RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 CRBNQ96SW2 442 aa21.88■■□□□ 1.09
TOM1-216ENST00000492723 PTPRUQ92729 1446 aa21.86■■□□□ 1.09
TOM1-216ENST00000492723 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.86■■□□□ 1.09
TOM1-216ENST00000492723 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.86■■□□□ 1.09
TOM1-216ENST00000492723 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.86■■□□□ 1.09
TOM1-216ENST00000492723 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
TOM1-216ENST00000492723 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TOM1-216ENST00000492723 FBLN1P23142 703 aa21.85■■□□□ 1.09
TOM1-216ENST00000492723 NME9Q86XW9 330 aa21.85■■□□□ 1.09
TOM1-216ENST00000492723 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TOM1-216ENST00000492723 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TOM1-216ENST00000492723 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TOM1-216ENST00000492723 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.84■■□□□ 1.09
TOM1-216ENST00000492723 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.84■■□□□ 1.09
TOM1-216ENST00000492723 CCDC27Q2M243 656 aa21.84■■□□□ 1.09
TOM1-216ENST00000492723 TBX22Q9Y458 520 aa21.84■■□□□ 1.09
TOM1-216ENST00000492723 WDR63Q8IWG1 891 aa21.83■■□□□ 1.09
TOM1-216ENST00000492723 POLKQ9UBT6 870 aa21.83■■□□□ 1.08
TOM1-216ENST00000492723 ADGRB2O60241 1585 aa21.83■■□□□ 1.08
TOM1-216ENST00000492723 NUTM2FA1L443 756 aa21.82■■□□□ 1.08
TOM1-216ENST00000492723 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.82■■□□□ 1.08
TOM1-216ENST00000492723 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.81■■□□□ 1.08
TOM1-216ENST00000492723 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
TOM1-216ENST00000492723 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.8■■□□□ 1.08
TOM1-216ENST00000492723 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.8■■□□□ 1.08
TOM1-216ENST00000492723 BCAR3O75815 825 aa21.8■■□□□ 1.08
TOM1-216ENST00000492723 ITSN1Q15811 1721 aa21.8■■□□□ 1.08
TOM1-216ENST00000492723 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
TOM1-216ENST00000492723 COG3Q96JB2 828 aa21.79■■□□□ 1.08
TOM1-216ENST00000492723 AKAP12Q02952 1782 aa21.78■■□□□ 1.08
TOM1-216ENST00000492723 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
TOM1-216ENST00000492723 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.77■■□□□ 1.08
TOM1-216ENST00000492723 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
TOM1-216ENST00000492723 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
TOM1-216ENST00000492723 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
TOM1-216ENST00000492723 DIP2AQ14689 1571 aa21.76■■□□□ 1.07
TOM1-216ENST00000492723 ACEP12821 1306 aa21.76■■□□□ 1.07
TOM1-216ENST00000492723 PTCH1Q13635 1447 aa21.76■■□□□ 1.07
TOM1-216ENST00000492723 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
TOM1-216ENST00000492723 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.74■■□□□ 1.07
TOM1-216ENST00000492723 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.74■■□□□ 1.07
TOM1-216ENST00000492723 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa21.74■■□□□ 1.07
TOM1-216ENST00000492723 AATKQ6ZMQ8 1374 aa21.74■■□□□ 1.07
TOM1-216ENST00000492723 FCHSD2O94868 740 aa21.72■■□□□ 1.07
TOM1-216ENST00000492723 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
TOM1-216ENST00000492723 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa21.72■■□□□ 1.07
TOM1-216ENST00000492723 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.72■■□□□ 1.07
TOM1-216ENST00000492723 RIPK4P57078 832 aa21.71■■□□□ 1.07
TOM1-216ENST00000492723 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.07
TOM1-216ENST00000492723 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.7■■□□□ 1.06
TOM1-216ENST00000492723 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
TOM1-216ENST00000492723 PRKAR2BP31323 418 aa21.7■■□□□ 1.06
TOM1-216ENST00000492723 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.7■■□□□ 1.06
TOM1-216ENST00000492723 KCNA6P17658 529 aa21.69■■□□□ 1.06
TOM1-216ENST00000492723 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
TOM1-216ENST00000492723 USP6P35125 1406 aa21.69■■□□□ 1.06
TOM1-216ENST00000492723 NEFMP07197 916 aa21.68■■□□□ 1.06
TOM1-216ENST00000492723 HMOX1P09601 288 aa21.68■■□□□ 1.06
TOM1-216ENST00000492723 IL13P35225 146 aa21.68■■□□□ 1.06
TOM1-216ENST00000492723 NRKQ7Z2Y5 1582 aa21.68■■□□□ 1.06
TOM1-216ENST00000492723 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
TOM1-216ENST00000492723 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.68■■□□□ 1.06
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TOM1-216ENST00000492723 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.66■■□□□ 1.06
TOM1-216ENST00000492723 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
TOM1-216ENST00000492723 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.66■■□□□ 1.06
TOM1-216ENST00000492723 PIK3R4Q99570 1358 aa21.65■■□□□ 1.06
TOM1-216ENST00000492723 PDE3AQ14432 1141 aa21.65■■□□□ 1.06
TOM1-216ENST00000492723 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.64■■□□□ 1.06
TOM1-216ENST00000492723 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
TOM1-216ENST00000492723 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.64■■□□□ 1.05
TOM1-216ENST00000492723 IL16Q14005 1332 aa21.63■■□□□ 1.05
TOM1-216ENST00000492723 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa21.63■■□□□ 1.05
TOM1-216ENST00000492723 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.63■■□□□ 1.05
TOM1-216ENST00000492723 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.63■■□□□ 1.05
TOM1-216ENST00000492723 PANK1Q8TE04 598 aa21.62■■□□□ 1.05
TOM1-216ENST00000492723 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
TOM1-216ENST00000492723 SSH2Q76I76 1423 aa21.61■■□□□ 1.05
TOM1-216ENST00000492723 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
TOM1-216ENST00000492723 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
TOM1-216ENST00000492723 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.61■■□□□ 1.05
TOM1-216ENST00000492723 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
TOM1-216ENST00000492723 NFE2L2Q16236 605 aa21.6■■□□□ 1.05
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TOM1-216ENST00000492723 COG6Q9Y2V7 657 aa21.59■■□□□ 1.05
TOM1-216ENST00000492723 TTC21AQ8NDW8 1320 aa21.59■■□□□ 1.05
TOM1-216ENST00000492723 SOX12O15370 315 aa21.59■■□□□ 1.05
TOM1-216ENST00000492723 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
TOM1-216ENST00000492723 ANKARQ7Z5J8 1434 aa21.57■■□□□ 1.04
TOM1-216ENST00000492723 USP31Q70CQ4 1352 aa21.57■■□□□ 1.04
TOM1-216ENST00000492723 SKAP1Q86WV1 359 aa21.56■■□□□ 1.04
TOM1-216ENST00000492723 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.56■■□□□ 1.04
TOM1-216ENST00000492723 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TOM1-216ENST00000492723 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TOM1-216ENST00000492723 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.56■■□□□ 1.04
TOM1-216ENST00000492723 TNNQ9UQP3 1299 aa21.55■■□□□ 1.04
TOM1-216ENST00000492723 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TOM1-216ENST00000492723 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TOM1-216ENST00000492723 RLBP1P12271 317 aa21.53■■□□□ 1.04
TOM1-216ENST00000492723 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa21.53■■□□□ 1.04
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