RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
CS-220ENST00000550700 CD163L1Q9NR16 1453 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-220ENST00000550700 NPHP3Q7Z494 1330 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-220ENST00000550700 NUTM2FA1L443 756 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-220ENST00000550700 ANP32CO43423 234 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-220ENST00000550700 CERKQ8TCT0 537 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-220ENST00000550700 USP6P35125 1406 aa12.71□□□□□ -0.38
CS-220ENST00000550700 KIF20BQ96Q89 1820 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-220ENST00000550700 RALBP1Q15311 655 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-220ENST00000550700 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-220ENST00000550700 NSD3Q9BZ95 1437 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-220ENST00000550700 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-220ENST00000550700 ORAI2Q96SN7 254 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-220ENST00000550700 CARD14Q9BXL6 1004 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-220ENST00000550700 BRINP3Q76B58 766 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-220ENST00000550700 NRKQ7Z2Y5 1582 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-220ENST00000550700 SBNO1A3KN83 1393 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-220ENST00000550700 NHSL1Q5SYE7 1610 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-220ENST00000550700 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-220ENST00000550700 SSH2Q76I76 1423 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-220ENST00000550700 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
CS-220ENST00000550700 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-220ENST00000550700 UBAP1LF5GYI3 381 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-220ENST00000550700 FOXO3O43524 673 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-220ENST00000550700 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
CS-220ENST00000550700 KRT28Q7Z3Y7 464 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-220ENST00000550700 USP54Q70EL1 1684 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-220ENST00000550700 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
CS-220ENST00000550700 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
CS-220ENST00000550700 ARHGEF10O15013 1369 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-220ENST00000550700 USP31Q70CQ4 1352 aa12.64□□□□□ -0.39
CS-220ENST00000550700 FYB1O15117 783 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-220ENST00000550700 NLRP13Q86W25 1043 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-220ENST00000550700 COG3Q96JB2 828 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-220ENST00000550700 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
CS-220ENST00000550700 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
CS-220ENST00000550700 PXDNQ92626 1479 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-220ENST00000550700 PARD3Q8TEW0 1356 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-220ENST00000550700 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
CS-220ENST00000550700 MORC1Q86VD1 984 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-220ENST00000550700 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP12.62□□□□□ -0.39
CS-220ENST00000550700 ABTB2Q8N961 1025 aa12.62□□□□□ -0.39
CS-220ENST00000550700 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
CS-220ENST00000550700 KCNH5Q8NCM2 988 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-220ENST00000550700 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
CS-220ENST00000550700 ALS2Q96Q42 1657 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-220ENST00000550700 TNS3Q68CZ2 1445 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-220ENST00000550700 PIK3C2AO00443 1686 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-220ENST00000550700 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-220ENST00000550700 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
CS-220ENST00000550700 CCER2I3L3R5 266 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-220ENST00000550700 NLRP6P59044 892 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-220ENST00000550700 PHLPP1O60346 1717 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-220ENST00000550700 AATKQ6ZMQ8 1374 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-220ENST00000550700 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-220ENST00000550700 OVOS2Q6IE36 1432 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-220ENST00000550700 NME9Q86XW9 330 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-220ENST00000550700 GGNBP2Q9H3C7 697 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-220ENST00000550700 KIF24Q5T7B8 1368 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-220ENST00000550700 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-220ENST00000550700 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-220ENST00000550700 PIP4K2BP78356 416 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-220ENST00000550700 LMOD2Q6P5Q4 547 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-220ENST00000550700 CFAP53Q96M91 514 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-220ENST00000550700 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-220ENST00000550700 SLIT3O75094 1523 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-220ENST00000550700 PPP2R1AP30153 589 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-220ENST00000550700 USP19O94966 1318 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-220ENST00000550700 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
CS-220ENST00000550700 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
CS-220ENST00000550700 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
CS-220ENST00000550700 MIER1Q8N108 512 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-220ENST00000550700 ABCC6O95255 1503 aa12.52□□□□□ -0.4
CS-220ENST00000550700 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.4
CS-220ENST00000550700 SHPRHQ149N8 1683 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 GCP02774 474 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 RTL1A6NKG5 1358 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 INSRP06213 1382 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 LTN1O94822 1766 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 JCADQ9P266 1359 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 NFAT5O94916 1531 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 CPDO75976 1380 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 FLT4P35916 1363 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 MTHFSP49914 203 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 NUTM2GQ5VZR2 741 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 MRS2Q9HD23 443 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 POLKQ9UBT6 870 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 ZRANB1Q9UGI0 708 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 NUDCQ9Y266 331 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 PNPLA6Q8IY17 1366 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 AMPHP49418 695 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-220ENST00000550700 ABCA3Q99758 1704 aa12.48□□□□□ -0.41
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