RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550991.5

PPP1CC-206, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, human

TSL 2 BASIC

Gene PPP1CC, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CC-206	ENST00000550991	SSH2	Q76I76	1423 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PPP1CC-206	ENST00000550991	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	32.18	■■■□□ 2.74
PPP1CC-206	ENST00000550991	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PPP1CC-206	ENST00000550991	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PPP1CC-206	ENST00000550991	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
PPP1CC-206	ENST00000550991	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
PPP1CC-206	ENST00000550991	PHLPP1	O60346	1717 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PPP1CC-206	ENST00000550991	SBNO1	A3KN83	1393 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PPP1CC-206	ENST00000550991	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PPP1CC-206	ENST00000550991	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PPP1CC-206	ENST00000550991	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PPP1CC-206	ENST00000550991	NME9	Q86XW9	330 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PPP1CC-206	ENST00000550991	ABTB2	Q8N961	1025 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PPP1CC-206	ENST00000550991	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PPP1CC-206	ENST00000550991	FYB1	O15117	783 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PPP1CC-206	ENST00000550991	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
PPP1CC-206	ENST00000550991	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PPP1CC-206	ENST00000550991	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
PPP1CC-206	ENST00000550991	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PPP1CC-206	ENST00000550991	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
PPP1CC-206	ENST00000550991	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
PPP1CC-206	ENST00000550991	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PPP1CC-206	ENST00000550991	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PPP1CC-206	ENST00000550991	PIK3C2A	O00443	1686 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PPP1CC-206	ENST00000550991	ALS2	Q96Q42	1657 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PPP1CC-206	ENST00000550991	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PPP1CC-206	ENST00000550991	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
PPP1CC-206	ENST00000550991	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PPP1CC-206	ENST00000550991	HSPA1L	P34931	641 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PPP1CC-206	ENST00000550991	NLRP6	P59044	892 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PPP1CC-206	ENST00000550991	PLEKHG5	O94827	1062 aa		32.01	■■■□□ 2.72
PPP1CC-206	ENST00000550991	ARHGEF10	O15013	1369 aa		32.01	■■■□□ 2.72
PPP1CC-206	ENST00000550991	NSD2	O96028	1365 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PPP1CC-206	ENST00000550991	NLRP13	Q86W25	1043 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PPP1CC-206	ENST00000550991	COG3	Q96JB2	828 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PPP1CC-206	ENST00000550991	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PPP1CC-206	ENST00000550991	USP31	Q70CQ4	1352 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PPP1CC-206	ENST00000550991	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	31.95	■■■□□ 2.71
PPP1CC-206	ENST00000550991	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		31.95	■■■□□ 2.7
PPP1CC-206	ENST00000550991	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		31.95	■■■□□ 2.7
PPP1CC-206	ENST00000550991	MORC1	Q86VD1	984 aa		31.93	■■■□□ 2.7
PPP1CC-206	ENST00000550991	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		31.93	■■■□□ 2.7
PPP1CC-206	ENST00000550991	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		31.93	■■■□□ 2.7
PPP1CC-206	ENST00000550991	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
PPP1CC-206	ENST00000550991	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PPP1CC-206	ENST00000550991	SOX12	O15370	315 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PPP1CC-206	ENST00000550991	USP54	Q70EL1	1684 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PPP1CC-206	ENST00000550991	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	31.9	■■■□□ 2.7
PPP1CC-206	ENST00000550991	USP19	O94966	1318 aa		31.89	■■■□□ 2.7
PPP1CC-206	ENST00000550991	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	31.89	■■■□□ 2.7
PPP1CC-206	ENST00000550991	JCAD	Q9P266	1359 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PPP1CC-206	ENST00000550991	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	31.86	■■■□□ 2.69
PPP1CC-206	ENST00000550991	ANP32C	O43423	234 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PPP1CC-206	ENST00000550991	GC	P02774	474 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PPP1CC-206	ENST00000550991	FBLN1	P23142	703 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PPP1CC-206	ENST00000550991	SHPRH	Q149N8	1683 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PPP1CC-206	ENST00000550991	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
PPP1CC-206	ENST00000550991	SLIT3	O75094	1523 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PPP1CC-206	ENST00000550991	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PPP1CC-206	ENST00000550991	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
PPP1CC-206	ENST00000550991	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PPP1CC-206	ENST00000550991	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
PPP1CC-206	ENST00000550991	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PPP1CC-206	ENST00000550991	RALBP1	Q15311	655 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PPP1CC-206	ENST00000550991	ABCA3	Q99758	1704 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PPP1CC-206	ENST00000550991	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
PPP1CC-206	ENST00000550991	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
PPP1CC-206	ENST00000550991	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
PPP1CC-206	ENST00000550991	NFAT5	O94916	1531 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PPP1CC-206	ENST00000550991	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
PPP1CC-206	ENST00000550991	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
PPP1CC-206	ENST00000550991	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PPP1CC-206	ENST00000550991	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PPP1CC-206	ENST00000550991	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PPP1CC-206	ENST00000550991	PPP2R1A	P30153	589 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PPP1CC-206	ENST00000550991	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67
PPP1CC-206	ENST00000550991	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		31.72	■■■□□ 2.67
PPP1CC-206	ENST00000550991	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	31.72	■■■□□ 2.67
PPP1CC-206	ENST00000550991	POLK	Q9UBT6	870 aa		31.72	■■■□□ 2.67
PPP1CC-206	ENST00000550991	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		31.72	■■■□□ 2.67
PPP1CC-206	ENST00000550991	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		31.71	■■■□□ 2.67
PPP1CC-206	ENST00000550991	KIAA0232	Q92628	1395 aa		31.7	■■■□□ 2.67
PPP1CC-206	ENST00000550991	ADAMTS2	O95450	1211 aa		31.7	■■■□□ 2.67
PPP1CC-206	ENST00000550991	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	31.7	■■■□□ 2.66
PPP1CC-206	ENST00000550991	LTN1	O94822	1766 aa		31.69	■■■□□ 2.66
PPP1CC-206	ENST00000550991	MTHFS	P49914	203 aa		31.68	■■■□□ 2.66
PPP1CC-206	ENST00000550991	CPD	O75976	1380 aa		31.68	■■■□□ 2.66
PPP1CC-206	ENST00000550991	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PPP1CC-206	ENST00000550991	AMPH	P49418	695 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PPP1CC-206	ENST00000550991	CHRNA2	Q15822	529 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PPP1CC-206	ENST00000550991	LRP6	O75581	1613 aa		31.65	■■■□□ 2.66
PPP1CC-206	ENST00000550991	FAM83G	A6ND36	823 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PPP1CC-206	ENST00000550991	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	31.63	■■■□□ 2.65
PPP1CC-206	ENST00000550991	MIER1	Q8N108	512 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PPP1CC-206	ENST00000550991	PEAK1	Q9H792	1746 aa		31.62	■■■□□ 2.65
PPP1CC-206	ENST00000550991	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	31.62	■■■□□ 2.65
PPP1CC-206	ENST00000550991	HOXC9	P31274	260 aa		31.61	■■■□□ 2.65
PPP1CC-206	ENST00000550991	IP6K1	Q92551	441 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PPP1CC-206	ENST00000550991	FLT4	P35916	1363 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PPP1CC-206	ENST00000550991	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	31.59	■■■□□ 2.65

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