RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589425.5

PGS1-211, Transcript of phosphatidylglycerophosphate synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PGS1, Length 1,944 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1-211ENST00000589425 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa26.51■■□□□ 1.84
PGS1-211ENST00000589425 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.51■■□□□ 1.83
PGS1-211ENST00000589425 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.51■■□□□ 1.83
PGS1-211ENST00000589425 ORAI2Q96SN7 254 aa26.51■■□□□ 1.83
PGS1-211ENST00000589425 ATF3P18847 181 aa26.5■■□□□ 1.83
PGS1-211ENST00000589425 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
PGS1-211ENST00000589425 MTHFSP49914 203 aa26.48■■□□□ 1.83
PGS1-211ENST00000589425 DCCP43146 1447 aa26.47■■□□□ 1.83
PGS1-211ENST00000589425 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.47■■□□□ 1.83
PGS1-211ENST00000589425 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
PGS1-211ENST00000589425 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.46■■□□□ 1.83
PGS1-211ENST00000589425 MSH6P52701 1360 aa26.46■■□□□ 1.83
PGS1-211ENST00000589425 COG3Q96JB2 828 aa26.45■■□□□ 1.83
PGS1-211ENST00000589425 FBLN1P23142 703 aa26.45■■□□□ 1.82
PGS1-211ENST00000589425 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.45■■□□□ 1.82
PGS1-211ENST00000589425 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.44■■□□□ 1.82
PGS1-211ENST00000589425 MST1RQ04912 1400 aa26.44■■□□□ 1.82
PGS1-211ENST00000589425 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
PGS1-211ENST00000589425 FOXO3O43524 673 aa26.41■■□□□ 1.82
PGS1-211ENST00000589425 PSME1Q06323 249 aa26.41■■□□□ 1.82
PGS1-211ENST00000589425 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.39■■□□□ 1.82
PGS1-211ENST00000589425 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.39■■□□□ 1.82
PGS1-211ENST00000589425 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.39■■□□□ 1.82
PGS1-211ENST00000589425 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
PGS1-211ENST00000589425 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.37■■□□□ 1.81
PGS1-211ENST00000589425 POLKQ9UBT6 870 aa26.37■■□□□ 1.81
PGS1-211ENST00000589425 CFAP53Q96M91 514 aa26.36■■□□□ 1.81
PGS1-211ENST00000589425 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.35■■□□□ 1.81
PGS1-211ENST00000589425 USP31Q70CQ4 1352 aa26.35■■□□□ 1.81
PGS1-211ENST00000589425 PIK3C2AO00443 1686 aa26.34■■□□□ 1.81
PGS1-211ENST00000589425 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
PGS1-211ENST00000589425 ABTB2Q8N961 1025 aa26.34■■□□□ 1.81
PGS1-211ENST00000589425 NLRP6P59044 892 aa26.33■■□□□ 1.81
PGS1-211ENST00000589425 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.33■■□□□ 1.81
PGS1-211ENST00000589425 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.33■■□□□ 1.81
PGS1-211ENST00000589425 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.33■■□□□ 1.81
PGS1-211ENST00000589425 KIF1AQ12756 1690 aa26.32■■□□□ 1.8
PGS1-211ENST00000589425 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
PGS1-211ENST00000589425 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
PGS1-211ENST00000589425 INSRP06213 1382 aa26.31■■□□□ 1.8
PGS1-211ENST00000589425 PNPLA6Q8IY17 1366 aa26.31■■□□□ 1.8
PGS1-211ENST00000589425 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
PGS1-211ENST00000589425 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.31■■□□□ 1.8
PGS1-211ENST00000589425 SLAIN2Q9P270 581 aa26.3■■□□□ 1.8
PGS1-211ENST00000589425 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
PGS1-211ENST00000589425 SHPRHQ149N8 1683 aa26.29■■□□□ 1.8
PGS1-211ENST00000589425 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
PGS1-211ENST00000589425 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
PGS1-211ENST00000589425 SOX12O15370 315 aa26.27■■□□□ 1.8
