RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560359.1

GABPB1-AS1-204, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene GABPB1-AS1, Length 709 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 POLR3GLQ9BT43 218 aa33.34■■■□□ 2.93
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 A0A1W2PP64 1363 aa33.33■■■□□ 2.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP33.32■■■□□ 2.92
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ARHGEF10O15013 1369 aa33.32■■■□□ 2.92
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SSH2Q76I76 1423 aa33.31■■■□□ 2.92
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa33.31■■■□□ 2.92
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa33.29■■■□□ 2.92
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LRP6O75581 1613 aa33.2■■■□□ 2.91
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ABTB2Q8N961 1025 aa33.2■■■□□ 2.91
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP33.17■■■□□ 2.9
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP33.17■■■□□ 2.9
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP33.16■■■□□ 2.9
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 USP54Q70EL1 1684 aa33.15■■■□□ 2.9
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP33.14■■■□□ 2.9
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CABLES1Q8TDN4 633 aa33.13■■■□□ 2.89
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KIF20BQ96Q89 1820 aa33.12■■■□□ 2.89
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PLEKHG5O94827 1062 aa33.12■■■□□ 2.89
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NLRP13Q86W25 1043 aa33.12■■■□□ 2.89
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NLRP6P59044 892 aa33.1■■■□□ 2.89
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NME9Q86XW9 330 aa33.09■■■□□ 2.89
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 OVOS2Q6IE36 1432 aa33.03■■■□□ 2.88
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CHRNA2Q15822 529 aa32.83■■■□□ 2.85
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ABCC6O95255 1503 aa32.82■■■□□ 2.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP32.81■■■□□ 2.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP32.81■■■□□ 2.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BCL9LQ86UU0 1499 aa32.8■■■□□ 2.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 USP21Q9UK80 565 aa32.8■■■□□ 2.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 AATKQ6ZMQ8 1374 aa32.8■■■□□ 2.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa32.79■■■□□ 2.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BTG4Q9NY30 223 aa32.78■■■□□ 2.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP32.77■■■□□ 2.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa32.77■■■□□ 2.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RGPD5Q99666 1765 aa32.76■■■□□ 2.84
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 UNC5CLQ8IV45 518 aa32.76■■■□□ 2.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP32.74■■■□□ 2.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FBLN1P23142 703 aa32.74■■■□□ 2.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MORC1Q86VD1 984 aa32.74■■■□□ 2.83
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MAP3K19Q56UN5 1328 aa32.73■■■□□ 2.83
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