RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543175.4

PTRH1-208, Transcript of peptidyl-tRNA hydrolase 1 homolog, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTRH1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTRH1-208	ENST00000543175	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		34.17	■■■■□ 3.06
PTRH1-208	ENST00000543175	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	34.16	■■■■□ 3.06
PTRH1-208	ENST00000543175	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	34.15	■■■■□ 3.06
PTRH1-208	ENST00000543175	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	34.15	■■■■□ 3.06
PTRH1-208	ENST00000543175	VPS72	Q15906	364 aa		34.15	■■■■□ 3.06
PTRH1-208	ENST00000543175	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	34.14	■■■■□ 3.06
PTRH1-208	ENST00000543175	FAM83G	A6ND36	823 aa		34.14	■■■■□ 3.06
PTRH1-208	ENST00000543175	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		34.13	■■■■□ 3.05
PTRH1-208	ENST00000543175	ACE	P12821	1306 aa		34.09	■■■■□ 3.05
PTRH1-208	ENST00000543175	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		34.08	■■■■□ 3.05
PTRH1-208	ENST00000543175	NEUROD1	Q13562	356 aa		34.08	■■■■□ 3.05
PTRH1-208	ENST00000543175	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	34.08	■■■■□ 3.05
PTRH1-208	ENST00000543175	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	34.05	■■■■□ 3.04
PTRH1-208	ENST00000543175	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		34.05	■■■■□ 3.04
PTRH1-208	ENST00000543175	BTG4	Q9NY30	223 aa		34.05	■■■■□ 3.04
PTRH1-208	ENST00000543175	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		34.04	■■■■□ 3.04
PTRH1-208	ENST00000543175	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		34.02	■■■■□ 3.04
PTRH1-208	ENST00000543175	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	34.01	■■■■□ 3.03
PTRH1-208	ENST00000543175	CABP2	Q9NPB3	220 aa		34.01	■■■■□ 3.03
PTRH1-208	ENST00000543175	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		34	■■■■□ 3.03
PTRH1-208	ENST00000543175	CCDC125	Q86Z20	511 aa		34	■■■■□ 3.03
PTRH1-208	ENST00000543175	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	33.99	■■■■□ 3.03
PTRH1-208	ENST00000543175	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		33.99	■■■■□ 3.03
PTRH1-208	ENST00000543175	EP400	Q96L91	3159 aa		33.98	■■■■□ 3.03
PTRH1-208	ENST00000543175	KIAA0232	Q92628	1395 aa		33.98	■■■■□ 3.03
PTRH1-208	ENST00000543175	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		33.96	■■■■□ 3.03
PTRH1-208	ENST00000543175	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	33.93	■■■■□ 3.02
PTRH1-208	ENST00000543175	ABTB2	Q8N961	1025 aa		33.92	■■■■□ 3.02
PTRH1-208	ENST00000543175	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	33.92	■■■■□ 3.02
PTRH1-208	ENST00000543175	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		33.91	■■■■□ 3.02
PTRH1-208	ENST00000543175	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		33.91	■■■■□ 3.02
PTRH1-208	ENST00000543175	EVC2	Q86UK5	1308 aa		33.91	■■■■□ 3.02
PTRH1-208	ENST00000543175	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		33.91	■■■■□ 3.02
PTRH1-208	ENST00000543175	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	33.9	■■■■□ 3.02
PTRH1-208	ENST00000543175	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		33.9	■■■■□ 3.02
PTRH1-208	ENST00000543175	USP19	O94966	1318 aa		33.89	■■■■□ 3.02
PTRH1-208	ENST00000543175		A0A0G2JS52	829 aa		33.89	■■■■□ 3.02
PTRH1-208	ENST00000543175	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	33.89	■■■■□ 3.02
PTRH1-208	ENST00000543175	MYT1	Q01538	1121 aa		33.89	■■■■□ 3.02
PTRH1-208	ENST00000543175	CHRNA2	Q15822	529 aa		33.89	■■■■□ 3.02
PTRH1-208	ENST00000543175	USP6	P35125	1406 aa		33.88	■■■■□ 3.01
PTRH1-208	ENST00000543175	AKAP12	Q02952	1782 aa		33.88	■■■■□ 3.01
PTRH1-208	ENST00000543175	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		33.88	■■■■□ 3.01
PTRH1-208	ENST00000543175	CABP1	Q9NZU7	370 aa		33.88	■■■■□ 3.01
PTRH1-208	ENST00000543175	NLRP13	Q86W25	1043 aa		33.85	■■■■□ 3.01
PTRH1-208	ENST00000543175	PIK3C2A	O00443	1686 aa		33.84	■■■■□ 3.01
PTRH1-208	ENST00000543175	CPD	O75976	1380 aa		33.84	■■■■□ 3.01
PTRH1-208	ENST00000543175	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		33.82	■■■■□ 3
PTRH1-208	ENST00000543175	TONSL	Q96HA7	1378 aa		33.82	■■■■□ 3
PTRH1-208	ENST00000543175	STRN4	Q9NRL3	753 aa		33.81	■■■■□ 3
