RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC24A3Q9HC58 644 aa10.95□□□□□ -0.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC16A10Q8TF71 515 aa10.94□□□□□ -0.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AK7Q96M32 723 aa10.94□□□□□ -0.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AMHR2Q16671 573 aa10.93□□□□□ -0.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRIM66O15016 1216 aa10.92□□□□□ -0.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TIMP2P16035 220 aa10.92□□□□□ -0.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VARSP26640 1264 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NNTQ13423 1086 aa10.92□□□□□ -0.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MTMR2Q13614 643 aa10.92□□□□□ -0.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IRF7Q92985 503 aa10.92□□□□□ -0.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TPRNQ4KMQ1 711 aa10.91□□□□□ -0.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LYPD8Q6UX82 237 aa10.89□□□□□ -0.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa10.89□□□□□ -0.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa10.89□□□□□ -0.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPDYE5A6NIY4 337 aa10.88□□□□□ -0.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CFAP99D6REC4 459 aa10.88□□□□□ -0.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SOBPA7XYQ1 873 aa10.87□□□□□ -0.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 F12P00748 615 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GJA5P36382 358 aa10.87□□□□□ -0.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDK15Q96Q40 435 aa10.87□□□□□ -0.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BEGAINQ9BUH8 593 aa10.87□□□□□ -0.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLEKHG3A1L390 1219 aa10.86□□□□□ -0.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FOXJ1Q92949 421 aa10.86□□□□□ -0.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TBC1D2Q9BYX2 928 aa10.86□□□□□ -0.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WDR4P57081 412 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C4orf48Q5BLP8 95 aa10.85□□□□□ -0.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAP10Q9P2G4 905 aa10.85□□□□□ -0.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADH1CP00326 375 aa10.84□□□□□ -0.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VSIG8P0DPA2 414 aa10.84□□□□□ -0.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPTLC1O15269 473 aa10.83□□□□□ -0.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NR3C2P08235 984 aa10.83□□□□□ -0.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HRCP23327 699 aa10.82□□□□□ -0.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDE4DQ08499 809 aa10.82□□□□□ -0.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PARP9Q8IXQ6 854 aa10.82□□□□□ -0.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZFAND3Q9H8U3 227 aa10.82□□□□□ -0.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GRM5P41594 1212 aa10.81□□□□□ -0.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM174AQ8TBP5 190 aa10.81□□□□□ -0.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CTHP32929 405 aa10.8□□□□□ -0.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ITPKCQ96DU7 683 aa10.8□□□□□ -0.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM181BA6NEQ2 426 aa10.79□□□□□ -0.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CABLES1Q8TDN4 633 aa10.79□□□□□ -0.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SCARF1Q14162 830 aa10.78□□□□□ -0.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZBTB3Q9H5J0 574 aa10.76□□□□□ -0.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa10.75□□□□□ -0.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NR5A1Q13285 461 aa10.74□□□□□ -0.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARID5BQ14865 1188 aa10.74□□□□□ -0.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RIC3Q7Z5B4 369 aa10.74□□□□□ -0.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LOC100996750A0A140TA64 210 aa10.73□□□□□ -0.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa10.73□□□□□ -0.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa10.73□□□□□ -0.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LIMD1Q9UGP4 676 aa10.73□□□□□ -0.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GSK3AP49840 483 aa10.72□□□□□ -0.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DIXDC1Q155Q3 683 aa10.72□□□□□ -0.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C6orf118Q5T5N4 469 aa10.72□□□□□ -0.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MEIOBQ8N635 442 aa10.72□□□□□ -0.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPFIA3O75145 1194 aa10.71□□□□□ -0.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 QPCTQ16769 361 aa10.71□□□□□ -0.69
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa10.69□□□□□ -0.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LINC00528Q8N1L1 170 aa10.69□□□□□ -0.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DNMT3LQ9UJW3 386 aa10.69□□□□□ -0.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LILRB3O75022 631 aa10.68□□□□□ -0.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa10.68□□□□□ -0.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TUSC1Q2TAM9 212 aa10.68□□□□□ -0.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYSM1Q5VVJ2 828 aa10.68□□□□□ -0.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAN1A2O60476 641 aa10.67□□□□□ -0.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRT76Q01546 638 aa10.67□□□□□ -0.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KDM4CQ9H3R0 1056 aa10.67□□□□□ -0.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa10.67□□□□□ -0.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BMP2P12643 396 aa10.65□□□□□ -0.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FSHRP23945 695 aa10.65□□□□□ -0.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AGERQ15109 404 aa10.65□□□□□ -0.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNMA1Q12791 1236 aa10.62□□□□□ -0.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NEUROD2Q15784 382 aa10.62□□□□□ -0.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM117AQ9C073 453 aa10.61□□□□□ -0.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARMC2Q8NEN0 867 aa10.6□□□□□ -0.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TSC1Q92574 1164 aa10.6□□□□□ -0.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UPP2O95045 317 aa10.58□□□□□ -0.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ERFEQ4G0M1 354 aa10.58□□□□□ -0.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC116Q8IYX3 515 aa10.58□□□□□ -0.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CBLBQ13191 982 aa10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms