RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546585.1

CS-203, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,803 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-203ENST00000546585 CDCA7LQ96GN5 454 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 NPM3O75607 178 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 KCNA6P17658 529 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 MORC1Q86VD1 984 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 USP54Q70EL1 1684 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 MTHFSP49914 203 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 PDE3BQ13370 1112 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 GGNBP2Q9H3C7 697 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 TERF2IPQ9NYB0 399 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 HSPA2P54652 639 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 DMRT2Q9Y5R5 561 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 CCDC61Q9Y6R9 512 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 PEAK1Q9H792 1746 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 PLEKHG3A1L390 1219 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 DUSP27Q5VZP5 1158 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 OVOS2Q6IE36 1432 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 ANKARQ7Z5J8 1434 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 PIK3C2AO00443 1686 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 CCDC146Q8IYE0 955 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-203ENST00000546585 APAF1O14727 1248 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP9.21□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 ERICH6BQ5W0A0 696 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 FBXO41Q8TF61 875 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 ZRANB1Q9UGI0 708 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 USP6P35125 1406 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 RGPD1P0DJD0 1748 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 AATKQ6ZMQ8 1374 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 FBLN1P23142 703 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 PLEKHF1Q96S99 279 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 SLFN5Q08AF3 891 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 NME9Q86XW9 330 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 POLKQ9UBT6 870 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 LRRC7Q96NW7 1537 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 DLG5Q8TDM6 1919 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 USP31Q70CQ4 1352 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 ACEP12821 1306 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 DCCP43146 1447 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 KIF1AQ12756 1690 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 MSH5O43196 834 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 NEFLP07196 543 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 RRP1P56182 461 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP9.17□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 WWC1Q8IX03 1113 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 NGEFQ8N5V2 710 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 RUNDC1Q96C34 613 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 RCAN3Q9UKA8 241 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 CCDC27Q2M243 656 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 TCP11L2Q8N4U5 519 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 GOLGA2Q08379 1002 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-203ENST00000546585 C19orf44Q9H6X5 657 aa9.15□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 PPP4R2Q9NY27 417 aa9.15□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 TMEM94Q12767 1356 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 IL13P35225 146 aa9.14□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 NUTM2FA1L443 756 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 CFAP53Q96M91 514 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 RSPH6AQ9H0K4 717 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 TRIM35Q9UPQ4 493 aa9.13□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 C14orf37Q86TY3 774 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP9.12□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 TTC21AQ8NDW8 1320 aa9.12□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 MST1RQ04912 1400 aa9.11□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 C1orf167Q5SNV9 1468 aa9.11□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 E9PSI1 815 aa9.11□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 MSH6P52701 1360 aa9.11□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 NFAT5O94916 1531 aa9.11□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 LTN1O94822 1766 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 TMPOP42166 694 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 C20orf194Q5TEA3 1177 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 WDR63Q8IWG1 891 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 PHF8Q9UPP1 1060 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 ALS2Q96Q42 1657 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-203ENST00000546585 PLIN1O60240 522 aa9.1□□□□□ -0.95
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