPNS1-217ENST00000629983 NRKQ7Z2Y5 1582 aa39.8■■■■□ 3.96
CAPNS1-217ENST00000629983 NBPF14Q5TI25 921 aa39.8■■■■□ 3.96
CAPNS1-217ENST00000629983 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa39.79■■■■□ 3.96
CAPNS1-217ENST00000629983 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa39.79■■■■□ 3.96
CAPNS1-217ENST00000629983 CPDO75976 1380 aa39.78■■■■□ 3.96
CAPNS1-217ENST00000629983 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP39.78■■■■□ 3.96
CAPNS1-217ENST00000629983 USP19O94966 1318 aa39.77■■■■□ 3.96
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB7CA1YPR0 619 aa39.77■■■■□ 3.96
CAPNS1-217ENST00000629983 NLRP13Q86W25 1043 aa39.77■■■■□ 3.96
CAPNS1-217ENST00000629983 GCP02774 474 aa39.73■■■■□ 3.95
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CAPNS1-217ENST00000629983 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa39.72■■■■□ 3.95
CAPNS1-217ENST00000629983 NBPF1Q3BBV0 1214 aa39.69■■■■□ 3.94
CAPNS1-217ENST00000629983 LMO7Q8WWI1 1683 aa39.68■■■■□ 3.94
CAPNS1-217ENST00000629983 CABP2Q9NPB3 220 aa39.68■■■■□ 3.94
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
CAPNS1-217ENST00000629983 RREB1Q92766 1687 aa39.67■■■■□ 3.94
CAPNS1-217ENST00000629983 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
CAPNS1-217ENST00000629983 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP39.65■■■■□ 3.94
CAPNS1-217ENST00000629983 NUP188Q5SRE5 1749 aa39.64■■■■□ 3.94
CAPNS1-217ENST00000629983 CRB1P82279 1406 aa39.62■■■■□ 3.93
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa39.62■■■■□ 3.93
CAPNS1-217ENST00000629983 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP39.61■■■■□ 3.93
CAPNS1-217ENST00000629983 NLRP6P59044 892 aa39.61■■■■□ 3.93
CAPNS1-217ENST00000629983 SPON1Q9HCB6 807 aa39.6■■■■□ 3.93
CAPNS1-217ENST00000629983 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa39.59■■■■□ 3.93
CAPNS1-217ENST00000629983 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa39.59■■■■□ 3.93
CAPNS1-217ENST00000629983 OVOS2Q6IE36 1432 aa39.59■■■■□ 3.93
CAPNS1-217ENST00000629983 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP39.58■■■■□ 3.93
CAPNS1-217ENST00000629983 YY1P25490 414 aa39.57■■■■□ 3.93
CAPNS1-217ENST00000629983 CABP1Q9NZU7 370 aa39.56■■■■□ 3.92
CAPNS1-217ENST00000629983 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP39.55■■■■□ 3.92
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CAPNS1-217ENST00000629983 KCNQ2O43526 872 aa39.54■■■■□ 3.92
CAPNS1-217ENST00000629983 DDB1Q16531 1140 aa39.54■■■■□ 3.92
CAPNS1-217ENST00000629983 AATKQ6ZMQ8 1374 aa39.53■■■■□ 3.92
CAPNS1-217ENST00000629983 USP6P35125 1406 aa39.53■■■■□ 3.92
CAPNS1-217ENST00000629983 DCAF8L1A6NGE4 600 aa39.52■■■■□ 3.92
CAPNS1-217ENST00000629983 SLIT3O75094 1523 aa39.45■■■■□ 3.91
CAPNS1-217ENST00000629983 PLSCR1O15162 318 aa39.44■■■■□ 3.9
CAPNS1-217ENST00000629983 QRICH2Q9H0J4 1663 aa39.44■■■■□ 3.9
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC37A3O60309 1634 aa39.43■■■■□ 3.9
CAPNS1-217ENST00000629983 NINLQ9Y2I6 1382 aa39.43■■■■□ 3.9
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR17Q8IZU2 1322 aa39.42■■■■□ 3.9
CAPNS1-217ENST00000629983 SOX12O15370 315 aa39.42■■■■□ 3.9
CAPNS1-217ENST00000629983 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP39.42■■■■□ 3.9
CAPNS1-217ENST00000629983 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP39.42■■■■□ 3.9
CAPNS1-217ENST00000629983 PEAK1Q9H792 1746 aa39.41■■■■□ 3.9
CAPNS1-217ENST00000629983 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa39.41■■■■□ 3.9
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