PGS1-211ENST00000589425 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.27■■□□□ 1.8
PGS1-211ENST00000589425 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
PGS1-211ENST00000589425 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.27■■□□□ 1.8
PGS1-211ENST00000589425 BRINP3Q76B58 766 aa26.26■■□□□ 1.79
PGS1-211ENST00000589425 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
PGS1-211ENST00000589425 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
PGS1-211ENST00000589425 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
PGS1-211ENST00000589425 USP54Q70EL1 1684 aa26.23■■□□□ 1.79
PGS1-211ENST00000589425 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
PGS1-211ENST00000589425 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.22■■□□□ 1.79
PGS1-211ENST00000589425 NPHP3Q7Z494 1330 aa26.22■■□□□ 1.79
PGS1-211ENST00000589425 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
PGS1-211ENST00000589425 NUDCQ9Y266 331 aa26.21■■□□□ 1.79
PGS1-211ENST00000589425 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.2■■□□□ 1.79
PGS1-211ENST00000589425 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.2■■□□□ 1.78
PGS1-211ENST00000589425 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
PGS1-211ENST00000589425 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.2■■□□□ 1.78
PGS1-211ENST00000589425 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
PGS1-211ENST00000589425 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
PGS1-211ENST00000589425 PXDNQ92626 1479 aa26.16■■□□□ 1.78
PGS1-211ENST00000589425 IL13P35225 146 aa26.16■■□□□ 1.78
PGS1-211ENST00000589425 SBNO1A3KN83 1393 aa26.16■■□□□ 1.78
PGS1-211ENST00000589425 PEAK1Q9H792 1746 aa26.16■■□□□ 1.78
PGS1-211ENST00000589425 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.15■■□□□ 1.78
PGS1-211ENST00000589425 ALS2Q96Q42 1657 aa26.14■■□□□ 1.77
PGS1-211ENST00000589425 APAF1O14727 1248 aa26.13■■□□□ 1.77
PGS1-211ENST00000589425 PLEKHG5O94827 1062 aa26.13■■□□□ 1.77
PGS1-211ENST00000589425 AMPHP49418 695 aa26.12■■□□□ 1.77
PGS1-211ENST00000589425 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.12■■□□□ 1.77
PGS1-211ENST00000589425 RUNDC1Q96C34 613 aa26.12■■□□□ 1.77
PGS1-211ENST00000589425 GCP02774 474 aa26.12■■□□□ 1.77
PGS1-211ENST00000589425 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PGS1-211ENST00000589425 USP19O94966 1318 aa26.11■■□□□ 1.77
PGS1-211ENST00000589425 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.11■■□□□ 1.77
PGS1-211ENST00000589425 NFAT5O94916 1531 aa26.1■■□□□ 1.77
PGS1-211ENST00000589425 FLT4P35916 1363 aa26.1■■□□□ 1.77
PGS1-211ENST00000589425 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
PGS1-211ENST00000589425 SLIT3O75094 1523 aa26.09■■□□□ 1.77
PGS1-211ENST00000589425 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.09■■□□□ 1.77
PGS1-211ENST00000589425 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.08■■□□□ 1.77
PGS1-211ENST00000589425 HOXC9P31274 260 aa26.07■■□□□ 1.76
PGS1-211ENST00000589425 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.07■■□□□ 1.76
PGS1-211ENST00000589425 FCHSD2O94868 740 aa26.06■■□□□ 1.76
PGS1-211ENST00000589425 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.06■■□□□ 1.76
PGS1-211ENST00000589425 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
PGS1-211ENST00000589425 HMOX1P09601 288 aa26.05■■□□□ 1.76
PGS1-211ENST00000589425 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.04■■□□□ 1.76
PGS1-211ENST00000589425 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.04■■□□□ 1.76
PGS1-211ENST00000589425 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.03■■□□□ 1.76
PGS1-211ENST00000589425 LTN1O94822 1766 aa26.03■■□□□ 1.76
PGS1-211ENST00000589425 ARHGEF10O15013 1369 aa26.03■■□□□ 1.76
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