PTRH1-208	ENST00000543175	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		33.8	■■■■□ 3
PTRH1-208	ENST00000543175	SSH2	Q76I76	1423 aa		33.8	■■■■□ 3
PTRH1-208	ENST00000543175	SLIT3	O75094	1523 aa		33.79	■■■■□ 3
PTRH1-208	ENST00000543175	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		33.79	■■■■□ 3
PTRH1-208	ENST00000543175	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		33.78	■■■■□ 3
PTRH1-208	ENST00000543175	GC	P02774	474 aa		33.77	■■■■□ 3
PTRH1-208	ENST00000543175	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	33.77	■■■■□ 3
PTRH1-208	ENST00000543175	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	33.77	■■■■□ 3
PTRH1-208	ENST00000543175	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		33.76	■■■□□ 2.99
PTRH1-208	ENST00000543175	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		33.75	■■■□□ 2.99
PTRH1-208	ENST00000543175	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		33.75	■■■□□ 2.99
PTRH1-208	ENST00000543175	EVA1C	P58658	441 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PTRH1-208	ENST00000543175	NLRP6	P59044	892 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PTRH1-208	ENST00000543175	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PTRH1-208	ENST00000543175	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	33.71	■■■□□ 2.99
PTRH1-208	ENST00000543175	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	33.7	■■■□□ 2.99
PTRH1-208	ENST00000543175	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	33.7	■■■□□ 2.98
PTRH1-208	ENST00000543175	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	33.7	■■■□□ 2.98
PTRH1-208	ENST00000543175	COL18A1	P39060	1754 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PTRH1-208	ENST00000543175	USP35	Q9P2H5	1018 aa		33.68	■■■□□ 2.98
PTRH1-208	ENST00000543175	FAM182B	Q5T319	152 aa		33.67	■■■□□ 2.98
PTRH1-208	ENST00000543175	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	33.67	■■■□□ 2.98
PTRH1-208	ENST00000543175	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		33.67	■■■□□ 2.98
PTRH1-208	ENST00000543175	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		33.66	■■■□□ 2.98
PTRH1-208	ENST00000543175	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	33.65	■■■□□ 2.98
PTRH1-208	ENST00000543175	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		33.64	■■■□□ 2.98
PTRH1-208	ENST00000543175	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	33.64	■■■□□ 2.98
PTRH1-208	ENST00000543175	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		33.64	■■■□□ 2.98
PTRH1-208	ENST00000543175	BAG6	P46379	1132 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PTRH1-208	ENST00000543175	RGPD5	Q99666	1765 aa		33.62	■■■□□ 2.97
PTRH1-208	ENST00000543175	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		33.62	■■■□□ 2.97
PTRH1-208	ENST00000543175	USP54	Q70EL1	1684 aa		33.61	■■■□□ 2.97
PTRH1-208	ENST00000543175	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		33.61	■■■□□ 2.97
PTRH1-208	ENST00000543175	CRB1	P82279	1406 aa		33.61	■■■□□ 2.97
PTRH1-208	ENST00000543175	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		33.6	■■■□□ 2.97
PTRH1-208	ENST00000543175	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	33.59	■■■□□ 2.97
PTRH1-208	ENST00000543175	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		33.58	■■■□□ 2.97
PTRH1-208	ENST00000543175	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PTRH1-208	ENST00000543175	NFAT5	O94916	1531 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PTRH1-208	ENST00000543175	DISP2	A7MBM2	1401 aa		33.55	■■■□□ 2.96
PTRH1-208	ENST00000543175	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		33.55	■■■□□ 2.96
PTRH1-208	ENST00000543175	PDE3B	Q13370	1112 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PTRH1-208	ENST00000543175	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		33.52	■■■□□ 2.96
PTRH1-208	ENST00000543175	LRRC37A3	O60309	1634 aa		33.52	■■■□□ 2.96
PTRH1-208	ENST00000543175	ABCC6	O95255	1503 aa		33.5	■■■□□ 2.95
PTRH1-208	ENST00000543175	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
PTRH1-208	ENST00000543175	TMC1	Q8TDI8	760 aa		33.5	■■■□□ 2.95
PTRH1-208	ENST00000543175	LTN1	O94822	1766 aa		33.49	■■■□□ 2.95
PTRH1-208	ENST00000543175	SOX12	O15370	315 aa		33.49	■■■□□ 2.95
PTRH1-208	ENST00000543175	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	33.49	■■■□□ 2.95

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