RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1-207ENST00000572043 UNC5CLQ8IV45 518 aa25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1-207ENST00000572043 CABP1Q9NZU7 370 aa25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-207ENST00000572043 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLIT2O94813 1529 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM83GA6ND36 823 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-207ENST00000572043 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-207ENST00000572043 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-207ENST00000572043 ALS2Q96Q42 1657 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-207ENST00000572043 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-207ENST00000572043 ABCA3Q99758 1704 aa25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-207ENST00000572043 ABTB2Q8N961 1025 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-207ENST00000572043 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-207ENST00000572043 BTG4Q9NY30 223 aa25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRDM11Q9NQV5 511 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1-207ENST00000572043 CHRNA2Q15822 529 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1-207ENST00000572043 VPS72Q15906 364 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1-207ENST00000572043 KIAA0232Q92628 1395 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1-207ENST00000572043 USP6P35125 1406 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-207ENST00000572043 PLCH1Q4KWH8 1693 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1-207ENST00000572043 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-207ENST00000572043 GLI3P10071 1580 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-207ENST00000572043 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-207ENST00000572043 NLRP13Q86W25 1043 aa25.14■■□□□ 1.62
CTDNEP1-207ENST00000572043 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.14■■□□□ 1.61
CTDNEP1-207ENST00000572043 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-207ENST00000572043 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-207ENST00000572043 NLRP6P59044 892 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMC1Q8TDI8 760 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-207ENST00000572043 A0A0G2JS52 829 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZBTB7CA1YPR0 619 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-207ENST00000572043 MYT1Q01538 1121 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-207ENST00000572043 SEPT12Q8IYM1 358 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-207ENST00000572043 STRN4Q9NRL3 753 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-207ENST00000572043 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-207ENST00000572043 USP19O94966 1318 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-207ENST00000572043 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-207ENST00000572043 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-207ENST00000572043 NWD2Q9ULI1 1742 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-207ENST00000572043 GCP02774 474 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CTDNEP1-207ENST00000572043 SSH2Q76I76 1423 aa25.08■■□□□ 1.61
CTDNEP1-207ENST00000572043 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa25.08■■□□□ 1.6
CTDNEP1-207ENST00000572043 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CTDNEP1-207ENST00000572043 NRKQ7Z2Y5 1582 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDNEP1-207ENST00000572043 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDNEP1-207ENST00000572043 TESK2Q96S53 571 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-207ENST00000572043 NRAPQ86VF7 1730 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-207ENST00000572043 SOX12O15370 315 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-207ENST00000572043 EVA1CP58658 441 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-207ENST00000572043 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-207ENST00000572043 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-207ENST00000572043 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-207ENST00000572043 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-207ENST00000572043 USP47Q96K76 1375 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-207ENST00000572043 CPDO75976 1380 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-207ENST00000572043 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-207ENST00000572043 USP35Q9P2H5 1018 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-207ENST00000572043 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-207ENST00000572043 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-207ENST00000572043 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-207ENST00000572043 PIK3C2AO00443 1686 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-207ENST00000572043 KRT27Q7Z3Y8 459 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-207ENST00000572043 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-207ENST00000572043 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-207ENST00000572043 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-207ENST00000572043 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLIT3O75094 1523 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-207ENST00000572043 NME9Q86XW9 330 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-207ENST00000572043 AKAP12Q02952 1782 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-207ENST00000572043 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-207ENST00000572043 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-207ENST00000572043 A0A1W2PP64 1363 aa24.95■■□□□ 1.59
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMF1P82094 1093 aa24.95■■□□□ 1.58
CTDNEP1-207ENST00000572043 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC24A1O60721 1099 aa24.93■■□□□ 1.58
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM182BQ5T319 152 aa24.93■■□□□ 1.58
CTDNEP1-207ENST00000572043 LMO7Q8WWI1 1683 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-207ENST00000572043 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-207ENST00000572043 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDNEP1-207ENST00000572043 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1-207ENST00000572043 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1-207ENST00000572043 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1-207ENST00000572043 BRWD3Q6RI45 1802 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDNEP1-207ENST00000572043 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCDC125Q86Z20 511 aa24.89■■□□□ 1.58
CTDNEP1-207ENST00000572043 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.89■■□□□ 1.58
CTDNEP1-207ENST00000572043 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDNEP1-207ENST00000572043 USP31Q70CQ4 1352 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDNEP1-207ENST00000572043 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-207ENST00000572043 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-207ENST00000572043 BARGINQ6ZT62 677 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-207ENST00000572043 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-207ENST00000572043 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.85■■□□□ 1.57
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