RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 NME9Q86XW9 330 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-216ENST00000549221 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP11.17□□□□□ -0.62
CS-216ENST00000549221 MIER1Q8N108 512 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-216ENST00000549221 ZRANB1Q9UGI0 708 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-216ENST00000549221 KNSTRNQ9Y448 316 aa11.17□□□□□ -0.62
CS-216ENST00000549221 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
CS-216ENST00000549221 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa11.16□□□□□ -0.62
CS-216ENST00000549221 FYB1O15117 783 aa11.16□□□□□ -0.62
CS-216ENST00000549221 PXDNQ92626 1479 aa11.16□□□□□ -0.62
CS-216ENST00000549221 KIF20BQ96Q89 1820 aa11.16□□□□□ -0.62
CS-216ENST00000549221 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa11.16□□□□□ -0.62
CS-216ENST00000549221 PIK3C2AO00443 1686 aa11.15□□□□□ -0.62
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CS-216ENST00000549221 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
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CS-216ENST00000549221 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
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CS-216ENST00000549221 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
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CS-216ENST00000549221 KRT28Q7Z3Y7 464 aa11.13□□□□□ -0.63
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CS-216ENST00000549221 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
CS-216ENST00000549221 TTC21AQ8NDW8 1320 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-216ENST00000549221 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
CS-216ENST00000549221 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
CS-216ENST00000549221 PIP4K2BP78356 416 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-216ENST00000549221 NUTM2GQ5VZR2 741 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-216ENST00000549221 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
CS-216ENST00000549221 USP54Q70EL1 1684 aa11.11□□□□□ -0.63
CS-216ENST00000549221 TOM1O60784 492 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-216ENST00000549221 FBLN1P23142 703 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-216ENST00000549221 CCDC184Q52MB2 194 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-216ENST00000549221 SBNO1A3KN83 1393 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-216ENST00000549221 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
CS-216ENST00000549221 USP31Q70CQ4 1352 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-216ENST00000549221 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
CS-216ENST00000549221 TNS3Q68CZ2 1445 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-216ENST00000549221 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
CS-216ENST00000549221 RALBP1Q15311 655 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-216ENST00000549221 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa11.09□□□□□ -0.63
CS-216ENST00000549221 PPP2R1AP30153 589 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-216ENST00000549221 MORC1Q86VD1 984 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-216ENST00000549221 ABTB2Q8N961 1025 aa11.08□□□□□ -0.64
CS-216ENST00000549221 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
CS-216ENST00000549221 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
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CS-216ENST00000549221 COG3Q96JB2 828 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-216ENST00000549221 USP19O94966 1318 aa11.07□□□□□ -0.64
CS-216ENST00000549221 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-216ENST00000549221 SLIT3O75094 1523 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-216ENST00000549221 NFAT5O94916 1531 aa11.06□□□□□ -0.64
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CS-216ENST00000549221 PHLPP1O60346 1717 aa11.06□□□□□ -0.64
CS-216ENST00000549221 SOX12O15370 315 aa11.05□□□□□ -0.64
CS-216ENST00000549221 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CS-216ENST00000549221 PEAK1Q9H792 1746 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-216ENST00000549221 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
CS-216ENST00000549221 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
CS-216ENST00000549221 NLRP13Q86W25 1043 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-216ENST00000549221 CABLES1Q8TDN4 633 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-216ENST00000549221 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-216ENST00000549221 ABCA3Q99758 1704 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-216ENST00000549221 ARHGEF10O15013 1369 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-216ENST00000549221 AATKQ6ZMQ8 1374 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-216ENST00000549221 CCER2I3L3R5 266 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-216ENST00000549221 POLKQ9UBT6 870 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-216ENST00000549221 PNPLA6Q8IY17 1366 aa11.03□□□□□ -0.64
CS-216ENST00000549221 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
CS-216ENST00000549221 MTHFSP49914 203 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-216ENST00000549221 MAP3K19Q56UN5 1328 aa11.02□□□□□ -0.65
CS-216ENST00000549221 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
CS-216ENST00000549221 GCP02774 474 aa11.01□□□□□ -0.65
CS-216ENST00000549221 MRS2Q9HD23 443 aa11.01□□□□□ -0.65
CS-216ENST00000549221 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CS-216ENST00000549221 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
CS-216ENST00000549221 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CS-216ENST00000549221 LTN1O94822 1766 aa11□□□□□ -0.65
CS-216ENST00000549221 SHPRHQ149N8 1683 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-216ENST00000549221 POTEAQ6S8J7 498 aa10.99□□□□□ -0.65
CS-216ENST00000549221 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
CS-216ENST00000549221 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
CS-216ENST00000549221 ARHGEF25Q86VW2 580 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-216ENST00000549221 KCNH5Q8NCM2 988 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-216ENST00000549221 INSRP06213 1382 aa10.98□□□□□ -0.65
CS-216ENST00000549221 HOXC9P31274 260 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-216ENST00000549221 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-216ENST00000549221 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
CS-216ENST00000549221 KIAA0232Q92628 1395 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-216ENST00000549221 COL18A1P39060 1754 aa10.97□□□□□ -0.65
CS-216ENST00000549221 CPDO75976 1380 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-216ENST00000549221 FLT4P35916 1363 aa10.96□□□□□ -0.65
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