RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 UNC93B1Q9H1C4 597 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRK-215ENST00000498284 PNMA1Q8ND90 353 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRK-215ENST00000498284 ZMYND15Q9H091 742 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRK-215ENST00000498284 FKBPLQ9UIM3 349 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRK-215ENST00000498284 ARMC2Q8NEN0 867 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRK-215ENST00000498284 A6NJR5 290 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRK-215ENST00000498284 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRK-215ENST00000498284 GPR37L1O60883 481 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRK-215ENST00000498284 ABL2P42684 1182 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRK-215ENST00000498284 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PTPRK-215ENST00000498284 RPIAP49247 311 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRK-215ENST00000498284 NBPF14Q5TI25 921 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRK-215ENST00000498284 LIAT1Q6ZQX7 453 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRK-215ENST00000498284 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRK-215ENST00000498284 BAP1Q92560 729 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRK-215ENST00000498284 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.02□□□□□ -0.97
PTPRK-215ENST00000498284 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRK-215ENST00000498284 SLC19A1P41440 591 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-215ENST00000498284 TRIM32Q13049 653 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-215ENST00000498284 IRF5Q13568 498 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-215ENST00000498284 LINC01559Q495D7 138 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-215ENST00000498284 WWC1Q8IX03 1113 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-215ENST00000498284 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PTPRK-215ENST00000498284 PDXDC2PQ6P474 469 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-215ENST00000498284 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF511Q8NB15 262 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-215ENST00000498284 TRAK2O60296 914 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-215ENST00000498284 SH3BP2P78314 561 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-215ENST00000498284 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-215ENST00000498284 PTK2Q05397 1052 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-215ENST00000498284 WASHC4Q2M389 1173 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-215ENST00000498284 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-215ENST00000498284 FOXJ1Q92949 421 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-215ENST00000498284 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-215ENST00000498284 ZBBXA8MT70 800 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-215ENST00000498284 FBXO45P0C2W1 286 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-215ENST00000498284 WNT7BP56706 349 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-215ENST00000498284 SKOR1P84550 965 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-215ENST00000498284 NR1H3Q13133 447 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-215ENST00000498284 AGERQ15109 404 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-215ENST00000498284 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-215ENST00000498284 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-215ENST00000498284 LCE2BO14633 110 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-215ENST00000498284 VAC14Q08AM6 782 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-215ENST00000498284 SPRYD7Q5W111 196 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-215ENST00000498284 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-215ENST00000498284 V9GY48 417 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-215ENST00000498284 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-215ENST00000498284 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRK-215ENST00000498284 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRK-215ENST00000498284 Q6ZNB5 142 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRK-215ENST00000498284 ZBTB33Q86T24 672 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRK-215ENST00000498284 CARD14Q9BXL6 1004 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRK-215ENST00000498284 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRK-215ENST00000498284 ADAM32Q8TC27 787 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRK-215ENST00000498284 POM121CA8CG34 1229 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF697Q5TEC3 545 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRK-215ENST00000498284 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
PTPRK-215ENST00000498284 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP8.9□□□□□ -0.98
PTPRK-215ENST00000498284 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRK-215ENST00000498284 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRK-215ENST00000498284 WNT7AO00755 349 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRK-215ENST00000498284 ERFEQ4G0M1 354 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRK-215ENST00000498284 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRK-215ENST00000498284 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRK-215ENST00000498284 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PTPRK-215ENST00000498284 SOX11P35716 441 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRK-215ENST00000498284 FOXC1Q12948 553 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRK-215ENST00000498284 SEMA3FQ13275 785 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRK-215ENST00000498284 LAPTM4AQ15012 233 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRK-215ENST00000498284 ARID3CA6NKF2 412 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRK-215ENST00000498284 GFRA3O60609 400 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRK-215ENST00000498284 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRK-215ENST00000498284 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRK-215ENST00000498284 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRK-215ENST00000498284 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRK-215ENST00000498284 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF592Q92610 1267 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRK-215ENST00000498284 SLC10A4Q96EP9 437 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRK-215ENST00000498284 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRK-215ENST00000498284 ALG2Q9H553 416 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRK-215ENST00000498284 PKD2L1Q9P0L9 805 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRK-215ENST00000498284 SIAH2O43255 324 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRK-215ENST00000498284 GLMNQ92990 594 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRK-215ENST00000498284 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
PTPRK-215ENST00000498284 GDF9O60383 454 aa8.83□□□□□ -1
PTPRK-215ENST00000498284 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
PTPRK-215ENST00000498284 TNFRSF10AO00220 468 aa8.82□□□□□ -1
PTPRK-215ENST00000498284 ARID5BQ14865 1188 aa8.82□□□□□ -1
PTPRK-215ENST00000498284 MPNDQ8N594 471 aa8.82□□□□□ -1
PTPRK-215ENST00000498284 CDK15Q96Q40 435 aa8.82□□□□□ -1
PTPRK-215ENST00000498284 C1orf115Q9H7X2 142 aa8.82□□□□□ -1
PTPRK-215ENST00000498284 CEP126Q9P2H0 1117 aa8.82□□□□□ -1
PTPRK-215ENST00000498284 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.82□□□□□ -1
PTPRK-215ENST00000498284 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
PTPRK-215ENST00000498284 NBPF20Q3BBV1 942 aa8.81□□□□□ -1
PTPRK-215ENST00000498284 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.81□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 185.8 ms