RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533507.5

NDUFS3-211, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3, humanhuman

TSL 2

Gene NDUFS3, Length 1,769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS3-211ENST00000533507 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
NDUFS3-211ENST00000533507 BRINP3Q76B58 766 aa35.94■■■■□ 3.34
NDUFS3-211ENST00000533507 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
NDUFS3-211ENST00000533507 KIF1AQ12756 1690 aa35.93■■■■□ 3.34
NDUFS3-211ENST00000533507 PARD3Q8TEW0 1356 aa35.93■■■■□ 3.34
NDUFS3-211ENST00000533507 NSD2O96028 1365 aa35.91■■■■□ 3.34
NDUFS3-211ENST00000533507 KRT28Q7Z3Y7 464 aa35.91■■■■□ 3.34
NDUFS3-211ENST00000533507 ZRANB1Q9UGI0 708 aa35.9■■■■□ 3.34
NDUFS3-211ENST00000533507 KIF20BQ96Q89 1820 aa35.89■■■■□ 3.34
NDUFS3-211ENST00000533507 TTC21AQ8NDW8 1320 aa35.88■■■■□ 3.33
NDUFS3-211ENST00000533507 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
NDUFS3-211ENST00000533507 NPHP3Q7Z494 1330 aa35.87■■■■□ 3.33
NDUFS3-211ENST00000533507 NRKQ7Z2Y5 1582 aa35.87■■■■□ 3.33
NDUFS3-211ENST00000533507 ABTB2Q8N961 1025 aa35.87■■■■□ 3.33
NDUFS3-211ENST00000533507 COG3Q96JB2 828 aa35.87■■■■□ 3.33
NDUFS3-211ENST00000533507 SSH2Q76I76 1423 aa35.86■■■■□ 3.33
NDUFS3-211ENST00000533507 LMOD2Q6P5Q4 547 aa35.86■■■■□ 3.33
NDUFS3-211ENST00000533507 NUTM2GQ5VZR2 741 aa35.85■■■■□ 3.33
NDUFS3-211ENST00000533507 TOM1O60784 492 aa35.84■■■■□ 3.33
NDUFS3-211ENST00000533507 CCER2I3L3R5 266 aa35.83■■■■□ 3.33
NDUFS3-211ENST00000533507 CERKQ8TCT0 537 aa35.82■■■■□ 3.33
NDUFS3-211ENST00000533507 NLRP6P59044 892 aa35.81■■■■□ 3.32
NDUFS3-211ENST00000533507 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
NDUFS3-211ENST00000533507 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
NDUFS3-211ENST00000533507 PPP2R1AP30153 589 aa35.81■■■■□ 3.32
NDUFS3-211ENST00000533507 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.8■■■■□ 3.32
NDUFS3-211ENST00000533507 PIP4K2BP78356 416 aa35.8■■■■□ 3.32
NDUFS3-211ENST00000533507 PLEKHG5O94827 1062 aa35.79■■■■□ 3.32
NDUFS3-211ENST00000533507 MRS2Q9HD23 443 aa35.79■■■■□ 3.32
NDUFS3-211ENST00000533507 CCDC184Q52MB2 194 aa35.78■■■■□ 3.32
NDUFS3-211ENST00000533507 NLRP13Q86W25 1043 aa35.77■■■■□ 3.32
NDUFS3-211ENST00000533507 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa35.76■■■■□ 3.32
NDUFS3-211ENST00000533507 SOX12O15370 315 aa35.76■■■■□ 3.31
NDUFS3-211ENST00000533507 FBLN1P23142 703 aa35.73■■■■□ 3.31
NDUFS3-211ENST00000533507 PIK3C2AO00443 1686 aa35.72■■■■□ 3.31
NDUFS3-211ENST00000533507 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa35.72■■■■□ 3.31
NDUFS3-211ENST00000533507 PXDNQ92626 1479 aa35.68■■■■□ 3.3
NDUFS3-211ENST00000533507 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
NDUFS3-211ENST00000533507 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa35.68■■■■□ 3.3
NDUFS3-211ENST00000533507 OVOS2Q6IE36 1432 aa35.68■■■■□ 3.3
NDUFS3-211ENST00000533507 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.68■■■■□ 3.3
NDUFS3-211ENST00000533507 USP31Q70CQ4 1352 aa35.67■■■■□ 3.3
NDUFS3-211ENST00000533507 SBNO1A3KN83 1393 aa35.67■■■■□ 3.3
NDUFS3-211ENST00000533507 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
NDUFS3-211ENST00000533507 MTHFSP49914 203 aa35.66■■■■□ 3.3
NDUFS3-211ENST00000533507 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
NDUFS3-211ENST00000533507 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa35.63■■■■□ 3.29
NDUFS3-211ENST00000533507 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
NDUFS3-211ENST00000533507 TNS3Q68CZ2 1445 aa35.62■■■■□ 3.29
NDUFS3-211ENST00000533507 NHSL1Q5SYE7 1610 aa35.61■■■■□ 3.29
