RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		9.72	□□□□□ -0.85
LETMD1-238	ENST00000623495	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	9.72	□□□□□ -0.85
LETMD1-238	ENST00000623495	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		9.71	□□□□□ -0.86
LETMD1-238	ENST00000623495	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		9.71	□□□□□ -0.86
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	9.71	□□□□□ -0.86
LETMD1-238	ENST00000623495	PANK3	Q9H999	370 aa		9.71	□□□□□ -0.86
LETMD1-238	ENST00000623495	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		9.71	□□□□□ -0.86
LETMD1-238	ENST00000623495	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		9.7	□□□□□ -0.86
LETMD1-238	ENST00000623495	PPL	O60437	1756 aa		9.7	□□□□□ -0.86
LETMD1-238	ENST00000623495	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		9.7	□□□□□ -0.86
LETMD1-238	ENST00000623495	NEFL	P07196	543 aa		9.69	□□□□□ -0.86
LETMD1-238	ENST00000623495	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		9.69	□□□□□ -0.86
LETMD1-238	ENST00000623495	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		9.69	□□□□□ -0.86
LETMD1-238	ENST00000623495	CPS1	P31327	1500 aa		9.69	□□□□□ -0.86
LETMD1-238	ENST00000623495	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		9.69	□□□□□ -0.86
LETMD1-238	ENST00000623495	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		9.69	□□□□□ -0.86
LETMD1-238	ENST00000623495	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	9.68	□□□□□ -0.86
LETMD1-238	ENST00000623495	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	9.68	□□□□□ -0.86
LETMD1-238	ENST00000623495	MST1R	Q04912	1400 aa		9.68	□□□□□ -0.86
LETMD1-238	ENST00000623495	ADGRB1	O14514	1584 aa		9.68	□□□□□ -0.86
LETMD1-238	ENST00000623495	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	9.68	□□□□□ -0.86
LETMD1-238	ENST00000623495	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		9.67	□□□□□ -0.86
LETMD1-238	ENST00000623495	PTCH1	Q13635	1447 aa		9.67	□□□□□ -0.86
LETMD1-238	ENST00000623495	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		9.67	□□□□□ -0.86
LETMD1-238	ENST00000623495	CDCA8	Q53HL2	280 aa		9.67	□□□□□ -0.86
LETMD1-238	ENST00000623495	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		9.67	□□□□□ -0.86
LETMD1-238	ENST00000623495	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		9.66	□□□□□ -0.86
LETMD1-238	ENST00000623495	EVA1C	P58658	441 aa		9.66	□□□□□ -0.86
LETMD1-238	ENST00000623495	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		9.66	□□□□□ -0.86
LETMD1-238	ENST00000623495	IL27	Q8NEV9	243 aa		9.66	□□□□□ -0.86
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		9.65	□□□□□ -0.86
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM182B	Q5T319	152 aa		9.65	□□□□□ -0.86
LETMD1-238	ENST00000623495	SIRT1	Q96EB6	747 aa		9.64	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	BTG4	Q9NY30	223 aa		9.64	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	AMPH	P49418	695 aa		9.63	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	COG3	Q96JB2	828 aa		9.63	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		9.63	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		9.63	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	NLRP13	Q86W25	1043 aa		9.63	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1W2PP64	1363 aa		9.63	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	DIP2A	Q14689	1571 aa		9.63	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	TECPR2	O15040	1411 aa		9.63	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	GC	P02774	474 aa		9.62	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		9.62	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		9.62	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	EP400	Q96L91	3159 aa		9.62	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	MORC1	Q86VD1	984 aa		9.62	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		9.62	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	USP21	Q9UK80	565 aa		9.62	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		9.61	□□□□□ -0.87
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LETMD1-238	ENST00000623495	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	AFF2	P51816	1311 aa		9.61	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	JCAD	Q9P266	1359 aa		9.6	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		9.6	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM83G	A6ND36	823 aa		9.6	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		9.6	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		9.6	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	9.6	□□□□□ -0.87
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LETMD1-238	ENST00000623495	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		9.6	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	KIAA0232	Q92628	1395 aa		9.6	□□□□□ -0.87
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LETMD1-238	ENST00000623495	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		9.59	□□□□□ -0.87
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP7B	P35670	1465 aa		9.59	□□□□□ -0.87
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LETMD1-238	ENST00000623495	POTEA	Q6S8J7	498 aa		9.57	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		9.57	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		9.57	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC7	Q96M83	1385 aa		9.57	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		9.57	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	9.57	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		9.57	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	NWD1	Q149M9	1564 aa		9.56	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	DCC	P43146	1447 aa		9.56	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	ZMYND15	Q9H091	742 aa		9.56	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		9.56	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	USP6	P35125	1406 aa		9.55	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	9.55	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	ILDR2	Q71H61	639 aa		9.55	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	9.55	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	9.55	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	9.54	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	LAMC1	P11047	1609 aa		9.54	□□□□□ -0.88
LETMD1-238	ENST00000623495	HMOX1	P09601	288 aa		9.54	□□□□□ -0.88

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