RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
PTPRK-218ENST00000525459 HSPA1LP34931 641 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRK-218ENST00000525459 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
PTPRK-218ENST00000525459 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.89■■□□□ 1.73
PTPRK-218ENST00000525459 ARHGEF10O15013 1369 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRK-218ENST00000525459 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRK-218ENST00000525459 USP54Q70EL1 1684 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRK-218ENST00000525459 SSH2Q76I76 1423 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRK-218ENST00000525459 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRK-218ENST00000525459 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
PTPRK-218ENST00000525459 JCADQ9P266 1359 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRK-218ENST00000525459 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRK-218ENST00000525459 PIK3C2AO00443 1686 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRK-218ENST00000525459 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
PTPRK-218ENST00000525459 ABCA3Q99758 1704 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRK-218ENST00000525459 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRK-218ENST00000525459 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRK-218ENST00000525459 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
PTPRK-218ENST00000525459 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRK-218ENST00000525459 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
PTPRK-218ENST00000525459 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRK-218ENST00000525459 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
PTPRK-218ENST00000525459 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
PTPRK-218ENST00000525459 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRK-218ENST00000525459 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
PTPRK-218ENST00000525459 ABTB2Q8N961 1025 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRK-218ENST00000525459 PANK3Q9H999 370 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRK-218ENST00000525459 LMOD2Q6P5Q4 547 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRK-218ENST00000525459 USP31Q70CQ4 1352 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRK-218ENST00000525459 NLRP13Q86W25 1043 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRK-218ENST00000525459 SLIT3O75094 1523 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRK-218ENST00000525459 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRK-218ENST00000525459 NSD2O96028 1365 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRK-218ENST00000525459 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.71
PTPRK-218ENST00000525459 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRK-218ENST00000525459 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRK-218ENST00000525459 OVOS2Q6IE36 1432 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRK-218ENST00000525459 USP19O94966 1318 aa25.69■■□□□ 1.7
PTPRK-218ENST00000525459 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRK-218ENST00000525459 NLRP6P59044 892 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRK-218ENST00000525459 NME9Q86XW9 330 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRK-218ENST00000525459 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
PTPRK-218ENST00000525459 COG3Q96JB2 828 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRK-218ENST00000525459 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRK-218ENST00000525459 LTN1O94822 1766 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRK-218ENST00000525459 FYB1O15117 783 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRK-218ENST00000525459 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRK-218ENST00000525459 LRP6O75581 1613 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRK-218ENST00000525459 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
PTPRK-218ENST00000525459 NUTM2GQ5VZR2 741 aa25.61■■□□□ 1.69
PTPRK-218ENST00000525459 NFAT5O94916 1531 aa25.61■■□□□ 1.69
PTPRK-218ENST00000525459 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
PTPRK-218ENST00000525459 ABCC6O95255 1503 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRK-218ENST00000525459 NWD2Q9ULI1 1742 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRK-218ENST00000525459 PLCH1Q4KWH8 1693 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRK-218ENST00000525459 CABLES1Q8TDN4 633 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRK-218ENST00000525459 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRK-218ENST00000525459 CPDO75976 1380 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRK-218ENST00000525459 GCP02774 474 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRK-218ENST00000525459 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
PTPRK-218ENST00000525459 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
PTPRK-218ENST00000525459 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
PTPRK-218ENST00000525459 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
PTPRK-218ENST00000525459 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
PTPRK-218ENST00000525459 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
PTPRK-218ENST00000525459 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
PTPRK-218ENST00000525459 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.54■■□□□ 1.68
PTPRK-218ENST00000525459 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
PTPRK-218ENST00000525459 LMO7Q8WWI1 1683 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRK-218ENST00000525459 PLEKHG5O94827 1062 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRK-218ENST00000525459 COL18A1P39060 1754 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRK-218ENST00000525459 AATKQ6ZMQ8 1374 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRK-218ENST00000525459 KIAA0232Q92628 1395 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRK-218ENST00000525459 ADAMTS2O95450 1211 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRK-218ENST00000525459 NRAPQ86VF7 1730 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRK-218ENST00000525459 PRDM11Q9NQV5 511 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRK-218ENST00000525459 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRK-218ENST00000525459 MORC1Q86VD1 984 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRK-218ENST00000525459 RTL1A6NKG5 1358 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRK-218ENST00000525459 RGPD5Q99666 1765 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRK-218ENST00000525459 SLIT2O94813 1529 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRK-218ENST00000525459 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
PTPRK-218ENST00000525459 ARHGEF25Q86VW2 580 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRK-218ENST00000525459 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
PTPRK-218ENST00000525459 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
PTPRK-218ENST00000525459 SOX12O15370 315 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRK-218ENST00000525459 C8orf37Q96NL8 207 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRK-218ENST00000525459 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PTPRK-218ENST00000525459 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
PTPRK-218ENST00000525459 NGLY1Q96IV0 654 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRK-218ENST00000525459 PEAK1Q9H792 1746 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRK-218ENST00000525459 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
PTPRK-218ENST00000525459 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRK-218ENST00000525459 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRK-218ENST00000525459 FAM83GA6ND36 823 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRK-218ENST00000525459 FLT4P35916 1363 aa25.39■■□□□ 1.66
PTPRK-218ENST00000525459 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa25.39■■□□□ 1.66
PTPRK-218ENST00000525459 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
PTPRK-218ENST00000525459 AFF2P51816 1311 aa25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms