RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560359.1

GABPB1-AS1-204, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene GABPB1-AS1, Length 709 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 POLR3GLQ9BT43 218 aa33.34■■■□□ 2.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TERF2IPQ9NYB0 399 aa33.33■■■□□ 2.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 A0A1W2PP64 1363 aa33.33■■■□□ 2.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP33.32■■■□□ 2.92
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ARHGEF10O15013 1369 aa33.32■■■□□ 2.92
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SSH2Q76I76 1423 aa33.31■■■□□ 2.92
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa33.31■■■□□ 2.92
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KIF7Q2M1P5 1343 aa33.29■■■□□ 2.92
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa33.29■■■□□ 2.92
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LMOD2Q6P5Q4 547 aa33.28■■■□□ 2.92
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ABCA3Q99758 1704 aa33.25■■■□□ 2.91
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PIK3C2AO00443 1686 aa33.24■■■□□ 2.91
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa33.24■■■□□ 2.91
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa33.22■■■□□ 2.91
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TTC21AQ8NDW8 1320 aa33.22■■■□□ 2.91
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LRP6O75581 1613 aa33.2■■■□□ 2.91
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ABTB2Q8N961 1025 aa33.2■■■□□ 2.91
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP33.17■■■□□ 2.9
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP33.17■■■□□ 2.9
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP33.16■■■□□ 2.9
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NUTM2GQ5VZR2 741 aa33.15■■■□□ 2.9
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 USP54Q70EL1 1684 aa33.15■■■□□ 2.9
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP33.14■■■□□ 2.9
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CABLES1Q8TDN4 633 aa33.13■■■□□ 2.89
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NSD3Q9BZ95 1437 aa33.12■■■□□ 2.89
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KIF20BQ96Q89 1820 aa33.12■■■□□ 2.89
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PLEKHG5O94827 1062 aa33.12■■■□□ 2.89
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NLRP13Q86W25 1043 aa33.12■■■□□ 2.89
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 USP19O94966 1318 aa33.11■■■□□ 2.89
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CARD14Q9BXL6 1004 aa33.11■■■□□ 2.89
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP33.1■■■□□ 2.89
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NLRP6P59044 892 aa33.1■■■□□ 2.89
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PANK3Q9H999 370 aa33.1■■■□□ 2.89
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NME9Q86XW9 330 aa33.09■■■□□ 2.89
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 USP31Q70CQ4 1352 aa33.09■■■□□ 2.89
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLIT3O75094 1523 aa33.08■■■□□ 2.89
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.88
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 OVOS2Q6IE36 1432 aa33.03■■■□□ 2.88
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZRANB1Q9UGI0 708 aa33.03■■■□□ 2.88
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GGNBP2Q9H3C7 697 aa32.96■■■□□ 2.87
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NGLY1Q96IV0 654 aa32.92■■■□□ 2.86
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PRDM11Q9NQV5 511 aa32.9■■■□□ 2.86
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NSD2O96028 1365 aa32.9■■■□□ 2.86
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NWD2Q9ULI1 1742 aa32.9■■■□□ 2.86
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 AFF2P51816 1311 aa32.89■■■□□ 2.86
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LTN1O94822 1766 aa32.88■■■□□ 2.85
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLIT2O94813 1529 aa32.88■■■□□ 2.85
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FAM83GA6ND36 823 aa32.88■■■□□ 2.85
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP32.87■■■□□ 2.85
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LMO7Q8WWI1 1683 aa32.85■■■□□ 2.85
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 COL18A1P39060 1754 aa32.83■■■□□ 2.85
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CHRNA2Q15822 529 aa32.83■■■□□ 2.85
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ARHGEF25Q86VW2 580 aa32.83■■■□□ 2.85
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZBTB7CA1YPR0 619 aa32.82■■■□□ 2.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ABCC6O95255 1503 aa32.82■■■□□ 2.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP32.81■■■□□ 2.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP32.81■■■□□ 2.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BCL9LQ86UU0 1499 aa32.8■■■□□ 2.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 USP21Q9UK80 565 aa32.8■■■□□ 2.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 AATKQ6ZMQ8 1374 aa32.8■■■□□ 2.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa32.79■■■□□ 2.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BTG4Q9NY30 223 aa32.78■■■□□ 2.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP32.77■■■□□ 2.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa32.77■■■□□ 2.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RGPD5Q99666 1765 aa32.76■■■□□ 2.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 UNC5CLQ8IV45 518 aa32.76■■■□□ 2.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP32.74■■■□□ 2.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FBLN1P23142 703 aa32.74■■■□□ 2.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MORC1Q86VD1 984 aa32.74■■■□□ 2.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MAP3K19Q56UN5 1328 aa32.73■■■□□ 2.83
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