RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520945.5

STAU2-209, Transcript of staufen double-stranded RNA binding protein 2, human

TSL 4

Gene STAU2, Length 472 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STAU2-209	ENST00000520945	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	CCDC7	Q96M83	1385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	CLGN	O14967	610 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	TRAK2	O60296	914 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63	2e-8	■■■■□ 22.5
STAU2-209	ENST00000520945	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	NCOA1	Q15788	1441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	PDIA6	Q15084	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	UACA	Q9BZF9	1416 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	TIAM1	Q13009	1591 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	APP	P05067	770 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	SLC20A2	Q08357	652 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	DDX12P	Q92771	950 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63	7e-7	■■■□□ 17.3
STAU2-209	ENST00000520945	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	PANK2	Q9BZ23	570 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	AAAS	Q9NRG9	546 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	TMEM51	Q9NW97	253 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	KIF3A	Q9Y496	699 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	RIPK4	P57078	832 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	C8orf34	Q49A92	452 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	HSCB	Q8IWL3	235 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	ZMYM3	Q14202	1370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	MAP3K7	O43318	606 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	FAM193A	P78312	1265 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	RALBP1	Q15311	655 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	TIGD1	Q96MW7	591 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	CRBN	Q96SW2	442 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	FEZ1	Q99689	392 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	INSR	P06213	1382 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	ST8SIA5	O15466	376 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	CCDC184	Q52MB2	194 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	CTR9	Q6PD62	1173 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	ARID3A	Q99856	593 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	YY1AP1	Q9H869	796 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	KIF15	Q9NS87	1388 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	FMN1	Q68DA7	1419 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	MIA2	Q96PC5	1412 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	ERBB4	Q15303	1308 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	VGLL3	A8MV65	326 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	COL9A1	P20849	921 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	PROX2	Q3B8N5	592 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STAU2-209	ENST00000520945	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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