RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551124.5

IKZF4-211, Transcript of IKAROS family zinc finger 4, human

TSL 1 (best)

Gene IKZF4, Length 4,396 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IKZF4-211	ENST00000551124	SLC4A3	P48751	1232 aa		11.77	□□□□□ -0.52
IKZF4-211	ENST00000551124	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		11.77	□□□□□ -0.52
IKZF4-211	ENST00000551124	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		11.77	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		11.77	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		11.76	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		11.76	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		11.76	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		11.76	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		11.75	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	CEP89	Q96ST8	783 aa		11.75	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		11.75	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		11.75	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	FSD1	Q9BTV5	496 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		11.74	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	SIL1	Q9H173	461 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	ARHGEF11	O15085	1522 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	PTMS	P20962	102 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		11.73	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	BTBD11	A6QL63	1104 aa		11.72	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	PDE4A	P27815	886 aa		11.72	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		11.72	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		11.72	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		11.72	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		11.72	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	ATP2B2	Q01814	1243 aa		11.72	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	11.72	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		11.72	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	STARD3NL	O95772	234 aa		11.71	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	FOSB	P53539	338 aa		11.71	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		11.71	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		11.71	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		11.71	□□□□□ -0.53
IKZF4-211	ENST00000551124	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		11.71	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		11.71	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	ADGRL1	O94910	1474 aa		11.7	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	HSPA2	P54652	639 aa		11.7	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	11.7	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		11.7	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	GRIN2A	Q12879	1464 aa		11.7	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	BECN2	A8MW95	431 aa		11.7	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		11.7	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		11.7	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	KDM4A	O75164	1064 aa		11.7	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	GNAI2	P04899	355 aa		11.7	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	NME9	Q86XW9	330 aa		11.7	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	EXOC5	O00471	708 aa		11.69	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	TOM1	O60784	492 aa		11.69	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		11.69	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		11.69	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		11.69	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	ATP2B1	P20020	1258 aa		11.68	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	GSE1	Q14687	1217 aa		11.68	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		11.68	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	CHRNA2	Q15822	529 aa		11.68	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		11.68	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	DAPK1	P53355	1430 aa		11.68	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	ZPR1	O75312	459 aa		11.67	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	FCHSD2	O94868	740 aa		11.67	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	TPM3	P06753	285 aa		11.67	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	CNTROB	Q8N137	903 aa		11.67	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		11.67	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		11.67	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	BICD2	Q8TD16	824 aa		11.67	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	IQGAP2	Q13576	1575 aa		11.66	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		11.66	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		11.66	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	MCM10	Q7L590	875 aa		11.66	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		11.66	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	PHF14	O94880	888 aa		11.66	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	DCTN1	Q14203	1278 aa		11.66	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	11.66	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
IKZF4-211	ENST00000551124	SRGAP3	O43295	1099 aa		11.65	□□□□□ -0.54

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10 ms