NDUFS3-211ENST00000533507 FAM9BQ8IZU0 186 aa35.59■■■■□ 3.29
NDUFS3-211ENST00000533507 POLKQ9UBT6 870 aa35.59■■■■□ 3.29
NDUFS3-211ENST00000533507 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa35.58■■■■□ 3.29
NDUFS3-211ENST00000533507 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.29
NDUFS3-211ENST00000533507 CFAP53Q96M91 514 aa35.57■■■■□ 3.28
NDUFS3-211ENST00000533507 ALS2Q96Q42 1657 aa35.57■■■■□ 3.28
NDUFS3-211ENST00000533507 ARHGEF10O15013 1369 aa35.56■■■■□ 3.28
NDUFS3-211ENST00000533507 AATKQ6ZMQ8 1374 aa35.56■■■■□ 3.28
NDUFS3-211ENST00000533507 ZBTB7CA1YPR0 619 aa35.55■■■■□ 3.28
NDUFS3-211ENST00000533507 KCNH5Q8NCM2 988 aa35.55■■■■□ 3.28
NDUFS3-211ENST00000533507 CABLES1Q8TDN4 633 aa35.53■■■■□ 3.28
NDUFS3-211ENST00000533507 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
NDUFS3-211ENST00000533507 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
NDUFS3-211ENST00000533507 GCP02774 474 aa35.52■■■■□ 3.28
NDUFS3-211ENST00000533507 USP54Q70EL1 1684 aa35.5■■■■□ 3.27
NDUFS3-211ENST00000533507 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
NDUFS3-211ENST00000533507 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
NDUFS3-211ENST00000533507 AMPHP49418 695 aa35.48■■■■□ 3.27
NDUFS3-211ENST00000533507 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
NDUFS3-211ENST00000533507 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
NDUFS3-211ENST00000533507 USP19O94966 1318 aa35.48■■■■□ 3.27
NDUFS3-211ENST00000533507 MAP3K19Q56UN5 1328 aa35.48■■■■□ 3.27
NDUFS3-211ENST00000533507 PHLPP1O60346 1717 aa35.48■■■■□ 3.27
NDUFS3-211ENST00000533507 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP35.46■■■■□ 3.27
NDUFS3-211ENST00000533507 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
NDUFS3-211ENST00000533507 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
NDUFS3-211ENST00000533507 SLIT3O75094 1523 aa35.42■■■■□ 3.26
NDUFS3-211ENST00000533507 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
NDUFS3-211ENST00000533507 NFAT5O94916 1531 aa35.39■■■■□ 3.26
NDUFS3-211ENST00000533507 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
NDUFS3-211ENST00000533507 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa35.38■■■■□ 3.25
NDUFS3-211ENST00000533507 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
NDUFS3-211ENST00000533507 NUDCQ9Y266 331 aa35.38■■■■□ 3.25
NDUFS3-211ENST00000533507 PNPLA6Q8IY17 1366 aa35.37■■■■□ 3.25
NDUFS3-211ENST00000533507 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
NDUFS3-211ENST00000533507 FLT4P35916 1363 aa35.36■■■■□ 3.25
NDUFS3-211ENST00000533507 ARHGEF25Q86VW2 580 aa35.36■■■■□ 3.25
NDUFS3-211ENST00000533507 ADAMTS8Q9UP79 889 aa35.36■■■■□ 3.25
NDUFS3-211ENST00000533507 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
NDUFS3-211ENST00000533507 LTN1O94822 1766 aa35.35■■■■□ 3.25
NDUFS3-211ENST00000533507 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
NDUFS3-211ENST00000533507 HOXC9P31274 260 aa35.35■■■■□ 3.25
NDUFS3-211ENST00000533507 PEAK1Q9H792 1746 aa35.34■■■■□ 3.25
NDUFS3-211ENST00000533507 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
NDUFS3-211ENST00000533507 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP35.32■■■■□ 3.24
NDUFS3-211ENST00000533507 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
NDUFS3-211ENST00000533507 INSRP06213 1382 aa35.31■■■■□ 3.24
NDUFS3-211ENST00000533507 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
NDUFS3-211ENST00000533507 IP6K1Q92551 441 aa35.3■■■■□ 3.24
NDUFS3-211ENST00000533507 KIF24Q5T7B8 1368 aa35.29■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 142.8 ms